日本国立国会图书馆有两个源流。一是设立于1890年、隶属于旧宪法下帝国议会的贵族院众议院图书馆，另一则是设立于1872年、隶属于文部省的帝国图书馆。其中帝国图书馆经历了自书籍馆（1872）、东京书籍馆（1875）、东京府书籍馆（1877）、东京图书馆（1880）至帝国图书馆（1897）的变迁。1947年改称为国立图书馆。
日本国立国会图书馆 （Nippon Kokuritsu Kokkai Toshokan; National Diet Library）由于帝国图书馆在第二次世界大战前就是接受缴送本的图书馆，因此，其藏书包括了明治以后日本出版的所有出版物，两个图书馆的藏书成为NDL藏书的重要基础。该馆是以美国国会图书馆为模式建立的，1948年6月5日正式向一般读者开放。
日本国会图书馆，既为国会提供服务，又承担国家图书馆职能。图书馆提供国会会议记录、法令、年报、图片、历史记录，另外还有贵重文物、近代图书的图片数据库，资料很丰富。
日该国立国会图书馆1959年6月进行机构调整时，成立了藏书构成审议会。1971年依据藏书构成审议会答复馆长咨询的报告，该馆制定了"国立国会图书馆图书收集的指导方针"（昭和四六年馆长决定第二号）。
随着时代的发展，科学技术的进步，图书馆的社会功能也在变化。在这巨大的变化之中，国会馆重新认识自身应起的作用，研讨既定的图书收集方针。1992年5月，该馆成立了收集企画委员会，取代了持续近33年的藏书构成审议会。通过研讨，收集企画委员会就图书收集的指导方针提出委员会报告，经馆长主持的会议讨论，1993年6月1日该馆制定了新的"资料收集的指针"（平成五年馆长决定第二号），对1971年的收集方针进行了全面的修订，即确定了新的指导方针。
一、收集的目的和基本方针
为谋求适应时代发展的藏书构筑，有助于达到国立国会图书馆法第二条所规定的国立国会图书馆之目的，进行图书及其它图书馆资料（以下称资料）的收集。国内的资料，作为日本的文化遗产和信息资源，广泛地收集。国外的资料，选择性地收集。
二、国内的资料
新出版的国内资料，除了出版者的赠与、遗赠或依法第二十四条至第二十五条之规定缴送的外，用于使用和保存所必需的复本，依靠购入及其它方法收集。未收入的国内资料，努力通过购入、赠与、调拨和缩微化及其它方法收集。
三、国外的资料
国外的资料，通过购入、国际交换、赠与及其它方法选择性地收集。特别注意收集下列各类：
1. 法令、议会资料
2. 与日本有关的资料
3. 参考图书
4. 科学技术及相关资料
5. 国际机构与外国政府的有关资料
四、电子出版物等
国内出版的电子出版物或馆外制作者做成的数据库，不拘第2项之规定，进行选择性地收集。在收集国内出版的电子出版物时，通过与发行者及有关机构、团体的协作获得。
五、立法及相关资料
除了第2项至第4项所规定收集的资料之外，为帮助国会议员履行职务所需的资料或情报，不限于其形态、种类，力求尽可能迅速地收集、利用。
六、由复制而成的藏书维护
收集到的国内资料，在有必要作为藏书的原始资料保存或提供适当的利用时，通过缩微化、电子化及其它方法进行复制。
七、与图书馆等单位的协作
进行资料收集时，力求与全国各类图书馆或资料收藏机构交换必要的情报，建立收集的协作体制。
八、资料收集方针书的作成
以本指导方针为依据，对应当收集的资料形态、种类、范围、语种、主题和优先次序以及在进行其它资料收集时必要的事项，在资料收集方针书中另行规定。
九、指导方针的修正
对应利用者的需求、出版物的多样化、印刷技术和信息通信技术的发展，本指导方针大约每五年重新予以审视，进行必要的修正。
