南矶山省级自然保护区位于新建县境内的鄱阳湖区，保护区总面积3.33万公顷，核心区2000公顷，是至今为止鄱阳湖区内面积最大的自然保护区（面积超过鄱阳湖国家级自然保护区）。南矶山自然保护区地广人稀，自然资源极为丰富，有高等植物约600种、鸟类310种、鱼类139种、贝类80余种、虾蟹类20余种。湖区内分布的大片苦草、野荸荠等，为冬候鸟提供了丰富的食物。植物群落主要在扁蓄廖群落、苔草群落、野荸荠群落、芦苇群落、南获群落等，成为越冬候鸟良好的藏身息地。每年10月至次年4月，都有数以十万计的候鸟在湖区越冬，其中有白鹤、白鹳、黑鹳、小天鹅、白额雁等48种国家重点保护的野生动物，有鸿雁、豆雁、灰雁、小白额雁、鸬鹚、苍鹭、绿翅鸭、赤麻鸭等90余种省级重点保护的动物。
南矶山周围有常湖、流湖、菱湖、东湖、神塘湖等浅水湖及湖滩草洲，随着季节性湖水落，一年一度水陆相互交替，具有典型的江南水乡泽国的地貌景观，在以长江中下游，以南支，西支，中支，北支，以此形成了一个典型的湿地景观。
在中国第一大淡水湖--鄱阳湖近西南岸的湖域中，有一座形似凤凰的小岛，名叫南矶山，距南昌市区60公里。这座美丽的小岛，每年春夏湖水上涨，四周一片汪洋，站在岛上犹如置身于大海之中。秋季开始至次年春初，湖水下退，河溪纵横交错，湖泊星罗棋布，水草碧绿如茵，且有大量鱼虾，螺蚌滞留浅滩，为白鹤等候鸟提供了丰富的饵料。这里气候适宜，水质纯洁，环境寂静，是白鹤等珍禽候鸟理想的越冬栖息场所。
每逢金秋十月，数以万计的各种越冬候鸟由北国南来，在南矶山周围的常湖、菱湖、北甲湖、东湖、神塘湖里盛会，翌年春暖花开时，又结队迁徒北飞；而夏候鸟，如家燕、白鹭等，则又来此湖地栖息繁衍。据观察记录，鸟类有280余种，水禽达115种。其中有国家一、二级保护动物，如白鹤、白鹳、黑鹳、大鸨、丹顶鹤、天鹅、鹈鹕、白枕鹤、白额雁、白琵鹭、鸳鸯、金雕、海雕、中华秋沙鸭等50余种。每当旭日东升，在广阔的湖边沼泽地上，成群结队的白鹤素裳婷立，在阳光下银光闪闪，宛如珍珠撒满云水天间，“咯噜噜、咯噜噜”的宏亮鹤鸣悠扬高亢，连绵不断，十分壮观，使人流连忘返。
作为全球水鸟迁徙线路中继站的南矶山国家级湿地自然保护区内，各种候鸟成群嬉戏，自由飞翔。优良的自然环境、丰富的物种资源使保护区成为候鸟的乐园。
鹤声阵阵、万羽竞翔、鸟唱水吟，美不胜收。据不完全统计，保护区鸟类约215种，其中国家一级、二级保护鸟类就有28种。数量在10万羽以上。国家一级保护的候鸟有白鹤、白头鹤、黑鹳、东方白鹳、金雕等；国家二级保护的候鸟有小天鹅、白额雁、白琵鹭、灰鹤等，这些候鸟每年9、10月份从西伯利亚以及新疆等地迁徙到南矶山湖区，将在这里度过一个暖和的冬天，直至第二年3月才会离开。其中白鹤是一种大型迁徒性涉禽，体长约一点五米，体重可达10公斤，全身羽毛纯白，神话中谓之仙鸟，历被人们作为吉祥、长寿、和平与安全的象征。白鹤是世界上已濒临绝迹的珍禽。
南矶山是个具有多种功能的自然保护区，其主要表现在四个方面：
一.具有蓄洪作用。由于保护区自然景观保护完好，没有修筑圩堤，因而具有较强的蓄洪能力。保护区内平均海拔高度为17米，按90年代的几次洪水位约22米计，保护区3.33万公顷范围可蓄洪水约17亿立方米。
二.具有生物多样性的保护功能。由于保护区为地广人稀的湖区，人为破坏的因素极小，因而生物资源丰富，对生物的多样性具有得天独厚的保护功能。
三.具备优越的候鸟栖息条件。适应的栖息环境，正在吸引越来越多的候鸟在此越冬。
四.具有较高的生态旅游价值。保护区内自然景观优美，又依傍省会城市，随着交通条件的改善，正吸引越来越多的游人来此观光（距南昌市60公里，公路从湖区穿过，在路旁也能看候鸟），每年约2000人到南矶山看鸟。
