厦门市妇幼保健院现有编制床位数700张，职工1200余名。年门诊量150万余人次，年分娩量1.6万人次，出院4万余人次，手术量3万余人次，服务范围已辐射至厦门周边多个地区。
厦门市妇幼保健院坚持妇幼卫生工作方针，围绕“一法两纲”的核心任务，开展妇女儿童各期保健，妇女病筛查、诊断、治疗一条龙服务及儿科疾病筛查、诊断、治疗一条龙服务。医院积极引进各学科高端人才，努力加强学科建设，打造核心竞争力，形成一批在海峡西岸具有影响力的学科。医院现有7个国家及省级基地：国家住院医师规培妇产科和儿科基地、国家卫计委妇科内镜培训基地、国家级儿童早期发展示范基地、国家级儿童健康管理示范基地、福建省产前诊断培训基地、国家卫计委助听器验配师（四级）培训基地、美国儿科学会中国教育基地；8个中心：福建省新生儿救护网络分中心、福建省厦门新生儿疾病筛查分中心、福建省厦门听力筛查诊断中心、厦门市产科诊疗质控中心、厦门市产科危重症转诊救治中心、厦门市慢性妇科炎症专病防治中心、厦门市儿童自闭症早期评估干预中心、中国妇女盆底功能障碍防治项目技术培训中心；2个福建省临床重点专科：妇科、产科；1个市级领先学科：产前诊断科；3个市级重点实验室：生殖与遗传实验室、产科重大临床疾病基础与临床研究重点实验室、围产儿感染重点实验室；3个市级重点专科：产前诊断科、新生儿科、儿童神经康复科；4个市级规划重点专科：产科、小儿外科微创、儿童保健科、妇女保健科。
厦门市妇幼保健院聘请中国工程院郎景和院士为名誉院长，提升妇产科相关学科建设、人才培养、专科整体建设规划等方面水平。2019年，医院成立了2个名医工作室，即厦门市首个产科名医工作室刘兴会名医工作室和新生儿科陈超名医工作室。医院聘请5个特聘主任，儿童神经康复科聘请北京大学人民医院儿科主任秦炯教授，儿童发育行为科聘请广州中山大学附属第三医院邹小兵教授，麻醉科聘请广州市妇女儿童医疗中心麻醉科主任宋兴荣教授 ，小儿外科聘请首都医科大学附属北京儿童医院新生儿外科主任黄金狮教授，超声医学科聘请南方医科大学附属深圳市妇幼保健院超声医学科主任李胜利教授。医院与美国约翰斯•霍普金斯医院、波士顿儿童医院等多家国际著名医疗科研机构建立了长期友好合作关系，管理理念、专业技术、服务模式逐步与国际接轨进而推进我院全面发展，与国内一流医院接轨。医院近年来，获得中国与世界卫生组织合作项目、国家自然科学基金、863合作课题、省科技重点课题等国际和省市级科研课题50余项。多项省市科技进步奖。医院举办国家级和省级继续教育项目30余项。
厦门市妇幼保健院自主研发了全国领先的妇幼保健信息系统，为厦门妇女、儿童建立了覆盖整个生命周期的健康档案。医院先后获得国家卫生计生委（现国家卫健委）进一步改善医疗服务——优质服务示范医院、全国妇幼卫生工作先进单位、全国“三八红旗”集体、福建省卫生计生系统先进集体、福建省省级文明单位、党风廉政建设工作先进单位、福建省“三八红旗”集体等数十项荣誉称号。
2018年，厦门市妇幼保健院集美院区项目获批，拟建800张床位，新院区将于2023年底交付使用。今天的厦门市妇幼保健院正在“健康中国”战略的引领下，以“立德立行 至精至诚”为宗旨，努力提高广大妇女儿童健康水平，朝着建设国内顶级、与国际接轨的妇幼保健院、妇儿专科医院的目标阔步前进，妇幼人用热情和智慧继续谱写着妇幼卫生事业的崭新华章！
门诊时间：
每周一至周五全天，周六上午正常开诊。急诊科每周七日全天24小时开诊。
导诊咨询：
门诊大厅设有医院服务中心，提供预约、咨询、导诊、盖章、复印等服务。
挂号、收费、结账：
1、2、3号楼一楼大厅设有挂号收费窗口，提供挂号、收费、结账一条龙服务，门诊各楼层均设有自助多功能机。所有初次就诊的自费患者请到收费窗口办理市民健康卡（医保病人凭IC卡充值、激活）挂号就诊。
