麝香龟背甲上具有棱突(幼体尤为明显),椎盾呈覆瓦状;棕色或橙色,接缝处有深色的镶边;可能有深色的点状或辐射条纹状的图案。腹甲小,粉红色或黄色,有一个不甚明显的铰链关节,和单枚的喉盾。仅在下巴上长有触须。头部有深色的斑点或条纹。雄性具有末端呈刺状的大尾巴;而雌性尾巴的末端,仅只刚刚能够到背甲的边缘。
麝香龟是典型的杂食性动物,举凡植物、甲壳类、小鱼、昆虫甚至是动物残骸等无所不吃。不过它们的觅食主要是在水底的污泥上进行,因为它们是极少离开水面的。麝香龟的名字来自于此类龟的一个共同的特性,当它们受到惊扰时都会由射香腺释放出一种味道刺鼻的液体,以吓阻略食者,而且雄龟也特别具有攻击性。麝香龟是属于夜行性的龟类,白天多埋身泥底休息到黄昏时才开始活动,觅食通常不会游泳而是在水底行走长时间生活在水底,也造成龟壳上长满藻类,当温度低于10°C时它们会进入水底污泥中冬眠。