馆藏文物
正是骨骸多为石膏复制品
出土文物大多藏于考古研究院
收归国有后，宝鸡先秦陵园博物馆职责更多了：不仅要对秦公一号大墓进行有效保护，还要负责雍城遗址的保护管理，制定并组织实施与其相关的保护利用规划。因此，博物馆加快了《雍城遗址保护总体规划》编制步伐，将国家投资资金用于秦公一号大墓及雍城遗址的一系列保护：前后两次对大墓南坡及墓道南壁部分进行加固保护，加装了防护栏杆；改造了陈列馆，拓宽了陈列内容；完成了雍城遗址保护标志碑的栽植、文保员队伍的扩充、实施了秦公陵园安全技术防范工程，硬化地面5000多平方米，绿化东西墓道两侧15亩；《雍城遗址保护总体规划》、《车马坑保护展示临时大棚设计方案》等经过反复修改、多次论证，获国家文物局批准通过；秦公一号大墓顶棚加盖也在积极酝酿中。
针对网上所说“人骨骨骸露天陈列，被白雪覆盖”，博物馆方面回应称，2012年，对墓葬大棚的加盖就组织有关机构进行了论证，最终由于资金缺口较大无法实施，《雍城遗址保护总体规划》的获批，进一步为申请加盖大棚创造了条件。有关墓葬中出土文物的保存问题，他们说，由于受当时文物保护条件所限，发掘结束后，陕西省考古研究院只留下保存较好的4根“黄肠题凑”椁木和木碑在陈列室展览，其他文物均带回考古院做进一步研究。而大墓中一排排的箱殉和匣殉、木碑都是复制品，里面的人骨大多是用石膏复制，有的是从附近取土场捡拾的骨殖，目的是为了展示春秋晚期活人殉葬惨烈场景和秦人特有的“屈肢葬”式。
宝鸡先秦陵园博物馆是在我国迄今已发掘的最大古墓葬——秦公一号大墓遗址上，由陕西省凤翔区南指挥村农民集体投资，进行保护性开发兴建起来的，系我国第一座农民集资兴建的博物馆。由于资金及政策性障碍，这个民营博物馆从一开始就遇到了自身难以克服的困难和问题。这一问题引起了国家有关部门的重视，2005年，国家文物局和陕西省文物局向宝鸡先秦陵园博物馆拨款380余万元，用于遗址的保护。宝鸡市委、市政府多次就博物馆的归属及体制进行调研论证，根据文物部门的意见，宝鸡市按照保护文物资源、开发旅游产业的总体思想，将宝鸡先秦陵园博物馆正式划归宝鸡市文物局管辖，从而扫除了博物馆发展中的体制障碍。
发展历史
1977年秦公一号大墓的考古发掘成果，占据了中国考古史上的“五个之最”，使凤翔享誉海内外。
由于具有如此重大价值，在秦公一号大墓发掘10年后，国家决定投资1000多万元建设秦公一号大墓博物馆对其进行保护。可惜的是，秦公一号大墓遭遇了“既生瑜何生亮”的命运嘲弄，正赶上宝鸡市扶风县法门寺地宫佛指舍利被意外发现，陕西省将保护经费先投向了法门寺。秦公一号大墓的保护一度搁浅。直至2000年，秦公一号大墓所在的南指挥村60多户村民自发筹集资金近百万元，建起了我国首家农民创建的遗址保护博物馆——秦公一号大墓遗址博物馆。博物馆建成后情形并不乐观。据了解，一个博物馆的运营需要庞大的资金支持，除了前期投资外，后期经营维护也是一笔不小的开支。资金成为困扰这家博物馆发展的最大瓶颈，再加上经营不善，发展可谓举步维艰。
事实上，大多数博物馆都可以通过立项来申请保护资金，但是秦公一号大墓遗址博物馆却由于体制问题而无法得到专项资金。2005 年，国家文物局和陕西省文物局曾下拨380多万元文物保护经费用于大墓的遗址保护。可是，钱到了宝鸡市，却迟迟发不下来，就因为这是座民办博物馆。捉襟见肘的境况维持了几年，最后经文保人士奔走呼吁，终于在2007年，迎来了收归国有的好消息。2007年9月18日，秦公一号大墓遗址博物馆收归国有，并更名为“宝鸡先秦陵园博物馆”。
五个之最
因为它的发现占据了我国考古史上五个之最：它是中国迄今发掘出的最大先秦墓葬；墓内186具殉人是中国自西周以来发现殉人最多的墓葬；椁室的“黄肠题凑”椁具，是中国迄今发掘周、秦时代最高等级的葬具；椁室两壁外侧的木碑是中国墓葬史上最早的墓碑实物；大墓中出土的石磬是中国发现最早刻有铭文的石磬。