在这个"资料收集的指针"中，该馆首次使用了"电子出版物""数据库"等词汇，表明"电子化"的浪潮越来越波及图书馆以及国会馆适应这种形势要求的姿态。1995年该馆依据"资料收集的指针"作成收集工作的指南"资料收集方针书"，1997年作为补充版策定了"面向21世纪的藏书紧急整备计划"，制定关西馆（暂称）、国际儿童图书馆（原支部上野图书馆）应收集的资料，外国资料、电子出版物整备的基本方针与实施计划。
收集部负责并与全馆各部局协作。在收集部设收集企画委员会，约10人组成。任务是研究本馆资料收集方针、藏书构成、选书体制等事宜，向收集部长报告。必要时，在委员会内设小委员会对专门问题进行调查研讨。具体的采选由"选书调查委员会"担任，委员会的成员由全馆各部局的专门人员组成。目前在该委员会下设12个分会，即议会法令分会；政治行政分会；经济产业分会；社会劳动分会；人文科学分会；科学技术分会；亚非分会；参考图书分会；图书馆学分会；日文古籍分会；儿童图书分会；关西馆配置资料特别分会。各分会根据分配的年度预算进行采选。
主要通过呈缴、购入、捐赠、寄托、交换5种方式。所谓寄托就是将个人、团体所持有或管理的图书及其它资料，在相当长的时期内在国会馆保管，以防止其损伤与散失，同时供读者使用，以利于日本学术振兴与文化的发展。作为资料收集的方法之一，可以接受寄托的仅限于通过呈缴、购入、捐赠和交换难以收集到的资料，它是国会馆藏书构成的一个必要部分。
日本的出版物缴送制度及缴送方式
日本现行的出版物呈缴制度是在1948年2月9日颁布的《国立国会图书馆法》中确立的。该法在规定了国会馆设立的目的、任务、组织机构的同时，也规定了国内的出版物须向该馆呈缴，并对呈缴出版物的范围和数量、呈缴的义务人、呈缴的免除、国会馆对呈缴义务人的补偿以及违法的处罚等进行了规范，由此确立了日本的出版物呈缴制度。
近几年，随着信息技术的发展，电子出版物显著增加，加以收集和保存便成为国会馆迫切的课题。面对在呈缴制度创立之初无法想象的CD-ROM、DVD等电子媒体大量出现的状况，2000年4月7日，日本制定并颁布法律，对国立国会图书馆法作了部分修正。即呈缴制度在时隔50年之后进行了修订。并于同年10月1日开始施行。
日本的出版物呈缴制度的规定
主要有以下内容：
·呈缴出版物的范围·
图书；小册子；连续出版物；乐谱；地图；电影胶片；录音制品、以印刷及其他方法复制而成的文书或图画；唱片；通过电磁方法以及通过人的知觉无法认识的方法记录文字、图像、声音或程序的物品。
作为应当向国立国会图书馆呈缴的出版物，新修订的呈缴制度增加了"通过电磁方法以及通过人的知觉无法认识的方法记录文字、图象、声音或程序的物品"。将这些固定在有形物上的电子化媒体出版物称之为封装（package）型电子出版物。
·呈缴的义务人·
国家机关及地方政府、公共团体出版物的发行者和民间出版物的发行者。
·呈缴出版物的数量·
国家机关、地方公共团体等的出版物发行时直接向国立国会图书馆呈缴最多不超过30部，以供馆内使用、与外国政府出版物的交换及其他国际性交换。由馆长根据需要决定都道府县出版物呈缴5部以下、市（含特别区）出版物呈缴5部以下、街村出版物呈缴3部以下的具体数量。
为文化遗产的保存及其利用，民间团体及个人发行的出版物，在出版物发行的30日以内，向国立国会图书馆呈缴内容完整的最佳版1部。
·呈缴的免除·
按照机密处理的、以及公文格式的和过于简易的国家机关出版物；再版出版物与前版或初版内容没有增减或变更，并且前版或初版已呈缴或捐赠、遗赠。
暂时免除电影胶片的呈缴。
·国会馆对呈缴义务人的补偿·
