色吾寺，坐落在色吾沟最高处，海拔4800米，由证士曲尼囊单主持修建，已有1000多年的历史，是藏区最大的宁玛派蓄发密咒寺，也是莲花生大师最大的修行地之一，主供佛为莲花三尊佛。
该寺已有千年历史，信奉宁玛派，曾有1个大经堂、11个殿堂，主供佛为莲花生大师。1984年，在原寺的废墟上修复了大经堂和9个殿堂，供有莲花生师徒三尊佛，还有空行母益西措杰（原为藏王墀松德赞的妃子，後拜莲花生为师，成为西藏密法史上著名的女密法大师）的修行洞。
寺内藏有16件珍品，有证士曲尼囊单从伏藏谷挖掘出的莲花生主尊三像、噶玛巴的鞋子、空行母益希嘉措的金刚杵、黑石、右旋的海螺、莲花生大师在石头上留下的右手指印等。其中寺庙西南的俱德堆宝塔，相传是从印度运到这里来的，塔内装藏著莲花生大师在石头上留下的左手指印。
寺庙北面的南棕山上则建有三个禅房和修行洞，为修行者提供宁静而虔诚的修行场所。
每年藏历12月22日至30日，该寺举行跳神和驱鬼仪式。
