清河长147公里（一说153.8公里），长于石川河干流，集水面积1550平方公里（一说1863平方公里），平均比降3.3‰，年径流量0.63亿立方米。清河，是石川河大的支流。
古代清河自然景观甚好，明《临潼县志》有“清河多藻荇，旭景平浮，清风徐引，满川绿摇翠幌，耀人心目……”之记载。建国以后，沿河岸修有慕郑、栎阳等小型抽水站，20世纪70年代修有栎阳、二龙口两大水库。20世纪80年代，由于沿河两岸氮肥厂、造纸厂等工业污水排放，河水污染严重，清河自然生态遭到严重破坏。沿河建有栎阳、新华、巷里3座公路桥梁。
清河，上游由清峪河与冶峪河组成。
清峪河，发源于耀县照金西北的野虎沟（亦称野虎岭），经照金镇、高尔原、前嘴子至底石河进入三原县县境。入境后自新兴岩窑村西北东南向流，于孟候原、丰原间南下，经洪水、岳村、冯村、樊家河、杨杜村、第伍村、于峪口出峪。出峪后绕鲁桥镇西，过坊南魏至吴家道，又西折过李凹村、窝桥马村、李家庄，转南至交龙堡（双河口），同来自泾阳地界的冶峪水相汇后统称清河；再绕西刘村东折过县城，经临履堡、李家桥、王店、赵渠、许渠张、白龙湾，至芬李村东入临潼县境，继流入石川河注渭。全长143公里，县境内长68.6公里；总流域面积699平方公里，县内188.4平方公里；平均比降3.22%。，河沟平均宽170米左右。县境内有一、二级支沟205条，总长147公里；三级毛沟41条，总长19公里。具有常流量性质的支毛沟为数不多。
常村沟，系清峪河的一级支流，源于爷台山东南麓，流向东南，出县境后于三原县洪水附近入清峪河。全长19.5公里，流域面积21.3平方公里，河谷宽约10米，河床比降40‰，下游常流量0.0345立方米/秒。在主沟上、中、下分别建有常村水库、沿渠水库和天然形成的嘴头水库。
源出淳化县北安子哇乡老城湾，两源相隔不远，一在石门山东南，一在石门山之南。冶峪河出谷口有临江潭，峡谷飞瀑，景秀迷人，正南行绕淳化县城转东南，过黑松林、石桥，入泾阳口镇、云阳镇，在三原县安全滩汇清峪河，始称清河。
清河向南又急转东偏北行，河床深切百余米，由三原县城北经大程镇，入西安市阎良区。
在西安市阎良区内，清河是该区和临潼区的一条界河。从境内西南振兴乡慕郑村入境、由西北向东南经振兴、北屯、武屯3个乡，于武屯乡小苏村出境。区境内流长28公里，境内河道控制流域面积约180平方公里。两岸多陡崖，河床狭窄、河沟平均宽170米，河水含泥沙量大，两岸多有芦苇。
冶峪河全长77.8公里，流域面积619平方公里。境内长39公里，流域面积514.4平方公里，为本县第一大河。冶峪河支流众多，有高家沟、甘沟、子房沟、鸭子沟、小池沟、东沟、葫芦河、寺沟、泥河沟、清水河、油房沟等，左岸支流多于右岸，水系排列呈树枝状。县城至口镇段，谷底较宽浅，平均宽度40余米，属“U”形沟谷。其它河段，河流切入黄土高塬200余米，河床平均比降10.1‰，上游淳化站年平均径流量0.143亿立方米。自黑松林水库建成后，下游河道经常断流。三原县年平均入境流量403万立方米。
油房沟，冶峪河支流。以沟内建有油房得名，后因沟内建秦庄沟水库，又称秦庄沟源于爷台山南侧的桐树渠东，流向基本上是由北而南，于圣人桥入冶峪河。河长18.5公里，流域面积81.9平方公里，河床比降20.9‰，常流量0.32立方米/秒，河道狭窄，平均宽8米。
