秦淮区图书馆于2013年10月由原秦淮区图书馆和原白下区图书馆合并组建而成。合并后的图书馆分处原秦淮区图书馆和原白下区图书馆两处服务阵地。原秦淮区图书馆于1961年10月在南京新姚家巷22号原民国南京大戏院遗址建成开放。1987年8月，进行原址翻建后的新馆大楼于新姚家巷24号落成，开放成为具有规模的区级图书馆，初期藏书量93178册。
图书馆始终坚持“读者至上”的办馆宗旨。阅览室每周开放时间63小时，借书室（处）每周开放时间49小时，周六、周日和节假日照常对外开放。
图书馆自2013年起先后在区政府、老干部局、部队、区党校、社区、企业、学校设立了“图书流通服务点”。2012年，借助“南京市市、区（县）、街（镇）、社区（村）图书馆通借通还一卡通服务”建设工作的契机，先后成立了3家图书馆分馆，让图书先一步在区馆与分馆间流通。
图书馆每年定期在郑和广场、夫子庙广场、秦虹广场等地举办图书馆服务宣传周活动、“4.23世界读书日”广场阅读活动、12月全民读书月活动、秦淮区学习节等广场阅读活动；开展“红领巾”读书征文、演讲活动；举办专题图片展；举办专题书展；举办公益讲座；“图书驿站”、“南京秦淮地方文献展评”、“我心目中的秦淮灯会”等活动在社会上引起很大反响，获得广泛赞誉。
作为文化信息共享工程区级支中心，图书馆借助共享工程资源深入社区、学校、部队等地，带去优秀影视资源、讲座培训等；辅助、指导街道、社区（村）共享工程基层服务点建设，并与之联合开展各种惠民活动。
图书馆1999、2005、2010和2013年连续4届评估定级工作中，被国家文化部授予“国家一级图书馆”称号并授匾；1987至2010年，连续八届获得“江苏省文明图书馆”称号；1998年至今，在江苏省公共图书馆优秀服务成果评比活动中，多次获得一、二、三等奖；连续多次被授予“爱国主义教育基地”称号等。
原秦淮区图书馆功能室设三库九室，即古籍书库，两个基藏书库；报刊阅览室、少儿借阅室、借书室、参考咨询室、电子阅览室、视障阅览室、古籍图书室、旅游图书室、微机室。
原白下区图书馆功能室设有借书处、报刊阅览室、少儿阅览室、过期期刊阅览室、电子阅览室、视障阅览室、地方文献阅览室、工具书阅览室、多功能学术报告厅。
原秦淮区图书馆于1961年10月在南京新姚家巷22号原民国南京大戏院遗址建成开放。1987年8月，进行原址翻建后的新馆大楼于新姚家巷24号落成，开放成为具有规模的区级图书馆，初期藏书量93178册。后期经多次大规模调整，截止目前图书馆馆舍面积达1120平方米，藏书量21.44万册，报刊270种，在编人员6人。
原白下区图书馆始建于1981年，1997年新馆建成，地处长白街219号，延用至今。图书馆馆舍面积1500平方米，目前为止藏书21万余册，报刊350种，在编人员6人。
