漳州南站建筑形态灵活借用闽南传统的燕尾脊、深挑檐及骑楼等建筑形式，体现浓郁的闽南地域特色。车站运用现代的建筑手法对闽南民居进行提炼升华，在传统风格中透露出现代气息，同时也载着历史文化积淀。
截至2018年9月，漳州站总建筑面积6.7581万平方米，其中站房面积2.9821万平方米，无站台柱雨棚3.7760万平方米；建筑总高度45米；设计聚集旅客数1800人，年发送旅客数250万人。
截至2018年9月，漳州南站是一座地面铁路车站，采用高架候车与线下出站的布局方式，旅客流线采取“上进下出”形式；建筑共分三层，从下到上依次为出站层（地面一层）、站台层（地上二层）和进站层（地上三层）。
截至2018年9月，漳州站出站层设有地下出站厅、售票厅和行李包用房；在靠近站房处设出租车和公交车停车场，在站房范围外设地下公共停车场；出站层以楼梯、电梯与站台层或地下停车场互通。站台层除轨道站台外，主要为带状进站广厅；旅客在广厅门口经安检后通过自动扶梯进入二层候车厅或直接进入本层的基本站台候车室、母婴候车室以及军人、团体候车室；进站广厅内设售票厅、咨询台、商业服务等窗口；贵宾候车室位于站房北部，设单独出入口，配备专用停车场；站房南部为办公区域。进站层主要为候车厅和服务区；其中候车厅分为南、北两个，中间部分开敞，供不候车的旅客直接进站。旅客主要通过地面的北广场进站，进入主进站广厅后依照车次和车厢号选择相应自动扶梯到达所在候车厅。
漳州站衔接龙厦铁路、厦深铁路和在建的福厦高速铁路，为闽南地区重要的铁路枢纽。（海峡导报 评）
公交线路
截至2019年3月1日，漳州站站前广场西侧设下沉式公交车站，共有11条公交线路。
1漳州公交11路
正兴医院站
06:40-21:40
漳州火车站
06:40-22:40
上车1元，全程2元
2漳州公交28路
铁路新村站
06:50-21:05
漳州火车站
06:50-21:35
上车1元，全程2元
3漳州公交29路
客运西站
07:00-18:00
漳州火车站
07:00-19:00
一票制2元
4漳州公交K1路
北门礼拜堂站
06:50-20:30
漳州火车站
07:00-21:30
一票制5元
5漳州公交K6路
漳州港客运站
07:00-18:30
漳州火车站
07:00-18:30
上车2元，全程10元
6漳州公交A3路
闽南师大东门站
06:50-21:20
漳州火车站
06:50-22:20
一票制2元
7漳州公交B3路
理工学院站
07:00-19:00
漳州火车站
07:00-19:00
一票制2元
8漳州公交D1路
漳州卫院站
07:30-16:30
漳州火车站
09:00-17:30
定制公交，一票制6元
9漳州公交漳州火车站接驳线
长途汽车站
工作日06:30
漳州火车站
单向，无发车
接驳公交，一票制5元
10龙海公交26路
港尾公交站
06:30-18:00
19:00-20:40
漳州火车站
07:00-20:30
上车1元，全程3元
11长泰公交702路
长泰汽车站
06:30-18:00
漳州火车站
07:00-19:00
上车3元，全程8元
出租汽车
截至2018年9月，漳州站在车站东面地上二层平台和地下层设出租车接送点。
1956年，鹰厦铁路漳州支线建成通车，在漳州市龙溪专区（今芗城区）设漳州站。
2011年，原漳州站改名为漳州北站。
2002年10月，《漳潮铁路预可行性研究报告》完成编制，拟建漳州至潮州铁路，途经漳州市设站。
2004年7月，中国沿海铁路规划出炉，漳潮铁路纳入沿海铁路厦深段，途经漳州市设站。
2005年4月，厦深铁路线路规划确定，途经漳州市龙海市设漳州南站（现漳州站）；同年7月，根据《龙岩至厦门铁路预可行性研究报告》，龙厦铁路在漳州南站与厦深铁路接轨。
2006年12月，龙厦铁路开工建设，通过漳州南站接入厦深铁路。
2007年11月，厦深铁路福建段开工建设，漳州南站为沿途车站。
2009年5月，漳州南站开工建设，车站位于漳州市龙海市颜厝镇。
2010年9月，漳州南站主体工程完工。
2011年7月，漳州南站改名为漳州站。
2012年6月，龙厦铁路竣工通车，漳州站投入使用。
2013年12月，厦深铁路竣工通车，漳州站成为龙厦铁路与厦深铁路的枢纽站。
2017年1月，福厦高速铁路动工建设，漳州站为线路的南端车站。
2018年7月，漳州站改造工程正式启动。
截至2018年9月，漳州站拥有3台14线，包括一座侧式站台、两座岛式站台以及设2条正线和13条客运到发线；途经漳州站的线路有龙厦铁路和厦深铁路。
自助购票
截至2017年1月，漳州站共有8台自动售票机，分布在车站一层售票厅和二层候车厅内。
便民设施
截至2018年9月，漳州站在一层售票厅内设有临时制证窗口。
截至2018年9月，漳州站设有游客集散中心，为旅游、休闲、度假的客人提供服务。
客运流量
2013年国庆期间，漳州站累计发送旅客3.4万人次。
2014年7月1日至18日，漳州站累计发送旅客12.4万人次。
2015年，漳州站累计发送旅客287.5907万人次。
2016年，漳州站累计发送旅客352.9303万人次。
2017年，漳州站累计接发旅客430.0721万人次。
2018年，漳州站累计接发旅客471.7774万人次。
