吉林省中医药博物馆坐落于长春市净月国家高新技术产业开发区，长春中医药大学校园内，是直属于长春中医药大学的中医药类综合展馆，前身为始建于1963年的医史陈列馆和始建于1959年的中药标本室。2009年学校机构改革时整合为长春中医药大学博物馆，2011年12月经吉林省文化厅批准正式命名为吉林省中医药博物馆。2013年9月，博物馆新馆正式建成开馆。
吉林省中医药博物馆现为吉林省科技厅认定省级科普基地，吉林省科协命名为第四批科普教育基地，中国科协命名全国科普教育基地，是中国博物馆协会会员单位，是学校特色鲜明、体系完备、馆藏内容丰富、教育功能突出的阵地，成为学校颇具专业特色的文化场所和对外品牌，在面向学生开展专业知识教学、面向大众普及中医药知识、弘扬我国传统文化方面发挥积极作用。
博物馆占地面积12000平方米，建筑面积7250平方米，展示面积3860平方米，设校史馆和六个展厅，即北药展厅、动物药展厅、人参展厅、吉林省名优中药企业展厅、中医药通史展厅和地方医药特色展厅，收藏并展示中医药文物2135件，中药标本近万份。主要展示关于中医药文化的历史人物、掌故、事迹、资料、文献、图片、模型，长白山北药基地独特的中药资源，以及有地域特色的东北满、蒙、朝等少数民族医药文化。
校史馆是为迎接学校成立55周年而建立，总建筑面积约400平方米，由序厅、历史沿革、主题展区，名师济济，任继学蜡像等展区组成。
本厅主要展示了长白山秀美风光，吉林省地形地貌、数百种北方常见药、吉林省第四次全国中医药资源普查及长春中医药大学中药研究成果。
动物药展厅展示了药用动物标本和动物药。其中药用动物标本以动物进化为序，展示了多孔动物、腔肠动物、软体动物、节肢动物、昆虫、两栖类动物、鱼、鸟和哺乳类药用动物。另有动物药标本1000余种。
人参展厅展示了园参、山参、西洋参、高丽参的实物，以及人参的起源和应用、资源分布与栽培、放山习俗、炮制加工和人参文化、人参科研等。
吉林省名优中药企业展厅以宣传板与实物相结合的形式，展示了吉林省22家名优医药企业的企业文化和主要产品。同时，展示了以东北三宝“人参”、“鹿茸”、“哈蟆油”为主要原料生产的药品、保健食品和化妆品。
中医药通史展厅以时间为脉络，展示了从远古医学起源到近现代的著名医学人物，大量的医学典籍，以及珍贵的中医药文物。
吉林省是多民族省份，满族、蒙古族、朝鲜族等的民族医药也得到了发展，并形成了独特的民族医药文化，这些在地方医药特色展厅都有所体现。
正值长春中医药大学纪念建校55周年之际，吉林省中医药博物馆于2013年9月16日正式落户该校，博物馆建筑面积7250平方米，展示面积3860平方米，分为一馆六厅，具体为校史馆、北药展厅、动物药展厅、人参展厅、吉林省名优中药企业展厅、中医药通史展厅和地方医药特色展厅。是吉林省首家综合中医药博物馆。馆藏数百种北方常见中药、罕见的药用动物标本、形态各异的人参药材，通过各种展示让人们了解中药的起源与发展。
吉林省中医药博物馆由长春中医药大学整合原基础医学院医史博物馆和药学院标本室而成。该馆是国内中医院校博物馆中位居前列的中医药类综合展馆，于2013年9月16日开馆，已被吉林省科技厅认定为省级科普基地，被吉林省科协命名为科普教育基地，同时还成为长春中医药大学的大学生教学实践基地。
博物馆现有馆藏中医药文物3397件，中药标本1万余件。每年接待参观者1万余人次，已成为公众了解和认识中医药文化的重要平台。
