新宿站位于东京都新宿区新宿三丁目至西新宿一丁目、及涩谷区代代木二丁目至千駄谷五丁目的范围。JR之车站出口分为西口、东口、南口等各方向。西口和东口都有几个通路。同时，有地下道把广大范围连接着。
JR东日本
2008年，使用8面16线的岛式月台、南北向。由东向西分别是1～18号线、全是位于地面的月台。连接通道为叫作“北通路”、“中央通路”的地下道、与南口的跨线桥、新南口、的跨线桥共4处。
一直以来、新南口只通往1～6号月台，不能直接到达其他月台，直到2006年4月16日跨线桥延伸到旧站舎开设之后才可以到达任何一个月台。
1～6番线比其他月台更靠南。特别是5･6号线邻接代代木站、连那边的发车广播都听得到。
新宿站正在进行改良工程。理由有2个、第1个是中央线特急列车的月台（5·6号线）与中央线快速上行的月台（7·8号线）成平面交错状态，这个问题成为了交通的瓶颈、改良工程可以解决这个问题。第2个理由是由1～6号线月台至7～14号线月台间换车所花的时间过多、这个已在2006年4月15日的工程时解决了。工程结束之后5、6号月台（中央线特急）的列车会转移到11、12号月台（中央线下行快速）、中央线下行快速会再改回使用9、10号月台。而现5、6号线会变为“成田特快”发车与山手货物线的月台、这样JR新宿站会增加了2条路线、路线号码在现9号线之后的都要顺延2号（号码的顺序是依各路线发着的位置与场所而定）。
铁路路线
东日本旅客铁道（JR东日本）
山手线
新宿站
新宿站
埼京线
湘南新宿线
中央本线
中央线（快速）
中央、总武线（各站停车）
小田急电铁
小田急小田原线
京王电铁
京王线
京王新线 （直通都营地下铁新宿线）
都营地下铁
新宿线（站号S-01，直通京王新线）
大江户线（站号E-27）
东京地下铁
丸之内线（站号M-08）
另设有地下通道连接以下车站：
西武新宿站（西武新宿线）
新宿西口站（大江户线）
新宿三丁目站（丸之内线、新宿线）
新宿站于明治时代已启用。1885年3月1日日本铁道由赤羽至品川的路线（山手线的前身）启用。当时的新宿仍然只是郊外地区，使用者不多，在下雨天更曾经完全无人使用。1889年4月11日，甲武铁道（中央本线的前身）至立川的路线启用，同年8月服务延长至八王子。1915年5月1日，京王电气轨道（现时的京王电铁）新宿站启用，1927年4月1日，小田原急行铁道（现时的小田急电铁）新宿站启用，令新宿逐渐发展成繁荣的地区。1959年地下铁新宿站开始提供服务。新宿站有178个出口，是世界上出口数量较多的车站。
