曲阜孔庙（Temple of Confucius， Qufu），又称“阙里至圣庙”，位于曲阜市中心鼓楼西侧300米处，是祭祀中国古代著名思想家和教育家孔子的祠庙。始建于鲁哀公十七年（前478年），历代增修扩建。
曲阜孔庙以孔子故居为庙，岁时奉祀。西汉以来历代帝王不断给孔子加封谥号，孔庙的规模也越来越大，成为全国规模较大的孔庙。现存的建筑群绝大部分是明、清两代完成的，占地327亩，前后九进院落。庙内有殿堂、坛阁和门坊等464间。四周围以红墙，四角配以角楼，是仿北京故宫样式修建的。与相邻的孔府、城北的孔林合称“三孔”。
曲阜孔庙被建筑学家梁思成称为世界建筑史上的“孤例”。1961年，国务院把“三孔”列为全国重点文物保护单位；1994年被联合国教科文组织列为“世界文化遗产”。现为国家AAAAA级景区，与北京故宫、承德避暑山庄并列为中国三大古建筑群；与南京夫子庙、北京孔庙和吉林文庙并称为中国四大文庙。
大成殿是孔庙的主体建筑，面阔九间，进深五间，高32米，长54米，深34米，重檐九脊，黄瓦飞彩，斗拱交错，雕梁画栋，周环回廊，巍峨壮丽。擎檐有石柱二十八根，高5.98米，直径达0.81米。两山及后檐的十八根柱子浅雕云龙纹，每柱有七十二团龙。前檐十柱深浮雕云龙纹，每柱二龙对翔，盘绕升腾，似脱壁欲出，精美绝伦。殿内高悬“万世师表”等十方巨匾，三副楹联，都是清乾隆帝手书。殿正中供奉着孔子的塑像，七十二弟子及儒家的历代先贤塑像分侍左右。历朝历代皇帝的重大祭孔活动就在大殿里举行。殿下是巨型的须弥座石台基，高2米，占地1836平方米。殿前露台轩敞，旧时祭孔的“八佾舞”也在这里举行。
棂星门是孔庙的大门。古代传说棂星是天上的文星，以此命名寓有国家人才辈出之意，因此古代帝王祭天时首先祭棂星，祭祀孔子规格也如同祭天。棂星门建于清乾隆十九年（1754年），六楹四柱，铁梁石柱，柱的顶端屹立着四尊天将石像，威风凛凛，不可一世。柱下石鼓抱夹，使建筑风格稳重端庄。
二门又名圣时门，形同城门，有三间门洞，前后石陛御道有明代的浮雕二龙戏珠，图中的游龙翻江倒海，喷云吐雾，气势不凡。圣时门建于明代，飞檐斗拱，顶为绿琉璃瓦，门前的汉白玉坊，名太和元气坊，坊名盛赞孔子如同天地一般，无所不包。门的东西两侧各立有一座木坊，两坊形制相同，上边置有牌楼，三间四柱，斗拱密集，檐翼起翘，柱上透雕有石狮、天禄像，造型古朴。
奎文阁位于孔庙的中部，是藏书的一座楼阁。中国古代以奎星为二十八宿之一，主文章。阁始建于宋天禧二年（1018年），明成化十九年（1483年）改建。奎文阁三重飞檐，四层斗拱，面阔七间，进深五间，长30米，宽17.62米，高23.35米。阁的内部有二层阁，中间夹有暗层，结构独特，工艺奇巧。上层是专藏历代帝王御赐的经书、墨迹的场所，明清两代曾专设奎文阁七品典籍官一员进行管理，暗层专藏藏经板，下层专藏历代帝王祭孔时所需的香帛之物。
孔庙的杏坛相传是孔子讲学之所，在大成殿前的院落正中。北宋天圣二年（1024年）在此建坛，在坛周围环植以杏，命名为杏坛，以纪念孔子杏坛讲学的历史故事。金代又在坛上建亭，大学士党怀英篆书的“杏坛”二字石碑立在亭上。明隆庆三年（1569年）重修，即杏坛。杏坛是一座方亭，重檐，四面歇山顶，十字结脊，黄瓦飞檐二层，双重斗拱。曾有诗人以妙句描绘杏坛的景色，“独有杏坛春意早，年年花发旧时红”，亭的四周杏树繁茂。
庙内还存有两汉以来历代碑碣二千多方，真草隶篆，诸体俱备，其中尤以汉魏六朝的碑刻称誉海内外。
