由上海交通大学医学院附属仁济医院、宁波市第二医院和宁波杭州湾新区管委会合力打造的一家非营利性三级甲等综合性医院。医院位于浙江省宁波市的杭州湾新区，属于上海、杭州、苏州、宁波等大城市集合中心，在一个半小时交通圈内，拥有上海浦东、上海虹桥、杭州萧山、宁波栎社四大国际机场，以及上海、宁波两大国际港口，区位条件优越。1小时车程内覆盖人口2000万，2小时车程内覆盖人口9000万，3小时车程内覆盖人口超1.8亿。
医院总投资14.5亿元，总建筑面积近20万平方米，设计床位1200张，是宁波市已建成投用的单体投资额最高的医院。医院建筑根据二星级绿色建筑标准建设，将门诊、急诊、住院大楼统一规划，一次性建成。有利于打造“一站式”全程医疗服务模式，最大限度地提供患者就诊的便利。作为医保定点单位，医院开业首期将计划设置临床科室33个，重点打造消化內科、肾脏科、心内科、泌尿科、风湿科、神经外科、妇产科、骨科、普外科等学科。上海仁济医院将派驻七十多位专家，宁波市第二医院将派驻百余位专家，加入科室建设过程。
开业初期，上海仁济医院将派驻70余名专家，宁波市第二医院将派驻百余名专家，加入初期的科室建设过程中。医院试运营后，上海仁济医院和宁波二院将派驻近200位名医专家常驻。
初期，医院计划设置病房科室23个、门诊科室33个、急诊科室16个，开放病床600张，重点打造消化内科、肾脏科、泌尿科、风湿科、神经外科、妇产科、骨科、普外科等科室。
医院已成功申请128排CT，拥有高端48通道1.5T核磁共振、大平板数字减影血管造影机（DSA）、全数字化乳腺钼靶机、对病床进行清洗杀菌的洗床中心、气动管道物流传输系统等高科技医疗设备。气动管道物流传输系统集合现代通讯技术、光机电一体化技术于一体，可将医院的多个部门，如:门诊、医药、手术室、化验室、血库、医技、住院部各个护士站、中心供应室，通过一条专用管道连接在一起。
2014年，宁波杭州湾医院正式启动建设工作，项目总投资14.5亿元，总建筑面积为19.65万平方米，设计床位1200张。
2015年6月，宁波市第二医院与杭州湾新区管委会签署了合作办院协议，对杭州湾医院的全面托管，杭州湾医院也由此挂牌“宁波市第二医院杭州湾院区”。
2017年5月，在国家卫计委召开的“沪苏浙皖闽”综合医改联席会议上，宁波杭州湾新区管委会、宁波市第二医院又与上海交通大学医学院附属仁济医院正式签订三方合作协议，跨省合作办院，挂牌“上海交通大学医学院附属仁济医院宁波医院”。
2018年12月26日，上海交通大学医学院附属仁济医院宁波医院、宁波市第二医院杭州湾院区、宁波市杭州湾医院开业试运营 。
2019年3月1日起，医院将全面运营，包括门诊、急诊和手术住院（期间逐渐开放部分病房和择期手术）。