国会馆对依法进行民间出版物呈缴的义务人支付"相当于通常所需费用"的补偿金。补偿金是实施呈缴所需各项费用的累加，包括1、出版费用（图书及录音制品定价的4成以上6成以下；胶片摄影资料定价的5成以上7成以下；盲文出版物的4成以上8成以下；连续出版物的4成以上5成以下。2、邮寄出版物所需的最低费用3、为呈缴所需的所有事务代理费用4、包装费用。
·以捐赠方式的呈缴·
国会馆将定期编制的全日本出版物目录（载有捐赠出版物的）免费邮寄给捐赠者或捐赠者的继承人。
·违法的处罚·
对无正当理由不履行呈缴义务的发行者，处以出版物零售定价5倍以下"滞缴金"。如果发行者是法人，则处罚对象是法人代表。
国家机关出版物（政府出版物）
由国家机关、地方公共团体等的出版物发行者直接向国立国会图书馆呈缴。政府各省厅和最高裁判所发行的出版物通过设在各自机关的属国会馆的35个支部图书馆进行收集。每周1次由在各支部图书馆间的巡回联络车向本馆呈缴。其他政府机构、地方公共团体、国家和公立大学等出版物每次发行时通过邮寄呈缴。
1、通过经销途径呈缴
通常，日本出版流通渠道的形式是出版社委托书籍经销商和零售书店发售，通过经销商配售给全国的零售书店，3个月后收回售出的书款，剩下的书也由经销商送还。因此，从1953年起，对民间团体及个人发行的出版物，国会馆委托日本出版经销协会通过2家图书经销商ト-ハン株式会社（东贩，原名东京出版贩卖株式会社）和日本出版贩卖株式会社（日贩）以半年为单位，轮流承担收集新版图书代为发行者呈缴业务。对接收的新版书，每周2次向国会馆呈缴。以此种方式呈缴的约占全馆呈缴的民间出版物总量的65%。针对由于种种原因造成漏缴的情况，国会馆与日本出版经销协会、东贩以及日贩共同协商，1991年开始通过这2家经销商向全国的出版物发行者散发宣传品，督促呈缴。为了改善以往用传统的手工作业调查经销商新版图书来确认漏缴的状况，1992年国会馆引入并实施通过经销途径的呈缴本调查、兼有复本书的选书、订购、接收业务机械化系统 BACCAS（Book Acquisition and Checking Computer Assisted System）。由东贩和日贩提供出版和呈缴本情报，系统确认漏缴， 1998年该系统升级为可以管理所有民间出版物的系统"国内出版物收集管理系统"。新系统可以将各经销商的情报联机读取，从而大大提高了查漏催缴的效率，迅速掌握呈缴的情况。
2、其它民间出版物的呈缴
不通过日本出版经销协会代办呈缴的地方出版物、直接发售的出版物、自费出版物、各团体的出版物，由发行者直接呈缴。但由于没有象东贩和日贩那样代为呈缴的组织，发行者对呈缴义务也不一定完全清楚，所以国会馆采取了以下做法：
对地方出版物，委托地方和小型出版物流通中心代理呈缴业务。以每月2次的频率进行收集。此外还依靠都道府县图书馆提供的该地区出版物信息以及读者、各图书馆、本馆职员提供的信息进行督促呈缴。
对自费出版物，由于大多为歌集、文集、自传和回忆录，其出版制作大部分由出版服务商承揽。因此，国会馆请各出版服务商将其经手的出版物代为委托者呈缴。
3、唱片的呈缴
主要经加盟日本唱片协会的各公司呈缴，1991年已有27家。现在以呈缴CD为主。
4、连续出版物的呈缴
大部分由发行者直接呈缴。
5、电子出版物的呈缴
在新的呈缴制度实施之前，加盟日本电子出版协会（JEPA）的各公司的出版物，由该协会进行呈缴，主要以书目、辞典类为主。目前国会馆正在与发行者、著作权者探讨新的呈缴制度规定的作为呈缴对象的"封装型电子出版物" 呈缴的途径及补偿金等问题，以建立适应电子出版物发行渠道的呈缴方法。
对于民间出版物，法律规定国会馆应给呈缴者补偿金，并对各类出版物明确了具体的额度。但国会馆在实施中进行了简化，原则上补偿图书销售价格的50%，再加上邮寄费和包装费等。
