蚌埠高铁站由8000㎡扩大到20000㎡，站房分为东西两个站房，西站房总建筑面积为11998㎡，雨棚及天桥结构覆盖面积为50583.15㎡。站场规模为5座站台9站台面11线。设基本站台两座，正线2条，到发线9条。预留建设东站房条件。结合车站进、出站线设进站天桥一座，出站地道一座，天桥为全焊钢箱梁结构，雨棚采用大跨度倒放钢管桁架结构。截至2018年底，每天停靠列车79对(其中2对始发，不含高峰期列车)。蚌埠南站是京沪高铁七大中心枢纽站之一，分别为：北京南站、天津西站、济南西站、徐州东站、蚌埠南站、南京南站、上海虹桥站。 刷卡即可购车票
蚌埠南站售票大厅将设8个售票窗口，其中，为方便没带二代身份证的乘客购票，特别设立2号窗口提供相关服务。
除人工售票外，售票大厅一侧还专门设置了9台自动售票机，乘客可以输入自己的目的地，选中车次后，将随身携带的二代身份证放在扫描仪上，然后从进钞口塞进纸币即可购买车票，其中有2台还可以直接刷卡购票，省去现金交易的不便。
同时，为了方便乘客更好地了解车站信息，该站还设置了4台自动查询机，蚌埠南站基本概况、列车班次、售票信息等内容，只需手指轻轻碰触，便可一目了然。
蚌埠南站位于市龙子湖区李楼乡境内大学园区东首东海大道以南，距市中心6公里。
乘坐128路，全程15公里的距离，耗时约45分钟，公交车中途停靠百货大楼、火车站等地，可与全市80%以上公交线路实施无缝对接。128路公交车运营时间为早6:00--23:00.此外，南站还有免费摆渡公交，凭高铁票免费上车。交通运输部门安排蚌埠南站至长途汽车中心站的免费直达班车，运营时间为每天6：00至17：00，20分钟一班。同时安排至凤阳的客运班车，从6：00至18：00每15分钟一班。
并在蚌埠南站南侧建设一个总面积达8.5万平方米的国家一级汽车客运站，该客运站位于高铁蚌埠南站南侧，，由站务用房、候车大厅和交通信息楼组成，为国家一级客运站，也是目前我省客运企业规模大、设施齐备的汽车场站。该站填补了蚌埠高铁新城区客运枢纽的空白，与高铁站、城市公交共同构成蚌埠高铁综合交通运输枢纽，实现一站式零换乘。该站与长途汽车中心站、汽车南站和义务商贸城配客中心实现4站联网售票。该客运站售票厅设有12个售票窗口和4台自助售票取票机，并实现互联网实时查询车站售票信息。候车大厅里共设有13个检票口，其中一个为全省公路客运自助检票窗口。
2009年9月正式动工。2010年11月15日上午9时许，京沪高速铁路在蚌埠南站举行全线铺通仪式，时任铁道部部长的刘志军亲自拧紧最后一颗螺栓，标志着京沪高速铁路全线铺设完成。
