1986年，出演个人第一部电影——科幻片《太空险航》。1995年，与妮可·基德曼合作出演由格斯·范·桑特执导的惊悚片《不惜一切》。1997年，与珍妮弗·康纳利合作出演以成长、抱负与爱情为主题的爱情片《爱的秘密》，杰昆·菲尼克斯扮演了一位追求真爱的热情青年。同年，出演由奥利弗·斯通执导的惊悚爱情片《U形转弯》，扮演克莱尔·丹尼丝醋意十足的男友。
1999年，与尼古拉斯·凯奇合作出演由乔·舒马赫执导的惊悚片《8毫米》。2000年，与罗素·克劳合作出演动作片《角斗士》，饰演阴险狠毒，野心勃勃的罗马皇帝一角，并凭借此片获得第73届奥斯卡金像奖最佳男配角提名。同年，与杰弗里·拉什、凯特·温斯莱特联袂出演文艺片《鹅毛笔》，在片中饰演一个信仰坚定而纯洁，但由于痛失爱人而迷失于欲望和仇恨当中的青年神父。
2001年，与艾德·哈里斯、斯科特·格林联合主演犯罪战争片《惊爆前线》。2002年，与梅尔·吉布森合作出演由M·奈特·沙马兰执导的科幻片《天兆》，饰演爱好体育运动，但是并不擅长的梅里尔·海斯。2003年，与理克·莫兰尼斯、杰瑞尼·舒瓦兹联袂为家庭动画片《熊的传说》配音，配音的角色为喜欢惊险刺激的生活的Kenai。
2004年，与唐·钱德尔、苏菲·奥康内多联袂出演以卢旺达大屠杀为背景的惊悚恐怖片《卢旺达饭店》，饰演将胡图人的种种暴行收录在胶片上的杰克。同年，与阿德里安·布洛迪、布莱丝·达拉斯·霍华德联袂主演惊悚悬疑片《神秘村》，饰演希望可以迈出村庄边界的卢修斯·亨特。此外，还与约翰·特拉沃尔塔、杰茜达·芭瑞特联袂主演动作片《云梯49》，饰演一名出色的消防战士杰克·莫里森。
2005年，与瑞茜·威瑟斯彭、罗伯特·帕特里克联袂主演音乐传记片《与歌同行》，杰昆·菲尼克斯在该片中饰演美国传奇乡村歌手约翰尼·卡什，为了能更好地在片中表演和演唱，菲尼克斯接受了为期6个月的音乐训练，并凭借此片获得第78届奥斯卡金像奖最佳男主角提名。
2007年，与马克·沃尔伯格、罗伯特·杜瓦尔联合主演犯罪惊悚片《我们拥有夜晚》，饰演为俄罗斯商人打理着一家大型俱乐部的老板鲍比。同年，与马克·鲁弗洛、詹妮弗·康纳利联袂主演根据约翰·伯翰·斯瓦茨的同名小说改编的犯罪惊悚片《冲击之路》，饰演大学教授伊桑·勒纳。
2008年，与格温妮丝·帕特洛、凡妮莎·肖联合主演以纽约布莱顿海滩的犹太人社区为背景的爱情片《两个情人》，饰演不善言辞、撒荒成性、毫无担当的莱昂纳德，该片入围第61届戛纳电影节主竞赛单元。2010年，主演由卡西·阿弗莱克执导的伪纪录片《我仍在这里》。
2012年，与菲利普·塞默·霍夫曼等主演以20世纪50年代的美国为背景的剧情片《大师》，饰演对酒精有严重依赖的弗莱迪·奎尔，他凭借此片获得第69届威尼斯国际电影节沃尔皮杯-最佳男演员奖。
2013年，与斯嘉丽·约翰逊、艾米·亚当斯联合主演科幻爱情片《她》，饰演一名孤独内向的男子西奥多·托姆布里，并凭借此片获得第71届美国金球奖音乐喜剧类最佳男主角提名、第40届土星奖最佳男主角提名。
2014年，与乔什·布洛林合作主演根据托马斯·品钦同名小说改编的喜剧犯罪片《性本恶》，饰演一身嬉皮士打扮的私家侦探多克，并凭借此片获得第72届美国金球奖电影类-音乐喜剧类最佳男主角提名。
2015年，与艾玛·斯通合作主演由伍迪·艾伦执导的喜剧片《无理之人》，饰演深信生活经验比书本知识更重要的教授艾伯。2017年，与亚历桑德罗·尼沃拉主演剧情片《你从未在此》，饰演饱受战后创伤后遗症困扰的老兵乔，并凭借此片获得第70届戛纳国际电影节主竞赛单元最佳男演员奖。
2018年，与鲁妮·玛拉主演宗教片《抹大拉的玛丽亚》，饰演耶稣。同年，还主演了传记片《别担心，他不会走远的》，饰演四肢瘫痪的漫画家约翰·卡拉汉。同年，与约翰·C·赖利、杰克·吉伦哈尔合作主演由雅克·欧迪亚执导的西部片《希斯特斯兄弟》。
2019年10月4日，与布莱特·卡伦、罗伯特·德尼罗合作主演由托德·菲利普斯执导的电影《小丑》在美国上映；11月，凭借主演的电影《小丑》获得第31届棕榈泉国际电影节“主席奖”。
小丑2019
饰演Arthur Fleck / Joker 导演托德·菲利普斯 主演布莱特·卡伦, 罗伯特·德尼罗
希斯特斯兄弟2018
饰演Charlie Sisters 导演雅克·欧迪亚 主演约翰·C·赖利, 杰克·吉伦哈尔
别担心，他不会走远的2018
饰演John Callahan 导演格斯·范·桑特 主演鲁妮·玛拉
抹大拉的玛丽亚2018
饰演Jesus 导演加斯·戴维斯 主演鲁妮·玛拉
你从未在此2017
饰演Joe 导演琳恩·拉姆塞 主演亚历桑德罗·尼沃拉
无理之人2015
饰演Abe 导演伍迪·艾伦 主演艾玛·斯通
性本恶2014
饰演Larry "Doc" Sportello 导演保罗·托马斯·安德森 主演乔什·布洛林
她2013
饰演Theodore 导演斯派克·琼斯 主演斯嘉丽·约翰逊
