深圳市蓝色海洋环境保护协会是2002年初就职于海洋世界水族馆的深圳市最早的一批潜水员自发组织成立的一个专门保护海洋的协会。2005年6月5日协会在红树林保护区管理局召开成立大会，2005年7月7日深圳市民政局正式批复协会成立，社团登记证号00603。注册地址：深圳市盐田区小梅沙海洋世界。
协会是由热心推动海洋环境保护事业的个人、团体、企业、事业单位自愿结成的社会团体；是经市民政局民间组织管理办公室核准注册登记的全市性非营利性的社团组织，是独立的社团法人。协会的业务主管单位为深圳市海洋局。
将海洋环保的意识与理念传送到社会的各个阶层；推动深圳市、广东省乃至全国沿海自然生态环境保护的管理、宣传教育、科学研究、海洋环境污染防止与治理以及国内外友好合作与交流等各项环保事业的发展，推动我国民间海洋自然环境保护工作的开展，为保护、拯救濒危、珍稀海洋生物、以及实现我国沿海海洋生物资源的可持续发展作贡献。
协会发起会员为81名个人和6家单位。经过多年发展，申请加入协会的会员和关注环保、投身海洋环保事业的志愿者越来越多。在2009年和2010年“国际海洋清洁日”活动中，来自粤港澳地区和欧美国家的潜水爱好者、深圳本地环保志愿者就有近2000人，有50多家单位参加了活动，其中包括多家户外团队、潜水俱乐部和游艇俱乐部。
一、海洋环保清洁活动。协会每年多次组织中外潜水员进行海底清洁活动以及组织市民志愿者、户外运动爱好者进行穿越海岸线，清洁山海垃圾活动，以增强市民的海洋环保意识，例如对东西冲海岸线、大小梅沙海滨进行垃圾清理。最具有影响力的活动是每年9月第三个周末举办的国际海洋清洁日活动，如今已经连续主办了六届，受到各大媒体、市民的高度关注，2009年、2010年连续两年志愿者人数都有近2000人。2010年重点主题活动还包括：协会与家乐福联合举办每月一次“2小时清洁最美海岸线”环境保护公益活动、2010年6月8日至2010年9月18日“我爱海洋”百日环保系列活动。
二、海洋科普教育活动。如在小梅沙水族馆进行现场科普活动，在社区、学校、图书馆等场所开展海洋生态、环保公益图片展览和进行专题讲座；每年在6月5日世界环境日参与环保活动和进行科普宣传等。
三、海洋生态、环保课题研究。例如，深圳市珊瑚普查、深圳市人工渔礁项目生态评估。
四、与其他单位联合举办环保公益活动。例如，协会是腾讯公益项目帕客联盟的发起单位之一，在梧桐山清理清除薇甘菊活动，与深圳市自闭症协会联合举办亲近海洋的公益活动等。
五、关注深圳市环保公众事件。如一直关注深圳市大鹏新区坝光村（原属龙岗区）的保护工作。
2021年3月1日，入选2020年度广东省学雷锋志愿服务先进典型名单（最佳志愿服务组织）。