国会馆通过以上的呈缴方式进行国内出版物收集达到相当可观的数量。以1999年度图书为例，该馆新入藏日文图书146，702册；呈缴的政府出版物图书31，290册，民间出版物图书101，085册，呈缴的图书占90%。
宪政资料 收藏了日本自19世纪后叶以来的近代政治发展史的文献资料和日本近代政治家、外交家、军事家及其官吏和实业家等日本近代政治人物所收藏的日记、书信、备忘录草稿和办公文件等，计23万件。此外还有太平洋战争后日本被占领时期联合国司令部的全部重要文件计3000万页的缩微胶片。
法令、议会资料 包括日本在内的30个国家的国会议事录和约100个国家的政府公报、法令集、判例集、条约等重要资料。其中日本资料16万册，外国资料19万册。
科技资料 除收藏国外科技期刊25,500种外，还收集PB、AD报告，原子能与能源报告、外国博士论文、学会出版物以及标准等。
地图资料 收藏有40万张地图。其中有日本明治时代至今由官方制作的地形图、地质图、航海图和地形图。还有住宅图26,000张。
音乐资料 收藏约45万张唱片，占日本收藏之首。
有关日本的西文资料 即外国人著述的有关日本的资料。其中包括16世纪初期基督教传教士的报告书。
古籍图书 除收藏日本古籍2.5万册外，还收藏许多中国历代特别是清朝的文献、族谱及地方志。
亚洲资料 收藏了36万册亚洲、中东、北非地区有关政治、经济、历史和文化等方面的资料。中朝文资料占主要部分。有中文图书25万册、期刊2,800种、报纸230种。
3.馆藏数量
截至到2000年3月，国立国会图书馆的藏书量为：
图书7,312,178 册 （日文图书5,153,408册; 西文图书 2,158,770册 ）。
连续出版物163,097种（国内期刊102,796种，报纸6,906种； 国外期刊51,877种，报纸1,518 种）。
非书资料为缩微胶卷278,126卷； 缩微胶片6,412,923 张； 唱片455,430张； 光盘15,258张； 国内博士论文36万份；文书类253,070件； 报纸剪辑资料2,009,226张； 地图419,049张。
日该国立国会图书馆成立于1948年2月，隶属日该国会，是日本的国家图书馆，也是国内最大的公共图书馆。该馆的馆藏丰富，主要收藏宪政资料、法令、议会资料、科技资料、地图资料、音乐资料、古籍图书及亚洲资料等。1998年藏书量为图书688万册，期刊和报纸15万种，缩微胶片612万张，唱片43万张，博士论文32万份，地图40万张。馆内的组织是由中央馆、国会分馆、支部上野图书馆、支部东洋文库以及行政司法各部门的35个支部图书馆构成，现有职员851名。
1948年2月9日，日本颁布《国立国会图书馆法》规定该馆"以搜集到的图书及其它资料，在协助国会议员完成公务的同时，对行政和司法部门以及日该国民提供法律上所规定的图书馆服务为目的"。因此，为国会服务是该馆的首要任务，是国会馆服务的重点。
为了从组织上保障对国会的服务，国会馆依照法律设立了专门机构"调查及立法考查局"，并配备了专门调查员等各学科领域的高级专家。其任务是：
1、根据要求，对国会两院委员会中悬而未决的法案和由内阁提交国会的案件，进行分析、评价，向两院委员会提出建议并提供可作为决策这些案件的依据材料。
2、根据要求或未来可能提出的要求，主动收集立法资料和有关资料，加以分类、分析、翻译、进行编辑，作成索引、摘要、报告等，并做其它的准备工作。所选择和提交的资料不能带有党派、官员的偏见，为两院、委员会及议员提供有用的资料。
3、应委员会或议员的要求，在立法的准备阶段，协助委员会和议员起草议案。
4、在确保满足国会两院、委员会及议员需要的前提下，将所收集的资料提供给行政、司法各部门和一般读者使用。
