安徽扬子鳄国家级自然保护区，是中国较大的扬子鳄保护基地，以扬子鳄及其栖息地为主要保护对象。这里既是一片保护区和科研基地，也是一处风景优美的旅游观光胜地，以自然风光为基调，以扬子鳄为龙头景点，集多种珍稀动物为观赏主体，对扬子鳄保护和繁殖也起到了非常重要的作用。
保护区由朱村片、高井庙片、杨林片、红星片、夏渡片、双坑片、中桥片、长乐片8个片区构成，以中国鳄鱼湖为主要游览地点，开辟了熊池、猴岛、鹿园、竹楼、跑马场、垂钓区、鳄鱼表演、儿童乐园等20多个景点。
沪渝高速公路从宣城西/南陵/泾县/宣城市开发区出口离开，沿宝城路→水阳江南大道→X011即可。
安徽扬子鳄国家级自然保护区地理坐标为：东经118°30′-119°35′，北纬30°18′-31°18′。
保护区湿地地处长江下游丘陵平原水网区，为皖南山区向长江沿岸平原的过渡地带，海拔20～200米，包括河流湿地、湖泊湿地、沼泽湿地等湿地类型，主要由青戈江、水阳江、漳河、南漪湖等水体及周边沼泽滩地组成。
保护区属北亚热带湿润和暖温带半温润季风气候，年均气温15.9℃，年均降水量约1294毫米，年均相对湿度28%，年均无霜期229天。
保护区内南漪湖为宣城市内的天然湖泊，分为东西二湖，湖面面积约为100平方千米，水位为8.5米时，总蓄水量为3.5亿立方米，入湖水流发源于南面山区，出水经水阳江向北流入长江。
保护区土壤类型以红土壤、水稻土、黄棕壤等为主。
1979年1月，经安徽省政府批准在原宣城县南郊创建“安徽省扬子鳄养殖场”。
1982年6月，安徽省政府批准成立安徽省扬子鳄自然保护区。
1986年，保护区升级为国家级自然保护区，更名为“安徽扬子鳄国家级自然保护区”。
保护区内有国家级重点保护植物7种，国家级重点保护动物30种，真菌116种。有野生植物776种，其中蕨类植物28种、裸子植物12种、被子植物736种。国家一级重点保护植物有2种，包括水杉、银杏；国家二级重点保护植物有5种，包括香樟等。作为扬子鳄洞穴隐蔽及营巢用的植物有44种。有野生脊椎动物340种，其中鱼类有54种，两栖类有24种，爬行类有50种，鸟类有176种，兽类有36种。此外，还有昆虫类470种。国家一级重点保护动物有4种，包括扬子鳄、云豹、黑麂和梅花鹿；国家二级重点保护动物有26种，包括虎纹蛙、鸳鸯、白鹇、勺鸡、穿山甲、小灵猫等。保护区为野生扬子鳄主要分布区之一，有扬子鳄分布的池塘面积约0.41平方千米，分布有扬子鳄约150条。
保护区内植被以亚热带常绿阔叶林为主，其中丘陵地区植被以灌草丛为主。人工营造经济林主要有马尾松、国外松、杉木、茶树及毛竹、油桐等树种。
