巢湖东站设一座10米宽跨线天桥、一座8米宽出站地道以及一个高架落客区。项目选址位于安徽巢湖经济技术开发区半汤街道境内，总用地面积约15.8公顷。整个枢纽工程包括站前广场、公交综合体、长途客运及旅游集散中心、配套商业、出租车场、社会车场、市政道路及高架落客平台、绿化景观等。
巢湖东站为线侧下式，进出站流线下进下出，分别设两处地道。正立面方向，中部为进站广厅和候车厅，左为出站厅，右为售票厅。车站设有贵宾和无障碍候车厅，站房两侧设置了必要的辅助用房。
作为京福高速铁路与商杭高速铁路的跨线换乘枢纽 （同时接入巢马城际铁路），巢湖东站在全省的高速铁路网中发挥着不可替代的作用。
巢湖东站核心辐射区为巢湖市和含山县，兼顾无为市，和县，庐江县的客流，辐射450万人口。
2014年3月6日，巢湖东站正式开建。
2015年6月28日，巢湖东站与合福高速铁路同步开通。
地级巢湖市时期为争取这个设站规模曾做出了大量艰苦的努力。按照规定，巢湖东站将由铁路部门和安徽巢湖经开区共同投资建设，铁路部门投入地级市设站规模8000平米的建设部分，余下4000平方米的建设由安徽巢湖经开区投入。为巢湖东站配套建设的站前广场和车站高架落客平台也由安徽巢湖经开区投入。
截至2019年2月，巢湖东站车场设计规模为4台11线，设7站台面、正线4条、到发线7条（已预留巢马城际铁路）。
巢湖东站中心里程DK70 300，中心轨顶高程为15.563米。
京福场： 规模为4站台面6线，正线2条、到发线4条，设2个岛式站台。上行：长临河站；下行：无为站。
商杭场：规模为3站台面5线，正线2条、到发线3条，设2个岛式站台。上行：柘皋站；下行：含山西站。
巢湖东站对侧已设置合福综合维修工区，合杭综合维修工区，南北联络线。
自助购票
截至2019年2月，巢湖高铁东站有1座售票厅，位于站房西侧，全站共设自助取售票机4台。
客运流量
2019年春节小长假期间，巢湖东站到发旅客为4.9万人次，到达、发送同比增长分别增长9.83%和9.60%。