调查及立法考查局在建馆时设有5个课共48人。随着业务的不断扩大，为国会服务职能的强化，发展至今已有1个综合协调室、11个专门调查室及14个课，工作人员130余名。
在为国会的服务中，国会馆是以调查及立法考查局、国会分馆为中心，在全馆的协作下共同完成的。所提供的服务主要是立法调查服务和图书馆服务。
立法调查服务包括委托调查和预测调查。委托调查就是根据国会议员的委托和要求，进行法案及案件的分析、评价，对政治、经济、社会等诸多方面的国政课题和国内外事件、各种制度进行调查，作成法案纲要，提供信息服务等。这种调查在国会馆的立法调查服务中占有很大比重。如1997年度委托调查的事项集中在政治伦理、中央省厅的改组、日美防卫协力指针、金融系统动荡与稳定化对策、产业结构改革及医药事业等问题，总件数为29,553件，其中口头答复2,365件，文献提供（借出、复制等）24,407件，书面答复（调查报告等）2,781件。
预测调查就是对未来国会审议的事项进行预测性研究，预先进行调查。对日常性的调查，每年度制定"基本调查业务计划"，并加以实施。1997年度按计划完成的预测调查共计116件。在基本调查业务中，有些重要课题是由多个调查室和课共同完成的。如1996年度开始的"环日本海的区域及经济交流的现状与展望"的调查，计划用3年时间完成。
在进行预测调查时，根据需要，调查及立法考查局举行各种"说明听取会"，邀请社会上有关专家发表见解。如在1997年度就举行了15次这样的会议。有针对性地听取专家的论点，成为预测调查过程中不可缺少的一项重要内容。
调查及立法考查局出版10种文献，立法调查服务的部分成果刊登在这些出版物上。有月刊《参考咨询》、不定期刊《调查与情报－ISSUE BRIEF-》、双月刊《海外信息指南》、双月刊《国外立法》，分发给国会议员、各政党总部和两院事务局等。另外还编辑《日本法令索引》、《国会会议录总索引》以及宣传资料、工作参考资料等。
为了更好地开展立法调查服务，调查及立法考查局不断加强服务的基础建设。除馆内的藏书外，专门收集入藏立法资料、议会资料和法令资料等，作为调查业务之用。引进国内外的数据库，致力于业务信息系统化。开发了国会会议录提供系统。为充实对国会的服务，1996年度开始研制"国会咨询综合系统"。该系统应用最新的信息通讯技术重建调查业务，将国政调查活动中所需要和被预测的情报电子化。计划用3年时间，装备机器设备，实现资料的数据库化和从接受国会咨询到答复的自动化，以使服务更加高效和快捷。
为了便于国会议员直接到馆利用馆藏资料进行调查研究，国会馆设置了国会议员专用的阅览室和研究室。议员阅览室设有30个座位，收藏有众、参两院的会议录、委员会会议录、公报、官报、法规等议会及法令资料。各种工具书、地图以及期刊、报纸、本馆的出版物等。由议员著述的图书作为"议员著作文库"也陈列于此，供阅览使用。1997年度利用该阅览室的议员为258人，资料阅览2,661册，对212名议员外借资料884册。
议员研究室设有20个个人研究室、3个共同研究室和1个特别研究室。1997年度利用研究室的议员为1,506人。
国会馆除提供立法调查服务外，馆内各个部门对国会议员及国会有关人员广泛开展文献的阅览、外借、复制和参考咨询等图书馆服务。以1999年为例，该馆完成委托调查服务29,656件（其中来自国会的委托调查28,573件），预测调查115件。对国会议员、国会人员的图书馆服务为外借资料38,464册，复制7,091件，咨询处理5,339件。