浊峪河。系清河一级支流，发源于耀县小丘乡北部的安沟村，南流至耀县凉泉坡进入本县境。入境后穿越丰原、白鹿原间南流，经邵村、谢家岩、杨家坡，于北草渠转东南流，过瓦窑、柴家壕、李寨、庞家至丰王，流向偏西南，经寅王、翟家坡，于楼底村西北出峪。出峪后受人工围堰阻拦折东入清惠一支渠，旱时引灌农田；涝时以排水渠南引注入清峪河，龛长54.8公里，县境内长32.8公里；流域面积241平方公里，县境内162.1平方公里；河沟平均宽120米左右，总比降7.91%。浊峪河年平均入境径流量为364万立方米；洪峰流量（楼底），1933年7月21日为843立方米/秒。1953年219立方米/秒，1979年677立方米/秒。浊峪河流经黄土地区，天然植被差，沟壑发育，冲蚀严重，侵蚀模数及含沙量均大于清峪河；但水质较好，人饮、养鱼均佳。1956年，县人民政府组织群众在小道口和南王修建了两个小型水库，拦淤析水，灌溉农田。
源头之一清峪河，发源于耀县北部山地峡谷区属乔山山脉南支脉，北界长蛇岭，南界文王山，包括庙湾、柳林、瑶曲、照金、白瓜5个乡（镇）大部辖区，平均海拔1350米。土地面积945.76平方公里，占全县总面积58.49%。本区山大沟深，林木茂盛，煤炭、石油、植物植被资源丰富。山间盆地、洼地、坪地星罗棋布，土层深厚，易于农作。为石质山地，由石英砂岩、砾岩组成，山高谷深，壁立千仞，形势险要。
源头冶峪河，发源于淳化县北部，为山地丘陵，包括黄花山、凤凰山、爷台山土石山地和黄土梁状丘陵、黄土梁塔状丘陵等地貌类型。下游为黄土高塬。该区古地貌为一单斜构造，地层舒展平缓，岩性有下古生界灰岩、中生界砂页岩及泥质砾岩等，其上覆盖第四系各期黄土。在其历史发育过程中，把塬面切割成块状，沟壑的进一步发育，使高原变得支离破碎，塬、梁、沟、谷交错，正负地形相间。
下游三源县是渭河冲积平原（亦称关中平原）的一部分，系渭河二级阶地，由地堑式构造盆地经渭河冲积而成。面积290.37平方公里，占全县总面积的50.33%。盆地内堆积了厚数十米至数百米粗细不等的质地层次，叠置成松散状岩系。海拔标高362～500米。土壤母质主要是次生黄土。区内地势较平坦，水利条件好，灌溉方便，是粮棉菜果适宜区。清峪河自西至东，把平原切割成南北两部分。北部为清惠渠灌区（习惯称小灌区），含大程、西阳、新庄、鲁桥4个乡镇及新庄、惜字两个农场，共198个自然村，3个自然集镇；南部为泾惠渠灌区（习惯称大灌区），含城关、高渠、安乐、陂西、独李、渠岸等6个乡镇及雁北农场，共254个自然村，4个自然集镇。清峪河河谷切割深30米左右，宽200米左右，断面形状呈“U”形，两岸沟坡凌峻，滑坡、堕落微地貌普遍。
浊峪河自北而南，穿越台原腹地，将台原切割成东西两部分。西部为丰原，含新兴、张家坳两个乡及嵯峨乡的一部分，共67个自然村，一个自然集镇。嵯峨乡杨杜村有新石器时期人类活动遗址。东部为白鹿原（又叫万寿原），含徐木、陵前、马额3个乡，两个自然集镇，160个自然村。马额乡南韩村有西周中期人类活动遗址。
清河下游，为渭河冲积平原的清河谷地，最高点在北部黄土台塬的振兴乡东太平庄，海拔483.2米最低点在武屯乡石川河与清河交汇处二龙口，海拔351.7米。
