日本石龟为日本特有种，他们栖息在日本国内流动的溪涧，河流，沟渠，以及其它的水体中，且在山间清凉的溪涧和池塘内，其水流湍急而冷冽。
日本石龟分布在整个广岛。
整体基本上都是棕色的，而头部颜色会稍浅一些，两侧和颌部上长有深色的斑点。可能有一条棱突，其上也许会有一条浅色的条纹，但也许没有。后缘呈明显的锯齿状。背甲上可能具有清晰的特征性的年轮，还可能会有由放射状的细沟构成的精致纹样。腹甲上有一个缺刻。一些较大的雌龟，其背甲的直线长度可达7"，但大多数往往都要小一些，5-6"。成体的背甲长度为13-18cm。日本石龟的体色呈棕色，略略带点黄。
日本石龟都是游泳健将，生活在池塘，小河，沼泽等水域，每天大多数生活在水中，有时会爬上岸晒太阳．在炎热的盛夏，多数在上午和傍晚活动，中午潜在深水中休息。
买的龟要进行消毒方能放入池中混养，一般新购进的龟会因环境的改变而停食3－7天后方可恢复．饵料以新鲜的小鱼虾为主，猪牛肉也是不错的饵料，兼喂少量水生植物．每天投喂1到2次．每次投后1小时后检查容器，及时捞出残饵，保证水质。
日本石龟对水质要求不高，本人饲养的龟已经驯化成功，自来水可以直接放养．若是刚购进的野生龟，最好还是用经过暴晒后的水放养。
日本石龟的冬眠在日本，我采用两种方式，1，当水温15度时，把龟搬入室内，加深水位，在容器上方加盖一块玻璃，少许露出一通气口，供龟呼吸．每星期检查一次，防止水的蒸发，及时添加同温的水，保证水位．在容器选择方面，我建议用陶缸或塑料盆，玻璃缸保温效果不好．2，放入湿沙中，让其钻入沙中自然冬眠．
M.japonica属半水栖龟类，要求在水族箱里有一块陆地。它们需要一处带有加温灯的干燥晒背区。UV-B爬虫灯将会为龟类的身心带来更多的益处。M.japonica系温带物种，所以养在室内的话，水中无需再用加热器，但在晒背区应该使用加温灯把温度升到大约80-85°F左右。它们都是活泼好动的龟类，故而空间要尽可能地大一些，无论是水域还是陆地都是这样。在温带和亚热带地区，如能至少在一年内的部分时间里将这些龟养在带有池塘的室外场地中，它们将会很高兴。（在室外场地中必须保证它们不受狗或浣熊之类的掠食者的侵害。）水必须保持有良好的过滤。如果饲养在良好的环境下，这个物种在人工条件下往往显得很强健，并且易于繁殖。
这种龟是杂食性的，但更倾向于食肉。水生昆虫，蠕虫，蝌蚪，昆虫，蜗牛，小虾，饲料鱼，蛙类，杂草等。猫粮和狗粮颗粒也可用作其食谱的构成部分。还可以投喂水生植物，以及其它的绿叶，蔬菜，偶尔还可喂些水果。它们也能够接受专为水龟设计配制的颗粒状飘浮性龟饲料。另，还应该供应一些诸如墨鱼骨或煮沸的鸡蛋壳之类的钙源。
CITESII,国内于2018年10月9日被核准为二级保护水生野生动物(不含人工种群)。
日本石龟需要经过3－5年才能性成熟，性成熟的龟在每年的5－10月为交配期，5－6月为产卵期，每次产卵5－8枚，卵呈白色，长椭圆形，孵化期为70天左右．雌龟将卵产在相对较为干燥的巢穴中，一窝产4-10枚卵。而每季它们可以生产1-3窝。这些卵常被浣熊，鼬鼠和四纹蛇之类的掠食者吃掉。
