远远看去，岛上绿荫拥簇，中央白塔耸立，在碧海蓝天的映衬下显得非常秀丽，不时有白鹭从林间飞起，更是增添了几许的诗意。
关于宝珠屿的得名有两种说法：
一是说宝珠屿轮廓似龟，因而也被称为“金龟岛”，岛中部陡崖环绕状似宝珠镶嵌海面，整体看犹如“碧波海面，巨龟驮珠”，故而叫宝珠屿。
另一说法是因岛中建有宝珠塔而得名，这座高15米的宝珠塔，位于岛中部，全部用白色花岗岩砌筑，塔的正门上端刻有楷书“宝珠塔”三字。传说，宝珠塔因塔下有爱国侨领陈嘉庚先生的夫人宝珠之墓而得名。其实皆不然。
据同安志记载：“宝珠屿在高浦所前，海中沙屿也。此屿周围皆石，中有一丘，土赤。屿上草短，遥望如翡翠之珠球，天然佳丽。近附此岛有五条山脉穿入海中，俗称“五龙夺珠”。诸山脉之发源，一自天柱山而降，经灌口至高浦而止；一自天马山而降，经浒井至集美而止；一自白虎岩而降，经后溪至西亭而止；一自岩内山而降，经珩山头至白石而止；一自大帽山而降，经豪山埔至港头而止。其山趋势，皆向宝珠，称“宝珠屿”。
当地百姓也有另一种说法——双龙夺珠。指的是高浦与湖里高崎两翼山脉走向的蛟龙，直伸夺取“宝珠”这颗“珠”就是“宝珠屿”。
南宋朱熹在同安任主簿时，于绍兴二十三年（公元1153年）秋，巡游县（指同安县）之西界安仁里蔡林社时，在霞光依稀中，遥望海中的宝珠屿，被迷人的景色感染，即兴写下七绝《珠屿晚霞》。诗的序文说：“屿在文江（即马銮湾）南流，浮于江，润泽圆美，宛若宝珠。日升时射映江中，水光腾跃，灿若朝霞。”诗云：“宝珠自古任江流，锁断银同一鹭洲。晓望平原灿日色，霞光映入满山丘。”这既是对宝珠屿得名的较好注解，也是800多年来对宝珠屿的惟一绝唱。
