浙江省中山医院是浙江中医药大学直属的综合性中医医院，也是国家中医药管理局评定的全国首批三级甲等中医医院，以鲜明的中医药特色和突出的针灸、推拿、康复、骨伤专科优势享誉省内外。医院挂靠浙江省针灸学会及其针刀分会、经络养生分会，浙江省中医药学会及其整脊分会、推拿分会，浙江省康复医学会中西医结合专业委员会等。医院创建于1961年，前身为浙江中医学院门诊部，时为浙江中医学院的临床教学基地，被中医界誉为“浙江省名中医的摇篮”。
医院致力于科技创新，拥有由3个国家中医药重点学科、1个浙江省“一流学科”、1个浙江省“重中之重”学科、1个浙江省中医药重点学科组成的中医药优势学科群，建立了以国家中医药三级实验室针灸神经生物学实验室、推拿生物力学实验室、临床科研实验室及与吴阶平基金会合作的细胞与分子临床医学研究中心为主体的临床研究平台。医院近5年累计中标科研项目377项，其中国家级科研项目22项，省部级科研项目50项，获得省部级科技奖励12项，授权发明专利7项。
医院下设临床医技科室45个。医院坚持“中医为本、西医为用、差异化发展”的办院理念，保持和发展中医特色，积极追踪现代医学治疗手段，形成了50个特色鲜明、疗效明显的专科专病专技群，其中国家临床重点专科3个，国家中医药重点专科5个，中风病、面痛症、肩凝症、髋关节功能障碍、腰椎间盘突出症、胸椎错缝、眩晕病、冠心病、慢阻肺、不孕不育、甲乳疾病、恶性肿瘤等多个优势病种的疗效达到全国先进水平。医院依托浙江名中医馆的名中医优势，积极开展名老中医学术思想、临证经验、独有技术的传承与创新，设立经方医学研究会，拥有陈木扇女科全国流派传承工作室和5个全国名老中医传承工作室。医院积极探索多学科联合诊疗模式，获批成立浙江省椎间盘诊疗中心，并被国家中医药管理局列为中医诊疗模式创新试点单位。医院以中医护理为特色的护理团队也在全省颇有影响力。
医院现有职工1057人，高级职称132人，其中卫生部和浙江省有突出贡献中青年专家1人、中医药高等学校教学名师1人、浙江省卫生领军人才1人、全国老中医药专家学术经验继承指导老师6人、浙江省名中医4人、浙江省杰出青年基金获得者1人、浙江省卫生创新人才1人、浙江省151人才9人。
医院还拥有核磁共振（MRI）、64排螺旋CT、DSA、PCR仪、全自动生化分析仪、彩色超声诊断系统等大型现代化医疗设备，为医教研协调发展提供了坚实的基础。
1961年 浙江中医学院门诊部正式挂牌门诊，设址于庆春路老浙大舜水馆。
1970年 门诊部因学院与浙江医科大学合并而撤销。
1975年 门诊部恢复并改址于浙江中医学院黎洲馆。
1999年 门诊部经省卫生厅批准升格为省级医疗机构。
2002年 门诊部迁至庆春路中医大厦。
2003年 门诊部与原浙江中医学院针灸推拿系“院系合一”。
2005年 医院增挂浙江省针灸推拿医院院名。
2006年 医院升格更名为浙江中医药大学附属第三医院。
2008年 医院与原浙江省邮电职工医院合并重组。
2009年 医院增设莫干山路院区，增挂浙江省中山医院院名。
2011年 医院经省卫生厅批准升格为浙江省三级乙等中医医院。
2013年 医院被国家中医药管理局授予三级甲等中医医院称号。
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