中西医结合学院前身为1977年建立的泸州医学院中医系，1993年正式招收硕士研究生。附属中医院于1983年建立， 1998年中医系与附属中医院实行“系院合一”管理体制，2001年中医系更名为中西医结合系，2003年更名为中西医结合学院。
医院与西南医科大学中西医结合学院实行院院合一。有中西医临床医学和中医学两个本科专业以及中西医结合皮肤性病学、中西医结合眼耳鼻喉学、中西医结合骨伤学3个辅修专业，中西医临床医学和中医学均为一本招生专业。有中西医结合、中医学2个一级学科硕士学位授权点，中医学为国家卓越医生（中医）培养计划项目,中西医临床医学为国家级特色专业，中西医结合临床为国家中医药管理中医药重点学科、四川省重点学科、四川省高等教育“质量工程”项目，《中医学》为四川省精品课程，《中医骨伤科学基础》为省级精品在线开放课程。建院以来，先后培养了中医、中西医临床本科人才7000余名，研究生人才400余名，留学生人才500余名。现有在校本科生、研究生、留学生2200余人。
医科大学附属中医医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、产业文化、集团医院、国际交流于一体的具有中医、中西医结合特色的三级甲等综合性教学医院，始建于1983年，医院通过了ISO9001质量认证，是“中医药传承创新工程重点中医医院”“国家药物临床试验机构”“国家中医临床研究基地建设单位”和“五星级”中医医院。先后获得了 “全国重点建设中医医院”“中国百强品牌医院”“全国卫生系统先进集体”“全国中医药系统创先争优活动先进集体”“全国冬病夏治先进单位”“全国省级综合性医院文化建设先进单位”“全国名老中医师承工作管理先进单位”“全国中医药文化建设先进单位”“全国中医药科普知识宣传教育先进单位”“全国医院文化建设创新单位”“全国中医电子病历示范单位”“全国中医药文化宣传教育基地”“国家首批住院医师规范化培训和全科医师规范化培训基地”“国家教育部首批‘5 3’专业学位研究生培养单位”“四川省中医类别医师资格考试实践技能考试基地”“四川省委教育工委先进基层党组织”“四川省医药卫生系统先进集体”“泸州市先进基层党组织”、9次荣获“泸州市110社会服务应急联动一等奖”等殊荣。
医院科研氛围浓厚，先后承担国家自然科学基金课题、863、973子课题等科研项目。医院共建国家中医药管理局三级实验室心肌电生理实验室，拥有四川省中医药管理局二级实验室肝脏生物化学实验室、四川省教育厅高等学校重点实验室和中西医结合研究中心实验室。主持各级科研课题1000余项，其中国家级科研项目30余项，省部级科研项目100余项，获得各级科研成果奖80余项：其中中国中医药研究促进会科技进步二等奖1项、三等奖1项，中华医学会科技进步三等奖2项，华夏医学科技奖三等奖1项，四川省科技进步一等奖1项，三等奖20余项；泸州市科技进步奖30余项。发表学术论文4000余篇，其中SCI收录130余篇；获得国家专利授权90余项。开发医院中药制剂56个，拥有科技成果转化公司2个（泸州神农科技开发有限责任公司和四川省中医药转化医学中心泸州分中心）。
医院是国家中医临床研究基地建设单位，拥有区域中医脑病、肾病、肝病诊疗中心，设有57个临床和辅检科室，其中国家临床重点建设专科2个（脑病科、肾病科），国家中医药管理局重点专科5个（耳鼻咽喉科、脑病科、肝病科、肾病科和重症医学科），国家中医重点专科协作组成员单位3个（治未病中心、护理学、临床药学），四川省中医重点专科13个，四川省卫计委甲级重点学科1个（麻醉学）和一批院级重点专科，国家名老中医药专家传承工作室8个（孙同郊、王明杰、陈隆晖、汪世强、胡春申、张茂平、黄淑芬、王鸿度）和四川省名中医工作室3个（孙同郊、杨思进、王明杰）。医院获批建泸州市人民政府院士工作站，有国家重点实验室、四川省重点实验室、四川省中医药重大疾病防治协作中心、四川省中医药“治未病”中心，医院制剂室为四川省中药制剂能力建设单位，近年来，医院大力开展新技术新项目，先后成立了手外科中心、运动创伤及关节微创外科中心、静脉用药调配中心、临床营养中心、治未病中心、胸痛中心、介入诊疗中心、健身中心、医学美容中心、中西医结合药物研究中心、中葡中医药国际合作中心、中医表型组学研究中心、中西医结合心脑血管疾病研究中心等。
截止至2019年，医院总占地面积80.2亩，建筑面积21万余平方米，形成了城北新院、水井沟院区、忠山院区、龙驰门诊部、天寿同仁国医馆及驾驶员体检中心、机场航空救护站“一院七地”的办院格局。医院现有编制床位3000张，城北传承创新大楼于2019年10月投入使用。现有在职职工2500余人，其中高级职称专家300余人，硕博士300余人，博士研究生导师和硕士研究生导师100余人，国家级、省级学术专委会委员以上专家200余人次，聘有世界范围内专兼职教授200余人。
截止至2019年，医院拥有Skyra3.0T、飞利浦1.5TMRI、Flash双源CT、医科达、新华6MeV直线加速器、Ysio双板DR、西门子、联影螺旋CT、Ceiling、Floor平板DSA、美敦力手术导航系统、飞利浦四维彩超、S5人工心肺机系统、进口全自动药品分包机、遗传分析仪、奥林巴斯和潘太克斯胃肠镜、阿玛仕1050RS准分子激光近视手术系统、头颅伽玛刀、腹腔镜系统、林氟泰克关节镜、卡尔史托斯神经内窥镜、徕卡、蔡司手术显微镜、海德堡OTC、全自动生化分析仪等先进设备以及眼科手术中心多个层流手术室。
