天宁寺为始建于唐朝开元十四年（公元726年）的龙兴寺，是南宁创建年代较早的佛教寺院之一，距今已有1280年的历史了。明朝洪武年间（1368-1398）改称天宁寺，并一直沿袭至今，与北京、扬州、常州、嘉兴、鹤壁、邢台、安阳、雷州、宁波等地的“天宁寺”同名，如璧互拱，遥相呼应，风采万千，真乃“山河天眼里，佛光普照中。世界法身内，光光相映空”。
明崇祯十七年(1644)再重修。
清光绪三十三年（1907年），成立“南宁商务总会”。
民国四年（1915年）改名为“南宁总商会”，清宣统元年（1909年）各商户募捐集资改造修建。
民国后，商会将原一进大厅改作礼堂，是南宁工商界人士集会、议事的场所。
民国十年（1921年）10月24日，孙中山大总统出巡抵达南宁，于27日在该礼堂作《关于广西善后方针》的演讲。
1950年南宁商会改组为南宁市工商业联合筹备委员会，为市工商业联合会办公驻所。
1979年改为兴宁区人民政府驻地。
改革开放后，政通人和，物阜民丰，在自治区政府的大力支持下，在有关部门的关心帮助下，在广大信众共同努力下，广西佛教协会得到批准在南宁市重建天宁寺。
1995年，选址南宁柳沙园艺场，由于各种原因未动工。2004年，因南宁城市规划需要，天宁寺筹建处迁出柳沙园艺场。经商南宁良凤江国家森林公园同意，2004年5月自治区宗教局批复同意天宁寺选址南宁良凤江国家森林公园。
2009年11月7日，广西佛教协会在南宁良凤江国家森林公园举行天宁寺开工典礼，天宁寺工程正式动工建设。目前大雄宝殿已基本落成，初具规模。
