江苏省常州市儿童医院(南通大学附属常州儿童医院)现有本部和博爱两个院区。本部位于常州东门秀丽的天宁名胜风景区，东近东坡公园，西临红梅公园，与千年古刹天宁禅寺毗邻，门急诊病房综合大楼与文笔塔比肩而立，风景秀丽，环境宜人，承担主要的医疗任务。博爱院区主要作为实习生、见习生的生活区及医院部分后勤保障区所使用。
江苏省常州市儿童医院(南通大学附属常州儿童医院)现有职工600余人，其中中高级职称280多人，拥有一批省市著名儿科专家和省“333”高层次人才、市医学领军人才、市拔尖人才、市突出贡献人才等各类人才培养工程对象。
江苏省常州市儿童医院(南通大学附属常州儿童医院)新生儿科成为省级临床重点专科，儿童保健科为江苏省妇幼健康重点学科，儿内科为常州市医学重点学科，40多人分别担任省、市医学会各专业委员会委员。实际开放床位500张，共设11个病区。4个市级临床重点专科小儿心脏专科、小儿普外科、小儿呼吸内科、小儿神经内科，以及重症医学科、脑瘫康复等专业在省内也有较高知名度。
江苏省常州市儿童医院(南通大学附属常州儿童医院)内设常州市儿童急救分站，拥有一支儿童危重症ECMO应急救援队，是省残疾孤儿手术康复“明天计划”定点医院、市小儿心脏手术救助定点医院、市儿童手足口病及甲型H1N1流感等疾病的定点救治医院，在儿童危急重症病人的抢救上具有较强的实力。医院现有3个研究所、3个中心和2个基地，分别是市气管炎研究所、南通大学儿童脑认知和行为医学研究所以及院呼吸健康研究所、市儿童健康研究中心、市新生儿危急重症救治中心、市儿童内镜中心、北京师范大学情绪调节研究中心儿童心理研究实践基地、市脑瘫儿童康复实验基地。医院拥有64排螺旋CT、纤维支气管镜、彩超、DR、全套内窥镜、视频脑电图机等配套诊疗设备，一大批项目分获国家自然科学基金和省、市科技进步奖和新技术引进奖。
江苏省常州市儿童医院(南通大学附属常州儿童医院)新生儿科：江苏省临床重点专科、国家级青年文明号、国家级巾帼示范岗、省“五一”劳动先进标兵。新生儿科为无陪高危病区，内设NICU，在新生儿危重症的抢救如重症肺炎、胎粪吸入综合征所致呼吸衰竭，持续胎儿循环、感染性休克、DIC、肺出血、重度窒息、多脏器损伤综合治疗，极低出生体重儿系统治疗、重度黄疸换血治疗等方面积累了丰富的临床经验。在常州率先开展新生儿急救转运，承担常州及周边地区新生儿的转运工作，为新生儿救治开辟了绿色通道。
医院小儿外科：常州市临床重点专科，作为常州市小儿外科领域的专科，科室承担着全市及周边地区小儿外科的医疗、教学、科研、疑难重症的诊治和抢救工作。成功开展同种异体原位肝移植，在国内儿童医院尚属首例，也为今后开展儿童亲肝移植奠定了基础。在全市率先开展小儿腹腔镜手术。科室有小儿普通外科、新生儿外科、烧伤整形科、小儿泌尿外科等专业组。小儿普外及新生儿外科在对先天性巨结肠、巨结肠同源性疾病的诊治方面处省内领先水平，小儿肠套叠空气灌肠及复杂先天性畸形的手术治疗，常州地区仅我院能成功开展。小儿泌尿外科在先天性尿道下裂、先天性肾积水、肾盂输尿管各种畸形及肾母细胞瘤等疾病诊治水平处于全省先进水平。先天性尿道下裂的一期成形术成功率达到国内先进水平。
医院小儿心脏科：现为常州市小儿心脏临床重点专科。科室常规开展各种婴幼儿先天性心脏病手术、儿童普通胸外科手术。同时，参照目前国内外先进模式，科室做到小儿心内、外科、监护无缝合作。10多年来共开展各类小儿先心病手术近400例，包括：房间隔缺损修补术、室间隔缺损修补术、动脉导管结扎术、法乐氏四联症矫治术等。手术成功率达97%以上，最小手术年龄仅出生后20天，技术水平达到国内同专业先进水平。普胸外科能完成各种肺、食管、纵膈手术以及微创漏斗胸矫治术。心内科开展小儿心律失常、心肌炎、心肌病及川崎病等心脏疾病的诊断治疗。已在核心期刊上发表论文9篇，其中中华级论文1篇，已完成“自体骨髓间充质干细胞治疗心功能衰竭的临床及基础研究”等省市级课题4项。