国会分馆设在国会议事堂内，因此处在为国会服务的前线。馆内收藏有众、参两院会议录、委员会的会议录、议案等议事资料和以社科为主体的普通图书、各种工具书、国内外期刊及报纸等。它以有利于国政审议的资料和最新的信息为中心，向国会议员及国会有关人员迅速地提供图书馆服务。对新入藏的图书和期刊报纸，编辑发行《新到图书》和《剪报资料·篇目一览》，分发给议员以及政党休息室，以便于利用。近年来由于政治及社会形势呈现多样的变化，要求查询的事项涉及范围广，且需立即作出答复的情况增多。为了满足需求，国会分馆利用馆藏资料、国会馆的各种数据库及外部数据库，迅速准确地进行咨询处理，提供服务。
为了协助行政、司法等政府机关完成公务，NDL向这些部门提供图书馆服务。主要通过设置在各省厅和最高法院内的35个支部图书馆完成。中央馆以图书馆协力部为中心，与各支部图书馆之间形成网络，相互协作。同时也对行政、司法各部门的职员直接提供服务。
该服务主要通过参考咨询、资料的阅览、外借等形式提供。对来自行政、司法各部门的咨询，各支部图书馆根据需要，有时要与中央馆和其它支部图书馆开展协作共同进行。中央馆和支部图书馆之间通过馆际互借制度，相互提供方便，以满足需求。1999年度各支部图书馆的利用状况是：咨询处理165,822件(33馆），阅览人数537,886人(33馆），阅览857,537册(24馆）。
该服务分别在中央馆及国际儿童图书馆（原上野图书馆）、支部东洋文库进行。服务的对象包括各类图书馆、地方公共团体、调查研究机构、企业等，学术研究及其他人员，不问国籍，任何人都可到馆阅览，利用资格为20岁以上的成人。国际儿童图书馆主要读者为18岁以下的未成年人。
根据该馆的规定，除国会议员和国会人员外，馆藏资料不直接外借给个人，只能在馆内阅览，但可通过各公共图书馆、大学图书馆和专业图书馆与NDL互借，间接地借阅使用。对一般读者开放的阅览场所，其中有些在使用时有一定的限制和需办理特殊的手续，如一般研究室、宪政资料室、古典籍资料室、音像资料室等。
该馆对一般读者的服务分为对来馆型读者和非来馆型读者的服务。其服务内容是：对来馆读者，提供阅览、复制、参考咨询等，对不来馆者，解答电话或书面形式的咨询，向图书馆出借文献、邮寄复制资料等。为了更加有效地对非来馆读者提供服务，1997年开始使用NDL-ILL系统进行馆际互借、受理邮寄复制资料的请求。
据1999年度统计，中央馆借出资料（馆际互借）11,976册，对非来馆读者经邮寄、电传受理的资料复制30,557件，电话咨询66,703件，书面咨询53,371件。
1999年全年开馆232天，来馆读者人数419,880人，日平均读者人数1,810人。对来馆读者提供阅览的资料，图书出纳台提供503,073种，期刊出纳台提供961,725种，12个专门资料室提供416,925种。另外，复制资料298,254件，咨询解答183,391件。
NDL自1975年开始制作馆藏学术文献的录音磁带，可通过盲文图书馆进行借阅。1981年开始发行《盲文图书·录音图书全国联合目录》。为促进馆内外资料的利用，还编制了数十种书目、索引和专题目录。
国立国会图书馆由中央馆（总务部、调查及立法考查局、收集部、图书部、逐次刊行物部、专门资料部、图书馆协力部）国会分馆、国际儿童图书馆（原支部上野图书馆）、支部东洋文库以及行政司法各部门的35个支部图书馆组成。具体设置机构如下：
总务部 下设总务课、企画课、人事课、会计课、厚生课、管理课、情报系统课、关西馆准备室。
调查及立法考查局 下设庶务课、综合协调室（下设调查联络课、调查资料课）、法令议会调查室（下设法令议会资料课）、政治议会调查室（下设政治议会课）、行政法务调查室（下设行政法务课）、外交防卫调查室（下设外交防卫课）、财政金融调查室（下设财政金融课）、工商科学技术调查室（下设工商科学技术课）、农林环境调查室（下设农林环境课）、国土交通调查室（下设国土交通课）、文教调查室（下设文教课）、社会劳动调查室（下设社会劳动课）、海外事件调查室（下设海外事件课）。
