美国长大的日裔女孩芦屋瑞稀（堀北真希饰），因为崇拜日本的国中跳高选手佐野泉（小栗旬饰），千里迢迢回国女扮男装进入与泉同一所的男子高校念书。瑞稀幸运的与泉住同间宿舍，并与泉和足球特长生中津秀一（生田斗真饰）成了好朋友。但是瑞稀却发现，此时的泉已经因为某种原因而放弃了最爱的跳高。瑞稀在泉的身边一直鼓励着他，这种傻呼呼却热情的个性让泉感动，泉渐渐地开启了自己的心灵。瑞稀也因为和泉朝夕相伴，对泉由崇拜转为了爱恋。
其实泉在瑞稀入校的第二天就发现了瑞稀的真实身份，但却没有说破。在朝夕相处下泉慢慢喜欢上了她，他私心的为了让瑞稀能留在自己身边，想尽办法帮瑞稀隐瞒着女生的身份，处处保护着粗心大意的瑞稀。而瑞稀却浑然不觉自己在男生堆中所散发出来的魅力，竟也让粗线条的秀一喜欢上了自己。
可怜的秀一还以为自己是同性恋而苦恼不已，甚至去交女友来忘掉这份感情。但是秀一心中仍然放不下瑞稀，他要怎么办。除了泉，校医梅田北斗也发现了瑞稀是女儿身，但是天生喜欢看热闹的性格使他并没有揭穿瑞稀的身份。倒霉的校医却也因此当上了瑞稀的爱情顾问，被强制倾听她诉说烦恼。
演员 堀北真希
活泼、运动万能（尤其擅长跑步）的瑞莃，是在美国长大的侨生，偶然在电视上看到佐野泉的跳高姿态，从此便对泉崇拜起来。但一次意外使泉腿部受伤（为了救素未谋面的瑞稀），而没能有自信再次站在跳高台上。在美国得知此事的瑞稀，为了使自己心中的英雄能够再次站在跳高台上毅然决定从美国来到樱学院。因泉就读的樱开学院是一所男子寄宿学校，瑞莃毅然剪掉长发，隐藏真正的性别，装扮成男生陪在泉身边。现与泉住同一间宿舍寝室。当瑞莃真正与泉接近之后，她对泉的感情渐渐地由崇拜转化为爱情，而且自己并不知道自己的女儿身已被泉悉破，是个纯真率直的少女。乐天而充满Power，感情的表现十分直接，常笑常怒常睡也常食(其实是大胃王)，甚么事也不轻易挫败的精神，行动比思考先行是她的特征。
演员 小栗旬
樱学园2年级学生，瑞稀的同班同学，和瑞稀同寝室。中学时期是前途光明的跳高选手，可惜因为事故导致踝骨受伤退出一线。已经完全治愈且隶属于田径队，但却不参加活动。表面上看起来很酷难以亲近，一旦了解就能知道他就是个普通的男孩子。超级不能喝酒，就算只是料理或者点心里面有点酒精也会醉倒，然后导致无差别kiss，牺牲者不乏男性。
演员 生田斗真
樱学园2年级学生，瑞稀、泉的同班同学、好朋友，运动万能的足球少年。明明没有注意到瑞稀是个女孩子却对她怀有恋爱的感觉，为此怀疑自己是个同性恋而苦恼不堪。很会营造热闹的气氛，对有关足球的一切都万分认真，有“运动场上的年轻猛狮”的雅号，在朋友眼中则是个热情单纯的人，同时也是下定决心就会全力以赴的类型。对瑞稀的心意也是如此，接受了自己的想法以后就勇往直前了。
演员 水岛宏
樱学园第二寮的宿舍长，高三。是个外表花哨花花公子式的人物，不过有着很强的领导能力，也很照顾后辈，是瑞稀他们都很佩服的学长。常常帮助瑞稀。他还是“花樱会”的成员，履行着学生会长般的职责。国中时期有一段难以忘怀的初恋。
演员 石垣佑磨
第一寮寮长，空手部主将（空手道社长）。现今难得的古风硬派热血汉，空手道场的继承儿子，喜欢空手道。
演员 姜畅雄
樱开第三宿舍的宿舍长及演剧部部长，讨厌本名，自称“Oscar．M．姬岛”。因曾祖父是德国人，所以常说德国语。大近视，神出鬼没，喜爱美丽的东西，不论性别，但最最喜欢的是自己，公认的自恋狂。
1.主角堀北真希和小栗旬，两人04年在电影《东京少年》中曾经合作双双扮男生。在该剧中堀北真希，为了女扮男装的角色，她剪了有史以来最短的发型。
2.在该剧中堀北真希为求演得神似，学足男人说话语气，还不顾仪态尝试粗鲁坐姿。
3.在该剧中生田斗真连吻小栗旬十二次，赞对方双唇软绵绵。
4.电视台为配合宣传，搞了全国性校草选举，女学生也可反串参加。
《花样少年少女》这部剧男主角原本属意锦户亮，但他忙于开“关西Johnny 8”111场演唱会，所以就改由小栗旬顶上。
日版《花样少年少女》更重视于漫画原著，而堀北真希的男装扮相也很英姿飒爽。比起台版《花样少男少女》，日版的许多场景与设计，更加梦幻与夸张。（网易娱乐评论）
大结局中，不仅是女主角堀北真希以“女装”示人，就连小栗旬、生田斗真等男演员也反串上阵，众人的女装扮相搞笑非常，成为焦点所在。（新浪娱乐评论）
《花样少年少女》最被人们称赞的并不是多如牛毛的少年青年们，而是相当接近原著的女主角芦屋瑞稀。由于本剧本身就是根据少女漫画改编，加上内里情节多少有些刻意服务喜欢男男恋的女孩们，所以尽管日剧伊始借用堀北真希大肆宣传，到了播出甚至后期宣传，却一再给出一些时下流行、让少女们脸红心跳的男孩暧昧，比如剧中演员小栗旬和生田斗真，以及小栗旬和成田优的亲吻，这都让女性尤其是喜欢男孩暧昧的女性观众双眼放光。无论如何，有精彩的漫画原著摆在那里，日剧版并没有更改多少内容，无怪乎能成为不少原著粉丝如获至宝的追逐对象了。（新浪娱乐评论）