耀县属暖温带大陆性半干旱半湿润易旱气候区，四季冷暖干湿分明。冬季受蒙古极地大陆气团控制，寒冷干燥，雨雪偏少。春季温度回升，天气多变，乍暖乍寒，常有大风、霜冻、沙尘及春旱发生。夏季受太平洋副热带海洋气团控制，出现高温与雷阵雨天气，常有冰雹及伏旱发生。秋季降温较快，多连阴雨；晚秋天气较晴朗。同时，由于地貌特点，南北气候差异较大，北部清峪河源地属温凉半湿润区。无霜期短，降水较多，农作物一年一熟。
下游三原县属北温带大陆性季风气候。冬季受西伯利亚冷气团和极地变性大陆气团的影响，寒冷干燥，气温低，降水少。春季，热带暖湿气团逐渐增强北进，气温回升快，降水增多。但由于蒸发量大，易成春旱。同时冷空气活动亦较频繁，故多有寒流和大风等灾害性天气。夏季受太平洋副热带海洋气团影响，炎热多雨，常有雷暴和冰雹出现，夏旱也常发生。秋季冷暖气团交替影响，初秋多处于副高边缘，常有连阴雨。10月份，因受极地高压控制，气温迅速降低，降水显著减少，多秋高气爽的晴朗天气。
境内南北地貌不同，因而气候南北差异较大。南部平原为温暖半湿润区，农作物一年两熟。黄土台原南部为温暖半干旱区，农作物一年两熟。北部为温和半湿润区，农作物两年三熟。西北山原为温凉半湿润区，热资源差，因受地形影响，年降水量为全县多，农作物一年一熟。临潼区，位于东亚暖温带半湿润气候向内陆干旱气候的过渡带上，兼有两种气候的特点，属于大陆性暖温带季风气候。四季冷暖干湿分明：春季暖和，多风，干燥，回暖早，升温快；夏季炎热，日照长，多雨兼伏旱；秋季温暖，降温快，多阴雨；冬季寒冷，干燥，气温低而雨雪少。
清河干流，据三原旧县志载，宋建隆二年（961）“三原水涨，八复渠河口下切数丈”（八复渠首即今双河口）；明万历四十四年（1616）夏，“大雨如注，水越龙桥，漂没百里”；清康熙三十年（1691），“大水，龙桥几倾”。参照史料，采用洪痕法测算，宋建隆二年清河洪峰流量在1000立方米/秒左右；明、清两次洪峰流量双河口以下均在2000立方米/秒左右。西安市阎良区年径流量0.63亿立方米。临潼区径流量为4709万立方米（包括在石川河内）。
上游的清峪河，经高尔原、前嘴子、三联水库调蓄引用后，年平均入境径流量1633万立米，其中6～9月径流量占46%。据统计，1958年流量为251立方米/秒，1964年191立方米/秒，1978年202立方米/秒，1981年251立方米/秒。历史最大洪峰流量：樊家河为1160立方米/秒，龙桥2750立方米/秒，均出现在1933年7月21日。清峪河含沙量，年平均151.88公斤/立方米，其中6～9月平均为115.1公斤/立方米，占全年的75.8%。含沙量最小值为零，但洪峰期可达400公斤/立方米以上。侵蚀模数20世纪60年代年平均1090吨/平方公里。70年代年平均高达2630吨/平方公里。
上游的冶峪河，三原县年平均入境流量403万立方米。
源澄渠
为清河上的古堰，因源头澄清而得名，开于魏明帝太和元年（公元227年）。渠口原在今堰口伍村北清河西岸，后多次倒移。清时灌泾、原30村田地113顷20亩6分。建国后经改建为清惠渠西干渠。
工进渠
开于五代至唐中叶之间。渠口在杨杜村清河东岸，今红原厂11万变电站处，尚存遗址。渠长16里，灌鲁桥、西阳及泾阳地63顷30亩。现为清惠渠东干一支渠。
八复水
开于唐贞观年间，灌润献陵之水，因纳清、冶、浊、赵氏、石川五流，时有“五龙捧寿”之名。因每月得全河八日之灌田而得名八复。堰口起于半个城以西，收清、冶两河之水东北流，经惜字村至西阳武官坊的二龙口，会浊水东走献陵，沿原麓到朱家湾一带。首一斗，灌张村、唐村、小畦三里，田地约230余顷。
