栖息于中、高海拔1800~3800米的针、阔叶混交林和针叶林底层丛薮中，不过在玉山国家公园进行的调查中发现，以海拔高度2300~2550米发现的次数最多，而且比较喜欢在山坡坡度较陡（30至60度之间）的地区活动，也见于次生林和人工造林地。冬天有向较低海拔迁移的现象。
黑长尾雉分布于台湾的宜兰、桃园、新竹、苗栗、台中、南投、嘉义、花莲、高雄、屏东、台东等县境内的中部山地。
雄鸟头、颈和上背紫蓝色；上背具宽阔的钢蓝色羽缘和黑色矢状次端斑。下背和腰浓黑色而具金属蓝色羽缘；翅上覆羽也同，仅微杂有白色斑点，但一般不外露。大覆羽具宽阔的白色端斑，在翅上形成显著的白色横带。初级飞羽黑褐色，次级和三级飞羽亦黑，具窄的白色羽端。尾上覆羽黑色，具白斑；尾羽16枚，甚长，呈楔状，中央尾羽最长，往两侧逐渐变短，颜色为黑色，稀疏的被有数道白色横斑。胸深蓝色而富有光泽。腹黑色，尾下覆羽亦为黑色，具窄的白色端缘。
雌鸟头和颈橄榄褐色，头顶及枕黑色，具暗棕色羽缘；上背及翅上覆羽黑色，具白色羽干纹和橄榄褐色羽缘，且杂有棕褐色斑；下背及腰橄榄褐色，缀以黑斑；尾上覆羽淡灰褐色，具宽阔的黑色横斑和杂有棕褐色；飞羽黑色，除三级飞羽外均具淡棕褐色横斑。中央尾羽栗色，外侧尾羽棕色，均具黑色横斑。除中央一对尾羽外，其余尾羽均具白色羽端。颏和喉均褐白色，胸和两肋均呈黑白相杂状。腹灰褐色，也具黑色横斑和灰白色羽端。尾上覆羽棕色，具白色羽端和黑褐色斑点。
发现其活动的地点多在林道路面地表植物和落叶覆盖多的地方，也会在陡峻的峭壁上行走。多单独活动，不群聚。活动的时间多半在双高峰时段，在关高地区为早上5点到6点和下午6点到7点，在瑞岩溪自然保护区是早上7点到8点和下午4点到5点，而最喜欢在下小雨、中雨、起雾或阴天时出来活动。行走时沉稳地昂首慢步，少出声，谨慎而机警。如发现有人出现时，雌鸟会立刻快步逃离或飞走，并同时发出“咕、咕、咕”声；雄鸟的反应则较为镇定，会在原处呆立片刻，再缓慢向前行走，如距离太近，则立刻窜入浓密的杂草丛中，或往下坡疾飞，并同时发出尖锐的叫声。此时尾羽展开成扇形，拍翅声很大。如成对在一起行走觅食，彼此相距不远，通常雄鸟会陪伴雌鸟左右或尾随其后，时时保持警戒状态，扮演者护卫者的角色，雌鸟则安心觅食。遇有敌害或观察者，雄鸟往往昂首挺胸，羽毛贲张，并发出急促的警戒声，缓步行至空旷地以引起入侵者的注意，等到雌鸟从容进入丛薮中，才向不同的方向逃逸。疾走时头部前后晃动，尾羽向下垂，不常惊飞。
晚上会在树上停栖过夜。一般在傍晚上飞跃上树，有时会由一树枝跳跃到另一树枝，然而每一只的树栖地点并不固定。早晨自树上跳动地面上觅食，往下跳时，身体向前倾，尾羽张开。
杂食性。觅食时，以喙直接啄食地表植物的新叶、幼芽、花、各种浆果、草籽，也常在走动时用喙或爪扒开地面落叶或腐植土，再用喙啄食土中的蚯蚓、蚂蚁、蝴蝶幼虫和其它昆虫，此外会啄食地上的小石子。
繁殖期在4至8月之间。多数学者（欧保罗等1990，姚正得等1998）观察其繁殖初期雌雄成对活动的次数较多，推测其婚配为一夫一妻制。但也有学者（Delacour 1951，Stokes & Williams 1971）认为其婚配为一夫多妻制。繁殖配对的时间可能在每年10月或11月即已完成。
发情期约始于3月中旬，一直延伸至6月。雌鸟在繁殖前，体重有显著增加的现象，可能是为了产卵和孵卵需耗费的庞大体能预作准备。春天求偶时，雄鸟会为了争夺地盤和配偶而大打出手。打斗时两只雄鸟挺胸对峙，其中一只突然趋前，另一只立地跃起，当其落地时，趋前的那只随即跃起，彼此一上一下的跳动，有时两只同时跃起，用爪当武器攻击对方，然後同时落地。此时雌鸟谁也不帮，仅在一旁观战。雄鸟发情时，脸部肉垂呈鲜红色，并竖立引颈挺胸向雌鸟展翼，快速地连续颤动双翼。
成熟雄鸟的换羽在7至10月之间完成，这段时间正是雌鸟抚育幼鸟的重要阶段。雄鸟完成换羽，展现一身亮丽的新羽，此时正是幼鸟离开雌鸟，让雌鸟恢复单身的时候，也是成熟雌雄鸟再次配对的时机。
一般筑巢在地面或树干上，巢位於面向骤降陡坡的凹陷处，或岩石下的凹洞，或陡坡上缘树干基部的树洞里，甚为隐密。巢材多为就地取材的枯枝和落叶，内衬有羽毛。产卵期在3月底至4月初，每窝产卵3至5枚，卵乳白色至淡褐色，卵重48.45g，平均大小为40.7×55.0mm。由雌鸟单独承担孵育的责任，雄鸟不参与育雏的工作。雌鸟孵卵时，会有起身转向、四处张望、啄理巢材、梳理羽毛和翻卵等行为。在雷雨的恶劣天气，雌鸟整日不离巢活动。孵化期约28天。6月底可见雌鸟带著幼鸟在林道觅食，在路上慢行雌鸟也时时保持警戒，幼鸟追随其左右，并啄食地表上植物的种籽。雌鸟在雏鸟出壳的二星期内，会在巢内或巢附近的隐密处，让雏鸟钻入雌鸟的翼下过夜（姚正得1996）。在这个携幼活动的时期，它们无固定方向，而是四处游荡并逐渐远离巢区。到了8至9月时，幼鸟的体型已经长得跟雌鸟差不多，随著成长而与雌鸟日渐疏离，最後独立生活，而且可以上树过夜。然而雌鸟会在下次繁殖前，回到原来的巢位附近活动。
全球种群未量化，但被描述为常见物种。玉山国家公园约有10,000只（Madge &McGowan 2002），占该鸟种群相当大的比例。全球种群约10,000~19,999只，成年个体约6,667~13,333只。台湾估计有100~10,000繁殖对。种群趋势数据缺乏，由于捕猎和栖息地减少，种群可能处于下降状态。
列入《濒临绝种野生动植物国际贸易公约》（CITES）附录Ⅰ。
列入《国家重点保护野生动物名录》：国家一级保护动物（1988年12月10日生效）。
列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》（The IUCN Red List）：近危物种（NT），2012年评估。
