丰臣氏以“丰臣”做为本姓，性质和“织田”（本姓平朝臣）与“德川”（本姓源朝臣）等苗字性质完全不同。“丰臣”对秀吉而言完全是本姓，他的苗字是“羽柴”。因此“丰臣秀吉”四字其实应该读做“とよとみ・の・ひでよし”才是正确的，而秀吉的苗字至死都是“羽柴”。此外，有说法“丰臣（とよとみ）”姓是取自于圣德太子的本名“丰聪耳（とよとみみ）”。
以一介平民出身而没有一门众家臣团的秀吉，赐给有力家臣与大名丰臣朝臣的氏姓和羽柴的苗字，使大名们要自称为丰臣朝臣羽柴何某，达到类似自己一族的效果（江户幕府时代，许多大名是德川氏与松平氏出身，丰臣政权可以与之做对照）。
秀吉只有以上少数的亲人，弟弟秀长是大和国郡山城主万石，外甥秀次是近江国八幡城主100万石、秀胜是丹波国龟山城主，亲生儿子鹤松则是原本预定为继承人。但在1590年天下统一之前到之后的1591年至1595年之间，秀长、鹤松、秀胜以及继承秀长的秀保竟然都相继死去了。
为此心灰意冷的秀吉决定以外甥秀次当做继承人，并于1591年将关白之位让给他。但是秀吉让出权位后，却又称为太阁，依然掌握丰臣家的直辖领与军权，于是产生了二重政权的矛盾。而且在1593年时，秀吉再次得子秀赖，决定了秀吉与秀次间对立更加恶化。1595年，秀吉将秀次流放到高野山，秀次切腹自杀。从此二重政权消除，丰臣政权再次归于秀吉，而且为了政权的正统性，关白一职便从丰臣家完全消失了。
1598年秀吉过世，他将后事托付给几个有力大名，其中德川家康终于抬头，在1600年的关原之战时击倒石田三成等丰臣政权拥护派的诸大名，建立霸权。家康在1603年时就任征夷大将军，创立江戸幕府，并在1605年时将将军之位传给其子德川秀忠，以确立德川政权的正统性，而丰臣氏的政权宝座也完全掉落了。
但即使德川政权已经确立，丰臣秀赖方面也仍然把德川将军当做是臣下。家康感到有所顾虑之处，德川家康深居骏府视政以后，视丰臣氏的存在为大忧患，决心要以其老迈之躯，亲自策划消灭之。便在1614年发起大阪冬之阵，并且在第二年的大阪夏之阵时攻下大阪城，秀赖与其母淀殿自杀。秀赖之子国松在庆长二十年五月二十三日（西元1615年6月19日）在京都的三条河原被处死，于是由秀吉一手兴起的丰臣氏宣告灭亡。
后来在德川氏稳定霸权的过程中，允许当初被赐丰臣朝臣、羽柴氏的大名们，可以舍弃这个姓。江户时代还以丰臣朝臣为本姓的大名家，只有秀吉夫人北政所宁宁的娘家木下氏。木下氏在明治维新后因为本姓与苗字合一的法令，必需只能使用其中一个姓，现代已经极少有姓丰臣。
氏族的丰臣氏，即指秀吉的兄弟姊妹与他们子孙所结合的一族，也就是以下列出的人们：
大政所（母）
木下弥右卫门（瑞龙院・秀吉之父）
竹阿弥（秀长・旭姬之父）
瑞龙院（长女）
丰臣秀次（秀吉的养子）丰臣秀胜（秀吉的养子）
丰臣秀保（秀长的养子）
丰臣秀吉（长男）
丰臣鹤松（夭折）
丰臣秀赖
丰臣国松（夭折）
天秀尼
丰臣秀长（秀吉同母之弟，竹阿弥之子）
旭姬（次女）
也有传说国松逃到萨摩的岛津家，成为丰后国日出藩的木下家分家、交代寄合木下家之祖木下延次，这一支的子孙姓丰臣姓了。