孔庙内保存汉代以来历代碑刻1000多块，内容既有封建皇帝追谥、加封、祭祀孔子和修建孔庙的记录。 [28] 庙内碑刻上至两汉、下迄民国，真草隶篆，各家书法具备。巨者逾丈，小者不盈尺。有唐、宋、金、元、明、清、民国所立石碑53座，碑文多是祭孔、修庙的记录，除汉字外，还有满文、蒙古文和八思巴文，是中国大型碑林之一。著名的汉代碑刻有汉王凤二年（公元前56年）刻石史晨碑、乙瑛碑、孔庙碑、礼器碑、孔谦碑、孔君墓碑、孔彪碑、孔褒碑、谒孔庙残碑等17块，汉碑集中存数居全国首位。魏晋南北朝碑刻有黄初碑、贾使君碑、张猛龙碑、李仲璇碑、夫子庙碑等。孔子故宅西侧四角黄瓦方亭中立有乾隆御书《故宅井赞》碑，亦为艺术珍品。陈列室内还嵌有玉虹楼法帖石刻584块，其他各处有各代各种碑刻1200块以上。
孔庙平面呈长方形，占地14万平方米，南北长0.7公里。孔庙沿一条南北中轴线展开布置，左右对称，布局严谨，共有九进院落，前有棂星门、圣时门、弘道门、大中门、同文门、奎文阁、十三御碑亭，从大圣门起，建筑分成三路：中路为大成门、杏坛、大成殿、寝殿、圣迹殿及两庑，分别是祭祀孔子以及先儒、先贤的场所；东路为崇圣门、诗礼堂、故井、鲁壁、崇圣词、家庙等，多是祭祀孔子上五代祖先的地方；西路为启圣门、金丝堂、启圣王殿、寝殿等建筑，是祭祀孔子父母的地方。
全庙共有五殿、一祠、一阁、一坛、两堂、十七碑亭、五十三门坊，共计有殿庑四百六十六间，分别建于金、元、明、清及民国时期。孔庙内较为著名的建筑有：棂星门、二门、奎文阁、杏坛、大成殿、寝殿、圣迹堂、诗礼堂等。
孔庙建筑空间还存在着一整套礼的制约，建筑空间渗透着浓厚的伦理特性。唐宋时期，孔庙建筑单体己经高度程式化，组群规划布局基本也已成定制。孔庙建筑空间布局也自然遵循这些建筑思想，不仅要满足祭祀孔子的使用要求，而且严守繁褥的礼制规范和等级制度。使孔庙不在是简单平常的学习空间，更具有了特殊的场所精神的“复合”的空间。
曲阜孔庙平面基本形制为其功能的发挥打下了基础，建筑空间布局以“大成殿”院落即“庙”的祭祀空间为整体建筑群落的核心，与内庭空间为次中心所产生的位置关系，构成两组不同功能的院落空间形式。曲阜孔庙整个建筑群自南至北由九进院落串联组成，它以最南端的权星门为起点，到北端的圣迹殿结束。曲阜孔庙的院落空间划分自古城学巷东西簧门外“德作天地”、“道冠古今”两座木牌坊开始。两座木牌坊一方面标示了孔庙建筑群的重要性质和至高等级；另一方面作为进入孔庙的引导，有效地渲染了孔庙建筑群入口的壮观气氛，突出强化了孔庙建筑群的庄严肃穆。孔庙建筑群整体及门面空间意蕴也由点题为“德俘天地”、“道冠古今”的两座木牌坊加强、展开。
曲阜孔庙的历史可以追溯到孔子逝世的第二年，即周敬王四十二年（鲁哀公十七年，前478年）。宗庙规格按照周代礼制规定：“天子七庙，诸侯五庙，大夫三庙，士一庙，庶人无庙。”士与大夫的庙设定在其住宅东侧，与住宅同为一大门之内。孔子在鲁国从政时，最高任过“大司寇”，但在其周游列国回国之后，一直未重新从政，所以论其身份，仍为“布衣”。
后人为其立庙，实际上有所不同于常礼。因宅立庙，是因为故宅最能使人触景生情。最初的立庙是为了追慕悼念孔子，将孔子生前所穿过的衣物、乘过的车、用过的琴等遗物收集于孔子生前故居内，做以纪念。此时的孔庙布局尚无记载，只能按常理推测为庙屋三间。
汉高祖十二年（前195年）十一月，高祖刘邦自淮南还京，经过阙里，以太牢祭祀孔子。开皇帝亲祭孔子之先。元始元年（1年），汉平帝追谥孔子为“褒成宣尼公”，孔子后人孔均为褒成侯，奉其祀。自此，孔庙愈受重视。东汉建武五年（29年），光武帝过阙里，命祭孔子。明帝、章帝、安帝均曾到曲阜祭祀。