挂号时间：1、2、3号楼一楼上午7：30开始，下午14:30－17:30。
离休干部、70岁以上老人、军人、荣誉市民、残疾人就诊挂号，收费、检查、诊病优先。
体检中心设在2号楼三楼，电话：2663670。特需门诊设在3号楼二十一楼，电话：2662008。
1号楼一楼大厅和3号楼一楼大厅设有电子屏幕提供门诊各科及各科专家出诊情况和当日动态。
预约挂号及现场挂号于当日有效，挂错号可到导诊台协商换号，但已就诊、收过检查费和药费的挂号单不能退换。
医保病人凭IC卡挂号诊病、收费；IC卡不得转借或冒用。无医保卡者，请到收费窗口办理市民健康卡就诊。
候诊：
预约挂号者请提前20分钟到诊，就诊前需在自助机预约签到。若迟到20分钟，需到导诊台重新再排队。厦门市妇幼保健院实行预约优先原则，现场挂号排在预约患者后面，需耐心等候。本院实行一医一患制度，回看报告请到导诊台排看报告队列，可优先就诊。
检查：
超声检查，请到3号楼三楼；检验科、病理科设在3号楼四楼；放射影像检查，请到2号楼负一楼；骨密度检查请到1号楼四楼。
厦门市妇幼保健院的前身是创建于1959年的厦门市妇幼保健所。厦门市卫生局于1959年7月14日成立厦门市妇幼保健所，租用古城西路139号一楼私房一厅两房作为临时办公用房。
1964年，市妇幼保健所迁至思明西路14号，楼层共有三层300平方米。
“文革”期间，厦门市妇幼保健所和全市妇幼保健机构被迫“斗、批、散”，机构合并于厦门市卫生防疫站，人员下放农村、基层，妇幼保健工作全部停顿。1974年5月，重新恢复，机构附属于后江埭第一门诊部。
1976年，暂借厦门卫校的一个教室办公，工作人员10人。设有妇幼保健、儿童保健和行政三股，业务逐渐扩大。
1979年，省厅拨出基建专款11万元，在公园西路6号兴建六层办公楼1座，建筑面积2400平方米，1980年1月落成，人员编制25人。
1996年，市政府将改善妇幼保健所条件列入该年为民办实事项目。经上级批准，厦门市妇幼保健所更名为厦门市妇幼保健院，规格为副县（处）级。
1998年，医院妇保部迁入溪岸路174号，儿保仍在公园西路6号，共占地900平方米，建筑面积3200平方米。因该业务用房经加固后仍被省定为存在结构隐患工程，要求进行挂牌整改，因此，不能开展病床，工作人员只有94人。
2002年，医院租用太平洋广场三楼开展工作（年租金100万），建筑面积4745平方米。2003年，厦门市政府对全市医疗资源的调整，同意医院的机构规格升格为县（处）级。是年，上级批复同意市妇幼保健院使用第二名称——“厦门市林巧稚妇儿医院”，同时将厦门市妇幼保健院定位三级医院。
2003年12月28日，新院落成典礼暨林巧稚妇儿医院揭牌仪式隆重举行。医院步入了发展的快车道。
2004年5月，医院正式迁入镇海路10号，使用面积14040平方米，这是市妇幼保健院发展史上的一个里程碑，部分缓解了医院业务用房紧张的问题。同年，省卫生厅同意厦门市妇幼保健院床位数由60张增加至150张。
2005年，为完善我市公共卫生体系，满足群众对妇幼保健、医疗的需求，市政府研究同意扩建市妇幼保健院。该二期扩建工程被列入省、市重点建设项目，总投资1.39亿元，建成后医院建筑面积近6万平方米。
2006年6月3日，厦门市妇幼保健院、林巧稚妇儿医院二期工程开工奠基，改建门诊大楼、新建二十层综合大楼。
2007年2月5日，市妇幼保健院改建工程门诊楼启用，为医院增加了近1万平方米的业务用房，床位增至302张。
2009年2月，新医疗保健综合楼启用，医院建筑面积增至6.1万平方米，床位增至500张，2012年2月，床位增至700张，成为闽西南规模大、条件好的妇幼保健院。
（以上数据来源官网，数据截止至2020年6月）