沐涨渠
唐初李卫公（李靖）在靖川（三原孟店一带）以河为渠，灌津军屯，故有沐涨。堰口在今鲁桥李凹村北，后移至峪口东岸。灌溉今三鲁路至清河之间的耕地180余顷。现改建为清惠渠东干三支渠。
五渠
因渠首流经第伍村而得名。根据《长安志》关于宋初五渠向八复补水的记载，五渠当开于唐代。旧以西阳武官坊二龙口为界，上称下五渠，以下与八复水合，旧时灌鲁桥、新庄、西阳、大程和徐木五乡北部地区田地约355顷。现改为清惠东干二支渠。
毛坊渠
毛坊渠堰口在今冯村水库坝址处，灌自七里坡至杨杜村之间的河道川地50余顷；小渠多至18道，以毛坊为总。今为洪水西于渠及冯村水库所取代。
浊河各堰
今已改弃，仅见载于马理《陕西通志》和清贺瑞麟《三原新志》。明、清时期运行的计有小毛堰、长孙堰、荐福堰、木王堰等。
五泉
包括乌龙泉、龙尾泉、黄龙泉、白龙泉和白马神泉，为西阳东北一带小型灌田、饮水天然工程。建国初仅有前四泉见流，70年代随着灌溉自流系统的建成和井灌的发展而废弃。
清惠渠
建国后，国清浊河水利统一规划和改善，建成清惠渠灌区。1953年在鲁桥设清惠局管理。清惠灌区习惯上称小灌区，主体灌区在清河以北，包括本县的鲁桥、新庄、西阳三个乡镇和泾阳的龙泉乡，有效灌溉面积7.9万亩。灌区东西长约25公里，南北宽约5公里。灌区经过60年代的集中改善，70年代大搞农田基本建设，80年代加强管理，较好地发挥了渠、井、站的综合作用，灌区粮食年亩产已与大灌区不差上下。清惠渠的引水枢纽，先是1952年在杨杜村建成的浆砌石溢流低坝。1970年兴建冯村水库后，在库坝上设引水枢纽，使灌区主水源得到保证和调节。1956年在浊河上建设了南王、小道口两座串联小一型水库，为灌区也提供了一定的水源。清惠灌区渠系有干渠3条长12公里，支渠5条长19公里，斗渠26条长84.8公里，配有各类建筑物391座。从1988年起，清惠渠被省列入老灌区改造项目，现已投资170万元，逐步对一支渠进行全线改造衬砌。
泥河沟水库
位于石桥乡北塬，冶峪河支流泥河沟中部。1974年动工，翌年10月竣工，坝高27米，长240米，塔式闸门排流兼泄洪，最大泄洪量为36.7立方米，集水面积15.6平方公里，总库容108万立方米，有效库容52万立方米，1976年7月建成电力配套抽水站1处，装机310千瓦，二级上水，总扬程122.11米，设计流量0.24立方米/秒。灌区受益为嘴头、引安、大槐树3个行政村的0.69万亩农田。输水渠道17.5公里，流量0.25立方米/秒。扩灌面积0.2万亩，改善灌溉面积0.3万亩.1993年列为国家第二期渭北旱塬农业综合开发挖潜配套项目，次年3月开工，1994年6月完成，工程总投资99.8万元（其中：国家投资68.5万元，贷款16.6万元，群众自筹14.7万元）。
高尔原水库
位于耀县清峪河上游照金镇高尔原村，1959年冬季动工，1961年完成土坝小断面、放水洞及临时溢洪道工程。后因压缩基本建设，中途下马。1966年冬恢复施工，1969年全部完工。土坝高37米，顶长274米，可灌小丘原耕地3万亩，并解决人畜饮水问题。
冯村水库