医院小儿呼吸科：常州市临床重点专科，内设东西两个病区。以治疗喘息性疾病为主，其中哮喘病治疗方案与国际先进方法接轨，是常州市诊断及治疗哮喘较为系统、全面的专科，拥有国内先进的耶格牌小儿肺功能测定仪，可对包括新生儿在内的各年龄段儿童及成人进行肺功能测定，对儿童哮喘的诊治观察与预后提供量化指标，并已开展变应原检测试验、儿童支气管镜检查治疗等技术。小儿呼吸科下设普通门诊、专家门诊和呼吸病房，另设有肺功能室、雾化吸入室和脱敏治疗室。开展纤维支气管镜（经气管镜细胞刷检和支气管肺泡灌洗检查）对呼吸道疾病诊断和治疗。充分应用呼吸道病原学检测、纤维支气管镜及机械通气等方面的综合优势，在呼吸系统疾病方面形成了一整套规范有效的治疗措施。
医院小儿神经科：常州市临床重点专科，科室以癫痫病的诊治为主要特色，根据儿童特点开展各种脑电图诱发试验检查及长程脑电监测，从而提高了儿童癫痫诊断的符合率，为鉴别诊断、临床分型及药物选择提供帮助。主要诊治小儿神经系统感染性疾病、神经免疫性疾病、癫痫及惊厥性疾病、运动障碍、脑血管病、发育障碍及脊髓、小脑、脑干、周围神经病变，智力低下，心因性疾病，多动症、各种瘫痪性疾病、语言发育迟缓的诊断及治疗。
医院重症医学科：承担着全院重危病人的抢救、器官功能支持及监护治疗工作。是我院技术装备最为先进，力量最为雄厚的科室之一。自1999年建科以来，抢救各类重危患者近3000例，成功率达95%以上。病种包括常见的婴儿肺炎呼衰、中枢神经系统感染、暴发性心肌炎、多器官功能衰竭、急性肾功能衰竭、重症胰腺炎、重症手足口病以及各类重大手术后病情处于极其危重状态的患者，如先天性心脏病体外循环手术后等。常规开展的技术项目有血流动力学监测、呼吸力学监测及功能支持、肠道内外营养支持等。近年来通过全科医护人员的不断努力，儿童医院重症监护室已成为常州及周边地区区域性的重危病人抢救基地。
医院小儿消化感染科：常州市的小儿消化感染专科。具有较强的专业诊疗技术平台，如电子胃肠镜室、肛门直肠测压室，幽门螺杆菌碳-13呼气试验室，PCR实验室，血培养室和化验、放射、彩超等先进辅助检查设备。下设消化感染病区、感染科门诊、消化科门诊，擅长诊治儿科急慢性感染性疾病及消化系统疾病。对疑难病、危重病如急慢性胰腺炎、中毒型痢疾、消化道大出血、急性出血坏死性小肠炎等疾病的诊治亦具有丰富经验。发表论文10余篇，完成10余项科研工作，并获市级“发明创造成果优秀奖”一项，获市级“新技术引进三等奖”一项。
医院小儿肾脏血液肿瘤科：病区分肾脏系统、血液系统两个专业组，设有血液病实验室，拥有各种先进的诊断及治疗设备，24小时动态心电图（Holter）、超声心动图、动态血压监测、床边多参数心电监护、美国巴德肾脏穿刺设备等。以诊治小儿血液系统疾病为主，如各种先天性红细胞疾病及出血性疾病，如贫血、血友病、特发性血小板减少性紫瘢等，在小儿特发性血小板减少性紫瘢的治疗中采用大剂量肾上腺皮质激素冲击疗法，短时间内使出血减轻，有效地减少了由于严重出血而造成的合并症及死亡率；在治疗白血病、特别是在治疗急性淋巴细胞白血病过程中，不断改进治疗方案，与国际接轨。此外还诊断及治疗其他小儿血液系统相关疾病，如不明原因肝脾淋巴结肿大。
医院儿童康复科：常州市脑瘫儿童康复实验基地。科室拥有一批国内外先进的康复仪器设备。主要开展的项目有：儿童专用水疗、经颅磁刺激、肌电生物反馈治疗、感觉统合治疗，对缓解肌肉痉挛、改善循环、调节呼吸频率、增加关节活动度，增加肌力，改善协调性，提高平衡能力，纠正步态等起到良好的效果。经过多年的发展，专科不断壮大，引进了一批专业的康复技术人员，吸引了常州地区稳定的服务对象，给康复患儿家庭带来了希望。
医院儿童健康研究中心：医院独具特色的部门之一，以儿童专病治疗研究为特色，分别开设了多动症门诊、抽动症门诊、儿童心理门诊等诊室。采用多种治疗方法，开展生物反馈、沙盘、感觉统合训练、学习训练等；根据病情由专业医师建议药物治疗；开展心理治疗，对品行障碍、对立违抗及厌学等行为进行较好的纠正。结合儿童生理及心理个体发展变化的特征，通过科学的调查研究，举办特色“家长指导班”，指导家长及老师挖掘儿童潜能，发现儿童的特长，更好地培养儿童多方面的能力。已完成二项国家自然基金；一项国家计生委课题；一项国家计生委课题；还承担了国家科技基础性工作专项子课题等的研究，并已获多项研究成果；已发表SCI、中华级别等一系列学术论文，在国内具有一定的影响力。2014年、2018年分别获江苏省医学新技术引进奖一等奖。
（以上数据来源官网，数据截止至2020年6月）