永兴元年（153年），汉桓帝下诏重修孔庙，任命孔和为守庙官，并立碑以记。有汉一代，庙宇虽经多次整修，但仍以宅为庙。东汉末年，天下大乱，“遭天下大乱，百祀堕坏，旧居之庙，毁而不修，褒成之后，绝而莫继，阙里不闻讲诵之声，四时不睹蒸尝之位”， 于是孔庙颓败。
魏晋南北朝时期，社会动荡，虽然玄学兴起，佛教盛行，孔子的尊崇地位却未受到太大影响。魏文帝“令鲁郡修起旧庙”， 并安置吏卒百户守卫；又在庙外广修屋宇，以居学者。
西晋末造，五胡乱华，“庙貌荒残”。东魏孝静帝兴和元年（539年），大力维修孔庙，首次为孔子及弟子塑像。此后，北齐天保元年（550年）和梁太平二年（557年）孔庙均得到修葺，但于庙宇形制无改。
隋文帝开皇元年（581年），追尊孔子为“先师尼父”。贞观十一年（637年），唐太宗诏兖州建阙里孔子庙。唐高宗乾封元年（666年），因旧庙简陋，高宗令兖州都督霍王李元轨“改制神宇”，对孔庙进行史上第一次的大规模改建。这次扩建，扩大了孔庙原先的范围，虽仍以“庙屋三间”为制，但庭院及外观大有改观。建筑采用多层斗棋，墙壁开窗，环以步廊于其四周。庙庭围墙之外循时规，加修了一道外围墙。东南角接近旧时洋宫围墙，东北角建于灵光殿残基处，西北角建于原鲁城伴宫围墙处（即今曲阜城棋盘街月龙虎街相交处），东西南北各长200余米。今孔子故宅门为唐时“庙宅之门”，其西侧有另一庙门，南邻道路，向西通往鲁城西城垣的归德门。孔庙殿堂建于灵光殿旧址。
唐玄宗开元七年（719年），兖州刺史韦元圭和孔子三十五代孙、褒圣侯孔璲之等又“树缭垣以设防”。 据《孔氏祖庭广记》中的“宋网里庙制”图推测，当时的孔庙很可能将正殿改为了面阔5间，专奉孔子。孔子塑像居中最北朝南，着王者服，外罩儒者衣，另有卜哲坐像分列东西。正殿之后新建寝殿，内奉孔子夫人，西侧建叔梁大夫堂，内奉孔子父母。唐玄宗开元二十七年（739年），追谥为“文宣王”。
唐代宗大历八年（773年）兖州刺史孟休鉴、曲阜县令裴有象新建庙门。咸通十年（869年），孔子三十九代孙、鲁国公、天平军节度使孔温裕奏请朝廷，献私俸修葺庙宇。唐代的孔庙已初具规模，对庙宇的修葺共有五次。
北宋朝廷崇儒重道，宋太祖立国之初，即至曲阜拜祭，下诏增修庙宇。建隆元年（960年），诏增修祠宇。建隆三年（962年），又诏祭孔庙，用一品礼，庙门列十六戟。太平兴国八年（983年），宋太宗“乃鼎新规，革旧制”，对孔庙进行修缮。 [13] 新成的孔庙，“缭垣云矗，飞檐翼张”， 重门洞开，层阙特起，“回廊复殿，一变维新”。
大中祥符元年（1008年），宋真宗过曲阜拜孔庙，加谥孔子为“玄圣文宣王”； [15] 次年又“颁孔庙桓圭一，加冕九旒，服九章，从上公制”； [10] 大中祥符四年（1011年），宋真宗诏令各州皆建孔庙；大中祥符五年（1012年），宋真宗改谥孔子为“至圣文宣王”。
天禧二年（1018年），孔子四十五代孙、大理寺丞孔道辅奏言：“祖庙卑陋不称，请加修崇”， [16] 朝廷奏准并遣之以官钱监修孔庙。天禧五年（1021年），孔道辅“又请得封禅行殿余材”，扩大孔庙旧制。经过扩建的庙宇，前后四进院落，东、中、西三路并行，今之格局初步奠定。景祐四年（1037年）修建讲学堂。次年，孔道辅又于正殿之西建五贤堂。
嘉祐六年（1061年），宋仁宗颁御书金字篆书“宣圣庙”和飞帛书“大成殿”匾额。此后的元丰、绍圣、政和年间亦曾重修孔庙。元祐元年（1086年），又添建庙学于孔庙东南隅。崇宁四年（1105年），宋徽宗颁孔子像“冠服制度用王者，冕十二旒，衮服九章”。
