复旦大学上海医学院儿科学系设在儿科医院，每年承担13个专业1000余名医学生的临床教学与实习培养；每年在读博士和硕士研究生200余名。医院拥有国家儿科和儿外科住院医师规范化培训基地以及13个上海市儿科亚专科和儿外科医师培训基地，每年培养200余名住院医师和专科医师。医院每年培养长期进修学员300名，短期进修学员250名，至今已经为全国各地培养进修医生1万余名。每年举办50-60期国家级继续教育学习班。
2017年12月，医院成为亚洲第一个复评审通过第六版JCI标准的学术型儿童医学中心。2017年医院荣获“全国文明单位”、“全国未成年人思想道德建设先进集体”和“全国学雷锋示范点”等荣誉。医院连续九次荣膺上海市文明单位。
医院经过65年的发展，儿科综合学科实力领先，专科临床诊治特色突出，目前共设50个临床专业医技科室，拥有一大批国家级和省部级重点学科。国家临床重点专科：新生儿、重症医学科、小儿消化科、中医儿科、新生儿疾病重点实验室、小儿外科、临床护理。卫生部临床学科重点专业：新生儿、外科、心血管、传染病。上海市重中之重临床中心：儿科疾病临床医学中心。上海市重中之重重点学科：儿科、小儿外科。上海市医学重点学科：新生儿。上海市临床中心：小儿外科疑难重症临床医学中心；新生儿会诊抢救中心；新生儿先天性心脏病筛查诊治中心。上海市医学领先专业：呼吸急救。上海市公共卫生重点发展专业：小儿传染病。上海市临床质控中心：儿科质控中心，新生儿临床质量控制中心，上海市新生儿先天性心脏病筛查质控指导中心。2017年，根据国家儿童医学中心功能定位，设立6个以学科群为特征的临床中心：儿科疑难危重症、新生儿、出生缺陷、传染感染和免疫、血液和肿瘤、儿童保健和康复。
截止2017年底，在职职工1757人，高级职称专家175人，博士生导师35名，硕士生导师33名。
复旦大学附属儿科医院门诊就医的流程如下：
1 预检：不同于成人综合医院，预检分诊是儿童就医的必不可少的环节之一。首先必须家长带领孩子到预检台经护士预检，领取预检号。
2 挂号：拿到预检单后去收费/挂号处挂号。如为复诊病人，明确了解所就诊的科室与专家，也可在一站式自助服务机直接自助完成挂号。
3 预约：（1）微信预约：关注微信公众号“复旦儿科”>个人中心>就医助手>预约挂号；（2）手机APP预约：下载官方APP“复旦儿科”>就诊人>我的预约；（3）网上预约：登录上海申康医联预约平台，网址： ；（4）现场预约：门诊便民服务中心；（5）自助预约：门诊大厅及各楼层分布的自助机；（6）诊间预约：门诊医生工作站；（7）出院预约：住院病区医生工作站；（8）电话预约：（拨打95169）
4 就诊：挂号后根据挂号单上的就诊区域前往就诊；（1）内科门诊和内科专家门诊开放时间：周一至周日；（2）专科门诊和专科专家门诊开放时间：周一至周日；（3）高级专家门诊开放时间：周一至周日。以上所有科室都可通过我院现有预约途径进行预约（预约优先，按号就诊），专家出诊信息详见门诊一览表。
5 治疗：医生开出药单或其他治疗方案后，家长即可往收费处缴款、自助服务终端机或通过移动平台在线支付（微信、支付宝、银联），然后取药。输液病人付费后无需拿药直接去门急诊补液区窗口取号、等待输液。
