国家级南通大学科技园于2009年成立，由南通市政府和南通大学共同建立，园区依托南通大学的学科、科技和人才等优势条件，积极争取国家、地方政府和社会力量的大力支持，以南通大学技术转移中心为龙头，有效提高了高校科研成果的转移和转化。作为被国家科技部和教育部联合认定的国家大学科技园、苏中地区的国家级大学科技园，国家级南通大学科技园将为学校各类人才的科研成果转移和转化、创新团队凝聚和培养、高新技术企业孵化、企业与行业优质资源整合提供良好的平台。
国家级南通大学科技园拥有可自主支配面积20756平方米，入驻企业82家，注册资金1.7亿元，从业人员1368人，2013年园区实现技工贸总值超2.6亿元，利税2000万元。园区企业不断加大科研力量，自主创新能力显著提升，申报各级各类科技、人才计划项目165项，获得扶持资金共计2700余万元，累计获得各类知识产权120项。产学研相结合，有效提高了高校科研成果的转移和转化，以南通大学技术转移中心为龙头，成立了南通高校技术成果转移中心，累计发布技术成果600余项，26项技术成果对接成功，实现金额达644万元。园区内有大学生创业企业25家，注册资金862万元，共带动208名大学生创业就业，近千人次学生在园区企业实习实训。设立扶持资金，为创业企业提供资金服务，6家园区企业获得种子资金投资250万元，近40个大学生创业企业和项目获大学生创业基金扶持23.7万元。
目前，国家级南通大学科技园建立了全链条的孵化服务体系，聚合创新要素为企业创新创业提供全面支持。园区围绕产学研合作、科技成果转移转化等，形成了满足市场各项需求的科技创新公共服务平台体系。此外，还引进了知识产权代理、人力资源管理、财务审计、咨询服务等中介服务机构37家，促进专利成果的实施和产业化、规模化、市场化。截至目前，园区累计孵化企业159家，毕业企业131家，2021年通过科技型中小企业评价入库数11家，在孵企业进入“小升高”培育库5家。
