电视动画《魔法禁书目录》改编自日本轻小说家镰池和马原作的同名轻小说。在2008年6月10日发售的《电击文库MAGAZINE Vol.2》上，发表了《魔法禁书目录》动画化的消息。电视动画自2008年10月4日开始播放，全24话。
第2期动画《魔法禁书目录Ⅱ》从2010年10月8日开始播出，全24话。剧场版动画《魔法的禁书目录：恩底弥翁的奇迹》于2013年2月23日在日本上映。外传动画《科学超电磁炮》和《科学超电磁炮S》分别于2009年10月2日和2013年4月12日开始播放。第3期动画《魔法禁书目录Ⅲ》于2018年10月播出。
故事讲述的是从东京都西部被分割出来的这座都市中，“超能力开发”被列为学校课程的一部分（学生作为人体科学实验对象）。在二百三十万人口中，有八成都是学生，所以被称为学园都市。他们每天都在超能力开发上进行相互竞争。根据能力高低不同，可以分为7级，从无能力（level0）到超能力（level5）（level6为绝对能力者）。故事的主角上条当麻是学园里的一个无能力者，但并非完全没有能力，他的能力是能够将一切异能之力无效化。他只有右手能够使用这种能力，还给自己的这种连上帝的奇迹都能抹杀的能力取名为幻想杀手（Imagine-breaker）。而正因为他的右手似乎把神的祝福都给抹杀掉的缘故，导致自己一直过著不幸的生活。某一个暑假的日子，在家里的阳台上，他遇见了一位修女；这位少女自称自己的名字叫“茵蒂克丝”（Index），并是从魔法的世界逃了出来，现在正在被魔法师追赶中。就这样，上条当麻一脚踏进了奇妙而美丽又黑暗的世界，开始了上条当麻与御坂美琴的战斗……掌握了十万三千本究极魔法书（魔导书）的少女与拥有抹杀一切奇迹的神上之手的少年，将面临一系列故事……
企划：川村明广、后藤靖彦、田口浩司、阿部伦久、三上康博、滨田直树
制片：中山信宏、三木一马、木村康贵、藤田敏
监督：锦织博
副监督：橘秀树
系列构成：赤星政尚
角色设计：田中雄一
道具设计：岩泷智
主动画师：川上哲也、山下祐
美术总监：黑田友范
美术指导：广濑义宪
色彩设计：安藤智美
摄影指导：福世普吾
剪接：西山茂（REAL-T)
音响总监：虾名恭范
音响制作：Delfi Sound
原创音乐：I've/井内舞子
音乐监制：西村润
拉丁语监修：Athenee Francais
动画制作：J.C.STAFF
动画制片：柏田真一郎
总制片：川濑浩平、松仓友二、小山直子
出品：PROJECT-INDEX（Geneon Entertainment、ASCII MEDIA WORKS、SQUARE ENIX、J.C.STAFF、AT-X、角川Mobile)
协力：电击文库编集部、电击文库MAGAZINE编辑部、月刊Comic电击大王编辑部、月刊少年GANGAN编辑部、Movie Gate、Quaras、石川功
上条当麻：阿部敦
茵蒂克丝：井口裕香
御坂美琴：佐藤利奈
一方通行：冈本信彦
神裂火织：伊藤静
史提尔·马格努斯：谷山纪章
土御门元春：胜杏里
御坂妹：佐佐木望
最后之作：日高里菜
姬神秋沙：能登麻美子
白井黑子：新井里美
月咏小萌：古山贵实子
风斩冰华：阿澄佳奈
网络广播节目《某“无线电”的禁书目录》于2008年9月19日-2009年5月1日期间在“Geneon-ent”网站放送，每周五晚19时更新，全32话。主持人是井口裕香和御坂美琴。内容收录在《魔法禁书目录》Blu-ray&DVD特典中。
第1回公开录音于2008年10月5日在秋叶原UDX举行的“电击文库秋之祭典”上举办（10月10日放送），第2回公开录音则于2008年12月30日在秋叶原アソビットシティ举办。
电视动画《魔法禁书目录》及其外传《科学超电磁炮》剧中现实舞台是在日本的多摩市和立川市，剧中场景大都以多摩中心车站周围与立川车站周边的景观为模型。多摩市和立川市的11个自治体和市民团体曾组成“多摩地域フィルムコミッション连络会”，并精心制作了《圣地导览》地图，并于在2011年1月15日公开免费发放。这份地图的正式名称为《学园都市広域详细地図》，粉丝昵称《学园都市MAP》，每日限定发放2000份，共计20000份，每份都有其编号，从御坂00001号到御坂20000号。在特点动画《茵蒂克丝炭4》中白井黑子也提及这份了《圣地导览》。
