吉林省吉林中西医结合医院始建于1953年，是一所集医疗、科研、教学和预防保健于一体，具有中西医结合特色优势的三级甲等综合性医院。医院占地面积2.6万平方米，建筑面积4.6万平方米，编制床位1000张，是国家级重点中西医结合医院。医院现为长春中医药大学附属医院、大连医科大学教学医院、北华大学第三临床学院、吉林医药学院附属医院、白城医学高等专科学校和吉林卫生学校实习基地医院，是吉林省中西医结合医、教、研基地。
医院同时拥有吉林中西医结合医院、吉林市健康管理中心、吉林市体检中心“三位一体”的综合性健康服务机构。其中吉林中西医结合医院是国家重点中西医结合医院示范单位。吉林市健康管理中心是原卫生部健康管理示范基地、是国家中医药管理局中医药治未病预防保健服务试点单位、是国家中医药管理局中医药预防保健及康复服务能力建设项目单位。
吉林市体检中心是吉林省内具有领先水平的现代化专业体检机构。现拥有李吉平全国名老中医药专家传承工作室一个；国家级重点学科（专科）5个；省级重点学科（专科）15个；市级优势专科（学科）3个；省级研究室6个。
一、创建吉林市门诊部
1953年由吉林市人民政府投资在吉林市船营区西安路原制香厂旧址筹建一座2100平方米的两层楼，做为吉林市门诊部。1953年底竣工，1954年1月11日吉林市门诊部正式开诊。
二、改称吉林市船营医院
1958年经市卫生局决定将吉林市门诊部划归船营区领导。并将船营区的日新、西仓两个门诊部并入该门诊部，即改称吉林市船营医院。
三、改称吉林市第三人民医院
1964年12月经市卫生局决定将吉林市船营医院划归吉林市卫生局领导。于1965年4月20日改称吉林市第三人民医院。
四、组建吉林市第三人民医院革委会
1968年大联合后，工宣队进驻医院，恢复了医疗活动，经市卫生局批准，成立吉林市第三人民医院革委会。
五、恢复吉林市第三人民医院名称
1978年根据全国五届人大会议精神，市委决定不再设革委会，故恢复吉林市第三人民医院名称。
六、吉林省吉林中西医结合医院的诞生
1980年8月在吉林省中医、中西医结合工作会议上，医院被省卫生厅确定为吉林省中西医结合试点医院。1986年5月26日经省卫生厅批准该院正式更名为吉林省吉林中西医结合医院。
七、授予国家三级甲等中西医结合医院及爱婴医院
1994年5月院领导班子决心带领全院职工创建三级甲等中西医结合医院。1995年6月26日至6月28日一举通过国家中医药管理局和吉林省中医管理局的联合评审，被正式批准为国家三级甲等中西医结合医院。
八、成为首批十家国家重点中西医结合医院之一
2008年3月21日～3月22日，经过四年努力，迎来了国家重点中西医结合医院终期评审专家组来医院进行终期评审验收工作，一次性评审验收通过，成功跻身于国家重点中西医结合医院行列。
九、顺利通过国家三级甲等中西医结合医院复审
2011年12月，按照国家中医药管理局关于重新进行医院等级评审工作的总体部署，院领导班子带领全院职工紧紧围绕“超越自我，力保三甲”的工作核心，以评促建，以评促改，于2012年7月16日，顺利通过国家中医药管理局和省中医药管理局专家组的评审验收，为医院的发展史交上了一份满意的答卷。
十、吉林市体检中心成立
2008年11月吉林市卫生局批准成立吉林市体检中心。
十一、吉林治未病中心成立
2009年8月根据《国家中医药管理局关于确定第三批治未病预防保健服务试点单位和试点地区的通知》（国中医药发〔2009〕16号）文件，经吉林市卫生局批准2009年11月成立吉林市治未病中心。
十二、吉林市健康管理中心成立
2012年6月吉林市卫生局批准成立吉林市健康管理中心。
十三、吉林省吉林中西医结合医院二部成立
2015年3月，吉林省吉林中西医结合医院二部正式在吉化疗养院挂牌成立，形成集医疗、养老、养生、康复于一体的新型运营模式。将医学康复融入传统疗养之中，配备由三甲医院专家医师提供的医疗、体检、健康管理等医疗资源和设备仪器，同时为医院需要疗养、康复的人群提供一个更加方便、直接、高效的对接场所。
