新疆维吾尔医学专科学校是一所公办全日制普通医学类专科学校，位于新疆维吾尔自治区和田地区和田市。学校于1984年9月经自治区人民政府批准成立，1987年开始招生，1989年教育部（原国家教委）正式备案。
学校秉承“博学精术，爱国济民”的校训，始终坚持社会主义办学方向，以立德树人为根本任务，把办好党和人民满意的医学类院校教育作为出发点和落脚点，将“培养什么人、为谁培养人、怎样培养人”的理念贯穿教育教学全过程，教育引导学生为南疆医药卫生事业建功立业。学校扎根和田，面向南疆，服务全疆各族群众，培养了数万名各民族优秀基层医药人才，为守护南疆各族人民生命健康，为南疆地区社稳定、边疆巩固、经济发展、文化繁荣、人才培养、科学研究、医疗服务、民生福祉做出了积极贡献。
学校占地总面积2762亩，其中主校区70亩，药材基地1280亩，附属医院30亩，新校区1382亩（含直属药厂164亩）。学校下设4个系部，设有护理学、医学检验技术、康复治疗技术、助产、医学影像技术等7个专业。学校现有实验室19个、附属医院3个、附属药厂1个，校外实践实训场所有实习医院36个和实习药厂5个。
学校现有学生4428名，生源有来自全国各省市的汉、维吾尔、回、柯尔克孜、蒙古、苗、塔吉克、土家、乌兹别克、彝、壮、藏、东乡、哈萨克、仡佬等15个民族的学生。学校生源组成情况为65%学生来自南疆，35%来自东疆、北疆和部分内地省份。
学校坚持以教师为本、以学生为本，不断强化教学中心地位，着力深化教育教学改革，狠抓内涵建设， 不断提高人才培养质量。高度重视构建校企结合、工学结合的人才培养模式，维医学专业形成“理实一体能力递进”人才培养模式，维药学形成了“一链、三段、五 模块”人才培养模式。学校近年来，建成了《维医内科学》、《维医生药学》2门自治区级精品课程。学校在2009年顺利通过教育部人才培养水平评估。学校承担国家级、自治区级科研课题共19项，其中“爱维心口服液临床作用与产业化研究”课题于2009年荣获自治区科技进步奖。为了更好地做好科学研究工作，学校成立了维医药研究所、维医药职业教育研究所和维医药文献研究所，积极争取承担国家级、自治区级科研课题。学校同时为了更好地打造学术研究交流平台，学校创办维医药学学术性刊物《新疆维吾尔医学专科学校学报》23年，共出版105期。学校2010年维医药被定为国家级非物质文化遗产，学校被定为非物质文化遗产保护单位。学校整理、出版10余部古籍文献。学校编写出版了26种教材，形成了维吾尔医医、药学大专第二版教材体系，现与新疆医科大学合作编写维吾尔医医、药学本科教材。
1984年，在内蒙古呼和浩特召开的全国第二次民族医药工作会议提议成立新疆维吾尔医学专科学校。同年九月，经新疆自治区人民政府批准。
1985年，开始筹建。
1987年，开始招生。
1989年，经教育部（原国家教委）正式批准成立。学校的成立实现了维吾尔医医药学教育从传统的师带徒方式向正规化现代高等教育方式的转变，在维吾尔医药学教育发展史上揭开了新的篇章。
2006年底，和田卫校整建制并入新疆维吾尔医学专科学校。
2011年9月，学校从自治区卫生厅归口至自治区教育厅管理。学校现隶属于自治区教育厅，受自治区教育厅及和田地区行署双重管理。
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