长治市中医研究所附属医院创立于1952年，前身为长治专区国营贸易职工诊疗所，现已成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的国家三级甲等中医医院、北京中医药大学东直门联盟单位、山西中医药大学附属医院。医院编制床位400张，实际开放床位490张。
医院坚持继承发扬中医药传统优势，中西医并重，以心脑专科为龙头引领，着力打造全国闻名、全省一流、具备一定科研能力和区域引领作用的中医名院，为人民群众提供全方位、全周期的健康服务。
医院连续多年被山西省卫生厅、长治市人民政府评为先进集体，2004年，国家人事部、卫生部、中医药管理局联合授予医院“全国卫生系统先进集体”称号。
医院设有脑病科、心病科、肾病科、脾胃病科、肺病科、糖尿病科、风湿病科、外科、急诊科、推拿科、康复科等22个临床科室。医院功检科、医学检验科、影像科、药学部、供应科等7个医技科室。医院心病科、肾病科、脾胃病科、肺病科、风湿病科是“山西省重点中医专科”。
医院现有职工519人，其中特聘教授15人，高级职称55人，中级职称142人，硕士研究生57人，本科生267人，省、市级名老中医20人，山西省老中医药专家学术经验继承工作指导老师1人，山西省中青年中医领军人才2人，山西省百千万人才4人，长治市新技术世纪学术带头人111人才工程6人；先后获得国家级科研成果6项、省级科研成果5项、市级科研成果33项；现承担国家级科研项目6项、市级科研计划4项；拥有专科制剂5种，专病专药经验方56种。
医院配备有西门子第三代Artis Zee Ceiling数字造影系统、奥林巴斯无痛电子胃肠镜、飞利浦1.5T磁共振成像系统、西门子16排螺旋CT机、数字胃肠、摄影系统、飞利浦IU彩超、GE至尊彩超、雅培生化免疫检验流水线、全自动生化分析仪、费森尤斯血液透析仪等，还有医用空气加压氧舱等先进的康复设备、中医诊疗设备。
1952年底，筹建了“长治专区国营贸易职工诊疗所”。
1953年，诊疗所更名为“晋东南专署贸易职工疗养院”。
1955年，疗养院又恢复为长治专区贸易职工诊疗所。
1958年，更名为“晋东南专署商业职工诊疗所”
1970年5月，命名为“山西省晋东南地区革命委员会商业局诊疗所”，后又改为“晋东南地区财贸诊疗所”。
1976年10月，诊疗所更名为“晋东南地区财贸职工医院”。
1978年10月，晋东南地区财贸职工医院改建为“晋东南地区中医医院”。
1988年6月28日，经长治市市委常委研究，决定成立“长治市中医研究所”，原晋东南地区中医医院改名为“长治市中医研究所附属医院”，实行一套人马，两块牌子。
1996年12月，医院成功创建“国家二级甲等中医医院”。
2013年1月，医院成功创建“国家三级乙等中医医院”。
2018年12月，医院成功创建“国家三级甲等中医医院”。
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