云南省中医医院暨云南中医药大学第一附属医院是云南省唯一的省级中医医院，其前身为建于1947年的云南大学医学院附设医院分院，1950年改为云南省人民政府卫生处总门诊部。医院于1994年被评定为三级甲等中医医院，2007年被评为云南省中医名院，2009年被列为云南省中医临床研究基地建设单位，2012年经国家中医药管理局复审再次被评为三级甲等中医医院，是集云南省120家省、州、市、县中医院和相关单位为一体的云南省中医医疗集团总医院。医院有光华和滇池两个院区，实行云南省中医医院、云南中医药大学第一附属医院、云南中医药大学第一临床医学院、云南省中医医疗集团总医院、云南省针灸推拿康复医院、云南省中医皮肤病专科医院六块牌子一套班子的管理运行模式。系国家药物临床试验机构、国家中药现代化科技产业（云南）基地、中药新药GCP中心及国家中医药国际合作基地、中医医院信息化示范单位、中医药文化建设示范单位、中医药标准研究推广基地建设单位、基层常见病多发病中医药适宜技术推广能力建设单位、全国城市社区中医药知识与技能培训示范基地。
医院党、政、工、团、妇集体先后获得的表彰、奖励、荣誉称号有全国医药卫生系统先进集体、全国三八红旗集体、全国抗震救灾重建家园工人先锋号、全国中医医院中医药文化建设先进单位、全国中医药继续教育管理先进集体、全国百姓放心示范医院、全国中医药应急工作先进集体、全国教科文卫体系统模范职工之家、云南省社会扶贫先进集体、云南省三八红旗集体、云南省巾帼文明岗、云南省中医名院、云南省卫生系统抗震救灾先进集体、云南省五四红旗团委等，“患者说了算”服务模式荣获“全国医药卫生系统创先争优活动党建工作品牌特色奖”，云南省中医药工作先进集体。
医院设有急诊科、肾病科、脾胃病科、儿科、眼科、耳鼻喉科、皮肤科、风湿病科、妇科、骨伤科、外科、男科、麻醉科、名医馆、肛肠科、肿瘤科、推拿科、针灸科、脑病科、老年病科、肺病科、口腔科、检验科、检验科、放射科、病理科等27个临床及医技科室。其中，国家临床重点专科4个，国家中医药管理局重点学科10个，国家中医药管理局重点专科10个，国家中医药管理局重点研究室1个，名医工作室12个，中医药特色优势学科继续教育基地3个，全国中医学术流派传承工作室1个，省级名医工作室5个，中医名科8个，重点专科27个，国家级特色专业1个，国家教育质量工程建设项目2个，省级特色专业2个，省级重点学科2个，云南省中医、中西医结合研究所和研究中心中心11个，云南省重点实验室1个。
医院两个院区开放床位1355张，在岗职工1476人，其中卫生技术人员1247人。医院现有35个临床及医技科室，1个中医药健康服务中心，9个临床教研室，1个模拟实验中心，2个社区门诊部和1个中药制剂中心。年服务门诊量120万人次，年出院3.35万人次。
医院有国家级、省级、院级名中医72人，云岭学者1人、云岭名医3人，全国优秀中医临床人才7人。有传承博士后导师2人、博士研究生导师11人、硕士生导师128人，省级中医药领军人才2人，省级中医药学科带头人5人。有建成和在建的国家临床重点专科4个和国家中医药管理局重点学科10个、重点专科10个、重点研究室1个、国家级名医工作室13个、全国中医学术流派传承工作室1个，全国首批名老中医药专家博士后传承工作站1个。
具有独立申报国家自然科学基金项目资格，主持有国家“863”计划重大科技专项、国家自然科学基金、国家科技支撑计划、国家科技攻关计划等科研项目。有飞利浦MRI、美国GE64排128层全身螺旋CT、飞利浦64排128层全身螺旋CT、西门子DR机、彩超、全自动生化分析仪等现代化的医疗设备。
医院成立于1947年10月，其前身是云大医院。
1950年10月，云南大学医学院附设医院与甘美医院合并。
1955年4月25日，云南省人民委员会批准，在总门诊部的基础上成立云南省中医院。
1960年5月，中共云南省委批准成立云南中医学院。
1960年9月1日，云南省中医院划归云南中医学院管理。
1960年10月1日，更名为“云南中医学院附属医院”。
2003年1月，云南中医学院附属医院更名为“云南中医学院第一附属医院”。
2003年10月，经云南中医学院批准，将云南中医学院医学系组建为云南中医学院临床医学院。
2013年6月17日，成立云南省中医医疗集团。
