上海市中医医院创建于1954年，2005年成为上海中医药大学非直属附属医院。是一所中医特色浓厚、临床科室齐全、医学人才汇聚，集医、教、研为一体的三级甲等综合性中医医院。
医院设有上海市名老中医诊疗所和上海市中医中西医结合专家诊疗所两个专家诊疗中心，云集以国医大师、全国名老中医学术思想继承班导师，上海市名中医为代表的70余位上海中医界最高水平的专家为病人服务。
上海市中医药研究院中医儿科研究所设在这里，与上海市中医药研究院老年病研究所合作成立中医老年病转化医学研究中心、与上海市中医药学会合作成立上海名老中医学术经验研究中心，以此和院级研究所（室）为平台，提高中医药科研能力。医院共承担国家自然基金、国家中医药管理局、国家教育部等各类各级别科研项目多项，拥有国家中医药管理局三级实验室，是国家食品药品监督管理局GCP基地。
医院蝉联上海市文明单位、爱国卫生先进单位等称号。
2020年9月，获得”上海市抗击新冠肺炎疫情先进集体“荣誉称号。
截止至2019年医院开放床位530张，临床科室设置齐全。医院现拥有卫生部国家临床重点专科3个；国家中医药管理局重点学科2个；国家中医重点专科6个；上海市优势专科2个；上海市中医特色专科 5 个；国家重点专科协作组组长单位1个；上海市重要薄弱学科1个；上海市中医新兴前沿交叉学科1个；上海市中医培育专科5个；国家中医药管理局重大疑难疾病中西医协作试点项目 1个；上海市传统医学示范中心1个和上海市中医预防保健示范单位1个。神志病科、儿科、脑病科、肿瘤科、疼痛科、骨伤科、耳鼻喉科、风湿病科、外二科、心病科、脾胃病科、妇科、肝科、肛肠科、护理、医学影像学科、康复科等临床科室优势明显。
医院以师承教育为平台，培养新一代中医“名医”。医院有全国名老中医药专家传承工作室5项、上海市名中医工作室7项、上海市名老中医学术经验研究室7项、上海中医药大学名中医工作室5项、国医大师、全国名中医传承工作站4项，院级老中医工作室5项。
截止至2019年，医院拥有全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师3人、上海市名中医7人、海市海派中医流派传承人才培养项目导师5人，享受国务院特殊津贴12人。加大人才培养力度，近年来，获得上海市领军人才，上海市浦江人才等荣誉。具有正副高级职称171人，博士后合作导师2人、博士生导师16人、硕士生导师88人。医师中硕博比达71.2%、护理人员大专以上学历达95.15%。
医院坚持鲜明的中医特色，中药饮片使用在全市中医院排名前列；截止至2019年，开设专科专病门诊118个。开展“冬病夏治”、“冬令进补”等中医特色工作。医院合理配置医疗设备，引进一批先进的现代化仪器设备，如MRI、64排128层CT、DR、CR、DSA、大型生化仪、聚焦超声刀、主动康复设备等为患者提供保障。年门急诊人次达193万余，年出院人次23000余人。
