上海市口腔病防治院成立于1946年，前身是上海市立牙病中心防治所，隶属于上海申康医院发展中心。是一所集医疗、教学、科研、预防为一体，以医防融合为特色的三级口腔专科医院。自上世纪50年代起，受上海市卫生健康委员会的委托，指导全市口腔疾病防控工作，拥有全国较为完整的口腔公共卫生三级防治网络。为居民提供口腔健康服务，着力改善群众口腔健康水平，提高生活品质。
1993年获批第二冠名“上海市口腔医院”；2015年4月，复旦大学与上海申康医院发展中心正式签约合作共建“复旦大学附属口腔医院”。现设有北京东路院区、复兴中路院区、浦锦院区、永嘉路门诊部、天津路科研教学中心和江西中路口腔公共卫生培训中心。位于浦锦院区的复旦大学上海医学院口腔本科教学与实训中心，建筑面积逾4000平方米，设有仿真头模实验室、多功能实验室、修复工艺技术室、数字化虚拟教学实验室、临床教学诊室、图书馆与电子阅览室等。可同时满足口腔医学和临床医学本科生、研究生、规培住院医师理论课程、实验及实训教学需求，并可为复旦大学各附属医院、口腔病防治联合体成员单位医务人员毕业后教育、口腔公共卫生专业技术人员培训等提供硬件支撑。
医院门、急诊、住院、特需诊疗服务齐全，设有牙体牙髓病科、牙周病粘膜病科、儿童口腔科、口腔预防科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔正畸科、口腔种植科、口腔颌面影像科、内科门诊、麻醉科、口腔工艺、药事、检验等16个临床及医技部门，涵盖全部口腔专业领域。设有“睡眠监测中心”、“儿童舒适化治疗中心”、“疼痛中心”等口腔特色门诊，及“心电监护拔牙”、“口呼吸专病”、“口腔正颌专病”、“颞颌关节专病”、“咬合重建”“冠根一体化”等多学科联合诊疗（MDT）门诊，年门急诊服务人次超60万人次。
医院现有职工403人，其中专业技术人员354人，医生团队中高级职称比例24%，博士学位比例21%。拥有博士研究生导师6名，硕士研究生导师9名。中华口腔医学会常务理事1名，全国各专业委员会副主任委员2名，常委7名；上海市口腔医学会副会长1名，副秘书长1名，常务理事1名，上海市各专业委员会主任委员3名，副主任委员7名；上海市预防医学会主任委员1名。国际牙医师学院院士2名，英国爱丁堡皇家外科学院院士及国际考官1名，国家重点专科负责人1名，中国牙病防治基金会理事1名。
医院现有口腔综合治疗椅166台，拥有口腔颌面外科病房，椅旁CAD/CAM即刻修复系统、颞颌关节运动轨迹分析仪及综合诊断系统、显微根管治疗系统、数字化口腔扫描系统、颅颌面锥形束CT、数码口腔全景摄片机、水激光口腔治疗系统、CAD/CAM全瓷修复系统、数字化树脂及金属3D打印及切割系统、数字化消毒供应系统等先进设备。口腔修复工艺中心配备数字化模型扫描仪、3D金属粉末激光打印机、3D树脂打印机、5轴氧化锆及金属切割机等先进设备。口腔生物医学工程实验室建筑面积800平方米，配有正置荧光显微镜、生物安全柜、口腔干细胞培养系统、万用力学检测仪、纯水一体化系统等60多台专业的科研设备，功能覆盖分子生物学、细胞生物学、组织学、口腔材料与合学等研究领域。