Still the Beaver1989
饰演Kyle Cleaver
少年超人1989
饰演Billy Hercules
Alfred Hitchcock Presents 1986
饰演
Pagey Fisher
Morningstar/Eveningstar1986
饰演Doug Roberts
她书写谋杀1984
饰演Billy Donovan
ABC Afterschool Specials1984
饰演Robby Ellsworth
The Fall Guy1984
饰演Kid
希尔街的布鲁斯1984
饰演Daniel
▪ 2013 第85届奥斯卡金像奖最佳男主角奖 《大师》 （提名）
▪ 2006 第78届奥斯卡金像奖最佳男主角奖 《与歌同行》 （提名）
▪ 2001 第73届奥斯卡金像奖最佳男配角奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2020 第77届美国电影电视金球奖电影类-剧情类最佳男主角奖 《小丑》 （提名）
▪ 2015 第72届美国电影电视金球奖电影类-音乐喜剧类最佳男主角奖 《性本恶》 （提名）
▪ 2014 第71届美国电影电视金球奖电影类-音乐喜剧类最佳男主角奖 《她》 （提名）
▪ 2013 第70届美国电影电视金球奖电影类-剧情类最佳男主角奖 《大师》 （提名）
▪ 2006 第63届美国电影电视金球奖电影类-音乐喜剧类最佳男主角奖 《与歌同行》 （获奖）
▪ 2001 第58届美国电影电视金球奖电影类-最佳男配角奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2012 第69届威尼斯国际电影节沃尔皮杯-最佳男演员奖 《大师》 （获奖）
▪ 2017 第70届戛纳国际电影节主竞赛单元-最佳男演员奖 《你从未在此》 （获奖）
▪ 2013 第66届英国电影学院奖最佳男主角奖 《大师》 （提名）
▪ 2006 第59届英国电影学院奖最佳男主角奖 《与歌同行》 （提名）
▪ 2001 第54届英国电影学院奖最佳男配角奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2006 第15届MTV电影奖最佳表演奖 《与歌同行》 （提名）
▪ 2001 第10届MTV电影奖最佳电影台词奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2001 第10届MTV电影奖最佳反派奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2008 第34届人民选择奖最受欢迎男主演奖 （获奖）
▪ 2014 第40届土星奖最佳男主角奖 《她》 （提名）
▪ 2005 第7届青少年选择奖最佳剧情电影男演员奖 《云梯49》 （提名）
▪ 2020 第26届美国演员工会奖电影类最佳男主角奖 《小丑》 （提名）
▪ 2006 第12届美国演员工会奖最佳男主角奖 《与歌同行》 （提名）
▪ 2005 第11届美国演员工会奖最佳群戏奖 《卢旺达饭店》 （提名）
▪ 2001 第7届美国演员工会奖最佳男配角奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2001 第7届美国演员工会奖最佳群戏奖 《角斗士》 （提名）
▪ 2020 第25届评论家选择奖最佳男主角奖 《小丑》 （提名）
▪ 2013 第18届评论家选择奖最佳男主角奖 《大师》 （提名）
▪ 2006 第11届 美国广播影评人协会奖最佳男主角奖 《与歌同行》 （提名）
▪ 2001 第6届 美国广播影评人协会奖最佳男配角奖 《角斗士》、《鹅毛笔》、《家族情仇》 （获奖）
▪ 2005 第9届好莱坞电影奖年度最佳男演员奖 《与歌同行》 （获奖）
杰昆·菲尼克斯的身上总缺少像他这个年纪的青春演员的那份阳光与朝气，他的沧桑感和颓丧感与生俱来、如影随行。尽管他看起来并不老，然而从他那双深邃的眼睛里，你却总能捕追到太多关于人性的神秘与深刻。在这一部部也许不那么完美影片中，杰昆·菲尼克斯也在不断成长。我们并不能预测他在以后的岁月里是否能成为世界影坛中耀眼的明星，但我们确实知道，他是一方值得我们期待的天空（新浪娱乐评）。
杰昆·菲尼克斯是好莱坞的一个异类，他总爱演一些别扭的古怪的极端的或是变态的角色，但出众的演技还是深受导演和影迷喜爱，可他从不理奥斯卡。他动不动就说要息影，歇了几年又总会回归。他总是张牙舞爪，过着放肆不羁的生活，但他阴郁的眼睛暗藏着忧伤，不那么挺拔的背影写着孤独。他演的角色常常让人寒毛倒竖，他生活中的样子也没有太多人会喜欢，但所有的害怕与不喜欢，都是因为不懂。杰昆就是拥有这样的天赋和爆发力，震慑住所有优秀同行。他喜欢演这类“不正常”的角色，也很擅长这类角色（凤凰网评）。
