南通市妇幼保健院（南通市儿童医院）是一所集医疗、保健、科研、教学于一体的三级甲等妇幼保健院。医院始建于八十年代初，1983年4月1日正式开诊，2013年整体迁建至南通市新城区，毗邻南通市行政中心。
014年5月医院与上海市红房子妇产科医院和复旦大学附属儿科医院签约成为协作医院；2015年1月与南京市妇幼保健院签约成为友好合作医院；2015年6月1日正式挂牌南通市儿童医院。
南通市儿童医院的正式开放，结束了南通市多年来一直没有儿童医院的历史。儿童医院开放后，医院将以接轨上海名院、加强深度医疗合作为契机，加快儿内科、儿外科、新生儿科、NICU、PICU等临床科室及儿童保健科、儿童眼科、儿童耳鼻喉科、儿童口腔科、儿童康复科等保健科室为一体的儿童医院建设，为南通市妇女和儿童提供更加专业、周到、热情、温馨的服务，以精湛的医术、优良的服务为广大市民的健康保驾护航。
医院先后获得国家级爱婴医院、江苏省文明单位、省巾帼建功先进集体、省“三八”红旗集体、南通市文明单位、南通市最佳服务单位、市级“巾帼文明岗”、妇幼保健工作先进集体、患者安全目标合格医院等多项荣誉称号。
医院位于南通市崇川区世纪大道399号，总建筑面积59000平方米。医院设有27个临床保健医技一级科室及16个住院病区，编制床位500张，开放床位550张。
医院综合实力雄厚，专科特色明显。目前医院有江苏省妇幼保健重点学科3个：产科学、新生儿医学、儿童保健科。市级临床医学中心建设单位1个（产前诊断中心）。市级重点学科2个（生殖医学中心、新生儿科）。市级临床重点专科12个（产科、病理产科、微创妇科、新生儿科、生殖健康与不孕不育、乳腺科、医学检验科、医学遗传学实验室、儿童康复科、儿童心理卫生科、产科护理、新生儿科护理），市级医学创新团队4个（儿童康复、中西医结合乳腺疾病、小儿外科、妇产科护理）。是国家住院医师规范化培训协同基地、江苏省新生儿疾病筛查南通分中心、江苏省产前诊断筛查南通分中心、江苏省新生儿危急重症救治中心、南通市孕产妇和新生儿危急重症救治中心、南通市母婴专科护士培训基地、南通市助产专科护士培训基地、南通市儿童危重症专科护士培训基地。
医学专家荟萃，人才优势明显。医院现有职工975名，拥有高级职称人员近150余名，包括享受国务院政府特殊津贴专家、省“333”、市“226”重点人才、硕士生导师、南通大学兼职教授以及担任省市医学专业委员会主任委员、副主任委员共30余名。
医院病房环境优雅，医疗设施齐全。拥有核磁共振（MRI）、64排螺旋CT、数字减影X光机、800毫安全自动遥控X光机、数字胃肠机、全数字化乳腺钼靶机等先进放射类设备，多台四维彩超和数十台进口超声机，智能产程监护仪和各类监护仪设备近百台，配备耳聋基因筛查设备、全自动染色体核型分析系统、高通量测序仪及第二代试管婴儿设备等各类大型医疗设备。
