明教寺为明朝院式建筑，山门建在一梯形台阶上，山门为单檐歇山式卷棚顶，粘土筒瓦，屋角发水戗，单椽，无斗拱，饰挂落。大雄宝殿为重檐歇山顶，粘土筒瓦，屋角发嫩戗，无斗拱、柱廊。大雄宝殿旁有屋上井亭、教弩亭等名胜，均为钻尖式屋顶，粘土筒瓦，嫩戗屋角，下设鹅颈椅，整座寺院轴线基本对称。
大雄宝殿由天王殿绕过三只古雅朴拙的大香炉就到达了大雄宝殿，殿门上方悬挂的泥金大匾为赵朴初先生题写，而红墙上的“南无阿弥陀佛”六个苍劲有力的大字则是弘一大师墨宝；殿内两侧是形态各异的十八罗汉塑像，正中则供奉着明教寺的镇寺之宝——五尊由北京请回的佛像。大殿左侧是清道光年间铸造的大钟，钟声悠扬清远，撞击时声音可传遍老城。大殿东面是卧佛殿，后面是地藏殿，东南角为花园，花园内有屋上井和听松阁两处古迹。
屋上井，以井口高于教弩台下民房屋脊而得名。相传该井乃是当年魏军为汲水所凿。在西晋时得到整修，井栏周围现尚有“泰始四年殿中司马夏侯胜造”隶书12字，可见此井至少已有1700多年历史。井口石栏拙朴古老，尤其是井栏口遗下的二十多道由汲水绳索长期拉磨形成绳沟。
明教寺教弩台上并无松树，因为庐州夏天炎热，士兵难熬酷暑，曹操便令广植松柏。松树长成后，清风袭来，松涛阵阵。为了纪念古人，寺僧在此建阁，从此，“教弩松阴”便成为合肥的一个著名景点，听松阁也由此得名。
乘合肥公交2、15、48、106、136、137、143、155路等公交车在逍遥津站下车后步行可达；或从李鸿章故居向东步行10分钟可达。
合肥地铁1号线 大东门站
合肥地铁2号线 大东门站
三国时期，曹操在今明教寺原址修建点将台。
南朝梁武帝年间（502-549年），明教寺初建。
隋末，明教寺毁于兵变。
唐朝大历年间，在废墟中挖得铁佛一尊，高丈八，庐州刺史裴休奏告朝廷，代宗皇帝李毅诏令重建，定名明教院。
明朝以后改称明教寺，沿用至今。
清咸丰三年（1853年）复毁于战火，同治九年（1870年）重建。太平天国将领袁宏谟于天国失败后，隐于肥西紫蓬山西庐寺，取法号通圆。明教寺是西庐寺的下院。
光绪十一年（1886年），通圆重修大雄宝殿等建筑。
民国二十六年（1937年）冬，明教寺院部分建筑被日军飞机炸毁。
民国二十八年（1939年），日军派进驻明教寺，成立新亚佛教会合肥支会。
1994年后，合肥政府有关部门多次拨款修缮明教寺。
1984年，明教寺由文物部门移交给佛教团体管理使用，作为佛教活动场所对外开放。
2013年，启动明教寺维修和教弩台加固的前期工作。
2015年，合肥市明教寺维修工程开工。
2016年10月，合肥明教寺经过封闭大修，再次迎客。
1989年6月11日，明教寺隆重举行了佛像开光暨妙安方丈升座典礼。
1994年，明教寺举行了“祈祷护国息灾法会”。
1992年11月，明教寺又举办了“祝愿社会稳定、家庭祥和”为弘旨的佛七法会。
2014年10月，安徽合肥明教寺举行皈依传戒法会。
2016年2月，明教寺举办新春祈福活动。
明教寺作为安徽名寺，历经千年，是罕见的明朝院式建筑群，见证了南朝至民国时期中国江淮佛教文化的发展变化。明教寺是西庐寺的下院，属禅宗临济派，在佛教传播史上具有重要地位。
