狮子航空总共飞航55个国内航点以及6个国际航点。
印尼国内
爪哇岛
万隆 - 万隆国际机场
雅加达 - 苏加诺－哈达国际机场 (总部)
三宝垄 - Achmad Yani Airport
梭罗市 - 梭罗国际机场
泗水 - 朱安达国际机场 (枢纽)
日惹 - 日惹国际机场
加里曼丹
巴厘巴板 - Sepinggan International Airport
马辰 - Syamsudin Noor Airport
帕朗卡拉亚 - Tjilik Riwut Airport
坤甸 - 坤甸机场
塔拉卡恩 - Juwata Airport
小巽他群岛
毕马 - Bima Airport
登巴萨 - 伍拉·赖国际机场
古邦 - El Tari Airport
马塔兰 - Lombok International Airport
三巴望博沙 - Sumbawa Besar Airport
摩鹿加群岛
安汶 - Pattimura Airport
德那第 - Babullah Airport
土奥 - Tual Airport
托贝娄 - Tobelo Airport
新几内亚
法克法克 - Fakfak Airport
查雅普拉 - Sentani Airport
凯马那 - Kaimana Airport
那比尔 - Nabire Airport
索隆 - Sorong Airport
苏拉威西
哥伦打洛市 - Jalaluddin Airport
肯达里 - Wolter Monginsidi Airport
望加锡 - 望加锡国际机场
万鸦老 - 萨姆·拉图兰吉机场
帕卢 - Mutiara Airport
塔胡那 - Tahuna Airport
马穆朱 - Tampa Padang Airport
克拉卡 - Kolaka Airport
巴务巴务市 - Bau-Bau Airport
苏门答腊
班达亚齐 - 班达亚齐机场
占碑 - Sultan Thaha Airport
巴淡岛 - Hang Nadim Airport
明古鲁 - Fatmawati Soekarno Airport
棉兰 - 棉兰国际机场
巴东 - Minangkabau International Airport
巨港 - Sultan Mahmud Badaruddin II Airport
邦加槟港 - Depati Amir Airport
班达楠榜 - Radin Inten II Airport
北干巴鲁 - Sultan Syarif Kasim II Airport
丹戎槟榔 - Raja Haji Fisabilillah International Airport
国际
马来西亚
吉隆坡、槟城
新加坡
新加坡
越南
胡志明市
沙特阿拉伯
吉达、麦地那
中国上海
1999年，印尼狮子航空成立。
2000年6月，开始运营，首条航线雅加达--登巴萨。
2003年，其全资子公司Wings Air成立，主要运营低客量航线，使用机型为ATR72。
2007年，因安全运营问题，欧盟向包括狮子航空在内的多家印尼航空公司发出禁飞令，直至2009年取消。
2012年，在马来西亚成立了马印航空。
2013年，泰国狮子航空及巴泽航空（BatikAir）成立，总部分别为曼谷和雅加达。
专门服务于东南亚如印度尼西亚、马来西亚、新加坡；中东地区的国家如沙特阿拉伯以及澳大利亚等地之间的航线。其总部设在雅加达苏卡诺-哈达国际机场，次要转运点是泗水朱安达国际机场及峇里岛伍拉·赖国际机场。其下属子公司有Wings Air、马印航空、泰国狮子航空、BatikAir等。其中，巴泽航空（BatikAir）为全服务航空公司。
狮航提供前往36个目的地的航线，每天有高达226个航班。
印尼：安汶、亚齐、巴厘巴板、马辰、巴淡岛、明古鲁、登巴萨、哥伦打洛、占碑、雅加达、查亚普拉、
古邦、望加锡、万鸦老、马塔兰、棉兰、巴东、巨港、北干巴鲁、坤甸、三宝垄、苏拉卡尔塔
苏腊巴亚、特尔纳特、雍亚卡他
越南：胡志明市
马来西亚：吉隆坡、槟城
中国：上海
新加坡：新加坡市
机队编辑 语音
截至2014年8月，印尼狮航机队：
机型 数量 座位数
经济舱 商务舱
麦道MD-90 16 153 8
波音737-300 2 149
波音737-400 10 150 8
波音737-900ER -- -- --
资料统计截止日：2011年11月28日，平均机龄：6.2年。
8架 波音737-400
26架 波音737-900ER
2架 波音747-400
1架 麦道MD-82
4架 麦道MD-90
● 2004年11月30日——狮航JT538班机从雅加达苏加诺—哈达国际机场前往泗水期间，于经停中爪哇省梭罗市(Solo)时冲出跑道末端撞毁，机上153人当中有5人遇难。
● 2013年4月13日——狮航客机降落巴利(Bali)机场时过早着地，致飞机坠海，断成两截，但只有数人受伤，无人死亡。
● 2016年4月——狮航子公司Batik Air 客机在雅加达哈利姆⋅珀达纳库苏马国际机场起飞时，撞上一架正被拖车拖行横过跑道的TransNusa航空公司空载客机，Batik Air 客机上56人全部生还。
● 2016年5月——两架狮航客机在雅加达苏加诺—哈达国际机场地面相撞。
● 2018年10月29日，一架隶属于印尼狮航集团（LION AIR）的波音737MAX-8客机起飞不久后坠毁，机上载有189人，无人生还。印尼方面搜救队员在失事地点找到了属于该飞机的油箱，以及疑似为机身的残骸。搜救人员已经在失事地点找到了飞机的油箱，并称油箱发生过爆炸。
2019年1月14日，印尼狮航坠毁737MAX8客机上的驾驶舱语音记录仪已找到。
2019年25日下午，印尼国家运输安全委员会(KNKT)在雅加达总部举行新闻发布会，公布了去年10月该国狮航客机坠海空难最终调查报告，列出失事客机设计缺陷和飞行员应对失误等原因。
报告显示，失事的波音737 MAX8客机防失速的机动特性增强系统(MCAS)设计和认证没有充分考虑飞机失控的可能性。波音公司MCAS设计允许对飞机水平尾翼进行调整的角度从0.6度提高至2.5度，而这一改动并未及时在提交给美国联邦航空管理局(FAA)的相关文件中进行更新，因此FAA未能重新评估该设计更改的安全性。
报告称波音公司未能向飞行员提供有关MCAS系统的任何信息，导致机组人员在危急时刻无法及时了解面临的情况。由于飞机手册和飞行员培训中没有关于MCAS系统的信息，机组人员很难诊断出问题并及时采取纠正措施。
报告显示失事飞机的攻角传感器出现了故障，MCAS系统根据错误的传感器数据进行了错误的调整。而类似传感器故障在失事飞机失事前一天的飞行中就曾发生过，但是狮航并没有停飞该架飞机。
报告称，执飞失事航班的两名飞行员应变能力不足，尤其是副驾驶不熟悉操作程序。机长在飞机系统发生故障、已成功对抗飞机俯冲20次后，将操纵飞机的权力交给当时紧张不已的副驾驶，而副驾驶当时根本没有保持操纵飞机的能力，随后飞机坠海失事。
