民国初期称藏莲居士林，初创的庵堂，石屋一间，构筑简陋，开创者住于庵后独角麒麟大石下的石洞。清同治年间，有一惠来县严姓人氏住庵，扩建为石屋3间。民国初期，有石头圩商人陈竹头(占陇镇石港人)热心善事，将庵改建成一厅二房，并定名为“藏莲居士林”。
自1995年以来，寺院先后改建新建了慈悲娘殿、三圣殿、地藏阁、珍秀阁 、半天娘殿、南天门伯公宫，以及放生池、滴水观音、芝琴亭、万寿钟亭、综合大楼等众多硬件建设，也配套了交通、能源、通信、服务等的软件建设，使寺院的面貌发生了根本的变化。一批新的发展项目将按总体规划，精心组织实施，千方百计把藏莲寺建设得更加美好。
古寺地处“生态公益林保护区”和“三坑水资源保护区”，背靠崎岭头，面对铁山峰，龙盘虎距，狮象朝拱，钟山鼓山对峙，巨石天然，石洞幽深；清泉涓涓，曲径幽幽，山松谷竹，桃红李素，四时山花烂漫，处处佳果硕累。
景区地处“生态公益林保护区”和“三坑水资源保护区”之间，背靠崎岭头，面对铁山峰，龙盘虎距，狮象朝拱，钟山鼓山对峙，巨石天然，石洞幽深；清泉涓涓，曲径幽幽，山松谷竹，桃红李素，四时山花烂漫，处处佳果硕累。
景区内的藏莲寺历史悠久，创建于明朝隆庆4年（公元1571年），距今已有430多年，建有慈悲娘殿、三圣殿、地藏阁、珍秀阁、半天娘殿、南天门伯公庙等宗教建筑，每天香客络绎不绝，年接待人次达到100万以上。
据说革命战争年代，海陆丰苏维埃政权失败后，彭湃率工农红军在大南山山区坚持斗争。红军们经常活动在百二丘田的山林中，在山林山洞中召开了多次会议。
曾有村民在山洞中捡到一支驳壳枪，后送红宫展览。该景区是一处难得的爱国主义教育基地。
自2015年起，普宁市百二丘田旅游景区全面启动国家3A级旅游景区创建工作，在揭阳市、普宁市两级旅游主管部门的指导下，充分发挥自身生态旅游、宗教旅游和红色旅游等资源优势，严格对照国家3A级旅游景区的创建标准和质量要求，加大资金投入，建设完善景区标识系统、游客服务中心、停车场、旅游厕所和管理队伍等旅游公共服务配套，景区的服务质量、环境质量和景观质量得到了明显提升。
根据中华人民共和国标准《旅游景区质量等级的划分与评定》和国家旅游局《旅游景区质量等级评定管理办法》的有关规定，该景区达到相关标准要求，被评定为国家3A级旅游景区。