宋徽宗后不久，金兵南侵，“庙宇与书籍俱为灰烬”。但金朝上层有远见者深知，欲立足中原，必须依靠儒家思想。天会五年（1127年），金将完颜宗尧进驻燕京后，戎马未息即建太学，修国子监。天会七年（1129年），金兵入曲阜，命知县“引诣圣庙”，“登杏坛，望殿火奠拜”。
金朝统一北方后，进一步认识到崇儒之重要性。皇统元年（1141年），金熙宗拜祭上京（今黑龙江哈尔滨阿城）孔子庙。次年敕行台拨钱一万四千贯，修孔庙圣殿；皇统四年（1144年），又命“行省降钱一万四千五百贯，发南京入作司见材，修完孔庙，创盖大成殿”。至皇统九年（1149年），大成殿竣工。正隆二年（1157年），又以羡钱修两庑及齐国公殿。 [20] 此次维修，规模不大，被毁建筑尚未得到完全复建。大定十九年（1179年），衍圣公等又组织重建郓国夫人殿。
明昌二年（1191年），崇尚儒学的金章宗拨钱76400多缗，大修孔庙。此次大修，“三分其役，因旧以完葺者才居其一，而增创者倍之”，至明昌五年（1194年）方告竣。孔庙扩展到“殿堂廊庑门亭斋厨黉舍合三百六十余楹”的前所未有的规模。金朝的孔庙，基本保持了宋代格局，而部分建筑规模扩大，新建大中门、棂星门，且始用琉璃瓦，殿庑均以绿琉璃瓦剪边，青绿彩画，朱漆栏槛，檐柱亦改为石质，并刻龙为饰，使孔庙规格大大提高。有金一代，孔庙总共重修四次。
元世祖至元四年（1267年），身为曲阜县令的孔子五十三世孙孔治（北宗）主持对孔庙进行了维修。对大部分建筑还是按照旧制进行复新，将金朝时所建的庙宅外门封起来，另建庙学。至此，孔庙南北墙垣均长180米，东垣长360米，而西垣长370米。
元成宗时，孔庙复修，却将庙宅完全分离开来，形成各自独立的系统。元成宗大德十一年（1307年），追谥孔子为“圣文宣王”。因孔子被追谥为“王”，故将孔庙修建与王宫之制相同，元顺帝至元二年（1336年），孔庙的修缮工作完成。围墙四角增建的角楼与殿庞之上增设的装饰，都是为了王宫之制而设。
曲阜孔庙在明代基本形成了其最终的规模。明初至弘治年间，孔庙布局发生了巨大的变化，可以晚此时的孔庙达到了它的全盛时期。其中最重要的一次是明孝宗弘治十二年（1499年）。当时孔庙遭到雷击，大成殿等120余楹建筑化为灰烬。此次重修，总共历时五年，耗银15万两。
清代对孔庙的修建达14次。清世宗雍正二年（1724年），孔庙又毁于雷电火。“发帑金令大臣等督工监修，凡殿庑制度规模以及祭器仪物，皆令绘图呈览，亲为指授”，调集12个府、州、县令督修，总共用时六年方才完成。
千百年来，孔庙总共经历大修15次，中修31次，小修数百次，终于达到现如今九进庭院的宏大规模。
中华人民共和国成立初期的20世纪50年代，祭孔基本取消，但对曲阜孔庙进行数次局部修缮。1957年，山东省人民委员会将孔庙公布为山东省文物保护单位。1959年，曲阜对外开放。1961年，孔庙被中国国务院列入第一批全国重点文物保护单位名单。
文化大革命开始后的1966年11月9日，北京师范大学红卫兵领袖谭厚兰在康生（一说戚本禹、林杰）的授意下，率二百余人来到曲阜“破四旧”，冲破山东省委、曲阜县委和孔庙管理处的阻拦，进入孔庙驻扎，在当地召开“彻底捣毁孔家店大会”，随后进行了大规模有组织的破坏，孔子像、神龛、匾联、供桌等皆被砸烂，部分石碑被推倒折断，造成无可挽回的文物损失，更在中部的大中门前挖开一条通道，将孔庙截为两段。
1970年，在国务院的要求下，山东省派人赴曲阜察看破坏情况。其后，大成殿、杏坛、启圣王殿、寝殿等建筑得到维修。从1984年起，曲阜孔庙恢复了民间祭孔。中国大陆其他地区的祭孔活动陆续重新展开。