位于三原县嵯峨乡冯村附近的清峪河干流上，是清惠灌区的中型蓄引枢纽，以地名定库名。水库于1969年11月由三原县革命委员会设计和施工。水库由大坝、溢洪道、放水洞组成，总库容1890万立米。总投资640万元，投工221万个，完成土石方230万方，占地2008亩。主坝竣工后，因坝基黄土湿陷及截流槽砂卵石未清理彻底而多处沉裂漏水。1974至1984年借鉴美国、加拿大和我国北京密云水库，葛洲坝及甘肃北台山水库的经验，作灌浆和混凝土防渗补强处理，消除了渗漏。补强共投资292万元，投工39.2万个。竣工后，省水利厅组织49个科研勘察设计单位验收，定为优良工程。该水库贴近嵯峨山，上游无污染，水质清澈，含人体所需微量元素，是县城饮水的理想源泉。引冯人城人饮工程，已在实施中。
前嘴子水库
位于耀县小丘镇前嘴子村南的清峪河干流上，系小型水库，为中原灌溉枢纽。工程于1958年由省水利设计院和泾河工程局设计，1958至1960年，由三原县（大县）人民政府组织指挥部；泾、三、高三县万名群众参加施工，设计完成土石方72万立米，总投资58万元。水库由坝、溢洪道、放水洞等组成，设计灌溉面积3.05万亩。该库淤积发展很快，至1980年已仅存有效库容98万立米，被迫施行勤引短调节灌溉。
李家桥水库
位于三原县渠岸乡李家桥村北的清河干流上，系渠岸、西阳、新庄三乡联建的小一型水库。一为补充伏旱时泾惠渠对库区两岸3万余亩农田的供水不足；二是充分利用城区河段的肥水资源（每方含氮量35克）。工程于1974年由县水工队设计，渠岸、西阳、新庄三乡组织施工。1975年7月坝、洞竣工后即投入运行。由于溢洪道没及时打通，加之该库处于梯级库群下游，1976、1979和1981年先后三次严重历险。致使上游咸宋公路临履桥中断通行月余；下游人民群众生命财产安全受到严重威胁。1982年又投资50余万元补修了桩基挑流式溢洪道，尔后运行效益正常。该水库建成后，淤积上溯至古龙桥，蓄水量日趋减少。
小道口水库
位于三原县陵前乡小道口村西的浊河干流上，为清惠灌区在浊河上的配套水源工程。原设计以减少黄河输沙和保护下游国防设施为目的，结合进行农业灌溉。1956年由省水利设计院设计，计划灌新庄、西阳两乡农田1.6万亩。水库于1956年11月由省水电公司施工队及县人民政府组织施工，1958年建成运用。1976年已拦泥198万立米，有效库容淤完。同年8月西北水利科学研究所和省、市、县三级水电局采取扩大排沙洞，蓄清排浑，人工拉淤等措施在小道口水库开展“死库复活排淤试验”研究，为世界中纬度黄土地区水库淤积后的复活找出路。此项研究1982年8月获省科技成果二等奖；排沙又获省水利厅农业科技推广二等奖。
三联水库
位于三原县县西北洪水乡杜寨村村北的清峪河支流上，因地处三联大队而得名，系由重力滑坡所形成的天然水库。1970年8月14日凌晨1时许，坝址区南岸土体沿河床基岸滑动，但闻吼声如雷，百余万立方土体顿塞河道。整理成坝后，库容83万立米。1971年洪水乡在库内建站抽灌原面耕地630余亩，兼顾人畜饮水；彼岸淳化固贤公社嘴头群众亦因而受益。本库堤及两岸绿化水土保持较好，淤积不甚严重。
二龙口水库
1971年，政府投资66.25万元，阎良区在石川河与清河交会处，修建“二龙口水库”。当年动工，1974年竣工，蓄水870万立方米，有效灌溉面积2万亩。1987至1995年，市、区又对该库投资78万元，加固加高了库坝，更换闸门，复修溢洪道，增加了蓄水能力。1971年，谭家公社（后改为振兴公社）投资5.04万元，在慕郑清河上修拦河闸一座，当年动工，第二年完成，蓄水54万立方米，灌溉面积1万亩。
