泰州市中医院始建于1958年12月，是南京中医药大学附属医院、中医药传承创新国家重点中医院、国家药物临床试验认定机构、国家中医住院医师规范化培训基地、江苏省互联网医院、泰州市首家工伤康复定点医院。医院通过不懈努力，已发展成为学科完善、人才集聚、中医药文化鲜明，集医疗、教育、科研、预防保健、康复指导为一体的三级甲等综合性中医院。医院现有济川路和邑庙街两个院区，总占地面积190亩，建筑面积约18万平米，编制床位1500张。
医院积极开展中医药学术对外交流，推动中医药走向世界，定期派出中医医疗队成员赴柬埔寨开展医疗技术对口援助，2019年，医院承办中国泰州-柬埔寨暹粒友好城市暨中医药合作交流会，与柬埔寨吴哥国际医院签署友好医院合作协议，被授予柬埔寨中医药国际合作交流基地和国际友好医院。医院还先后与以色列马诺国际医疗中心、摩洛哥医学院、摩洛哥癌症研究中心建立合作关系，并签署合作备忘录，通过开展中药项目合作、建立中医药文化与旅游点等形式，在技术、人才、产品与旅游文化等方面开展深入交流与合作。
医院科室设置齐全，共设42个病区，50多个临床医技科室，现有国家中医临床重点专科2个，省级中医临床重点专科4个，市级重点学科7个，市级临床重点专科3个，市级中医临床重点专科19个，国医大师传承工作室4个，省级名老中医专家传承工作室2个。
医院在职职工近1500人，其中，高级职称294人，中级职称319人，博士研究生14人，硕士研究生179人。
医院人才结构合理，一支由国医大师领衔，省市名中医为中坚力量的老、中、青三代人才梯队已经形成，其中全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师1名，江苏省老中医药专家学术经验继承工作指导老师3名，省名中医4名，市名中医22名，国家优秀中医临床人才2名，江苏省优秀中医临床人才2名，全国中药特色技术传承人4名，全国中医药骨干人才1名，江苏省“333”高层次人才7名，江苏省“六大人才高峰”2名。
1958年12月，由几家在泰州有较大影响的中医联合诊所共同合并创建了泰州市中医院；地址为稻河路48号，称之为泰州县泰州人民公社中医院。
1969年因文革泰州市部分医务人员下放，留在泰州的中医院、康复医院、人民医院合并为新的泰州市人民医院。
1975年，泰州市中医院复建。
1986年11月，医院搬迁至现址泰州市海陵区邑庙街6号。
1996年5月，创建成为二级甲等中医院。
2001年12月26日，市中医院与市第三人民医院正式合并，成立新中医院。
2003年10月31日，创建成为国家三级中医院。
2005年6月30日，创建成为国家三级甲等中医院。
2005年11月3日，创建成为南京中医药大学泰州附属医院。
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