收集部 下设收集企画室、资料协调室、资料保存对策室、收集课、国内资料课、国外资料课、资料保存课。
图书部 下设图书整理课、书目课、古籍课、图书阅览课。
逐次刊行物部（连续出版物部）下设期刊课、报纸课、复制课、索引课。
专门资料部 下设参考课、官厅资料课、政治史料课、科学技术资料课、亚洲资料课、特别资料课。
图书馆协力部 下设图书馆研究所、视觉障碍者图书馆协力室、支部图书馆课、国内协力课、国际协力课。
国会分馆 下设阅览课。
国际儿童图书馆 下设企画协力课、资料情报局。
行政、司法各部门支部图书馆(35馆） 支部会计检察院图书馆、支部人事院图书馆、支部内阁法政局图书馆、支部日本学术会议图书馆、支部内阁文库、支部公正交易委员会图书馆、支部宫内厅图书馆、支部总务厅图书馆、支部总务厅统计图书馆、支部北海道开发厅图书馆、支部防卫厅图书馆、支部防卫设施厅图书馆、支部经济企画厅图书馆、支部科学技术厅图书馆、支部环境厅图书馆、支部国土厅图书馆、支部警察厅图书馆、支部法务省图书馆、支部外务省图书馆、支部大藏省图书馆、支部文部省图书馆、支部厚生省图书馆、支部农林水产省图书馆、支部林野厅图书馆、支部通商产业省图书馆、支部工商技术院图书馆、支部特许厅图书馆、支部运输省图书馆、支部海上保安厅图书馆、 支部气象厅图书馆、支部邮政省图书馆、 支部劳动省图书馆、 支部建设省图书馆、支部自治省图书馆、支部最高裁判所图书馆。
国立国会图书馆的组织运营，是由馆长主持、副馆长及各部局长参加的馆务会议对重要事项进行审议、研究、作出决策。对各种专业性、技术性问题、设立常设或临时性的委员会、审议会进行研讨和管理。各部局履行各自的职责，它们是：
总务部 为保证全馆业务工作有序正常运行，谋求业务进一步合理化、高效化，规划业务的自动化和强化协调整功能。
调查及立法考查局 为国会服务的专门机构。对来自国会的需求作出迅速准确的反应，全面充实和强化调查职能。
收集部 强化文献收集职能，有效实施收集计划，完成资料总括登录，将资料送交各部局。
图书部 接收、整理加工收集部送来的图书，保管国内外图书，并提供使用。
逐次刊行物部 根据连续出版物特点进行整理保管和迅速提供利用。
专门资料部 统一整理保管和提供利用科技报告、官厅资料、国际资料和音像、地图等各种专业资料群。参考咨询也是该部的主要业务。
图书馆协力部 推进与国内外各种图书馆、图书馆团体的协作和联合。开展对视觉障碍者（盲人）图书馆的服务。
国会分馆 设在国会议事堂内，是为国会议员、国会职员及有关人员服务的，它的前身是帝国议会的贵族院众议院图书馆。
国际儿童图书馆（原支部上野图书馆） 馆舍利用前帝国图书馆旧址。支部上野图书馆经过改建，成为国际儿童图书馆，2000年5月第1期开馆，2002年建成。
支部东洋文库 是根据与财团法人东洋文库的协议，作为NDL的分馆之一运营的，收藏有丰富的亚洲文献。
行政司法各部门的35个支部图书馆 与中央馆既相互联系，又保持相对的独立性。它们各自分担收集资料，协助调查活动，开展业务工作。隶属在政府各省厅和最高裁判所之下，这种支部图书馆制度在世界国立图书馆中是独一无二的。
国立国会图书馆隶属日该国会，为国会的常设机构。受众参两院议院的运营委员会领导。作为审查机构，对该馆在运营上必须的各种规程、业务状况及预算等进行审查与认可。在该馆之上还有一个作为咨询建议机构的联络调整委员会，由两议院的运营委员会委员长、最高裁判所长官任命的最高裁判所裁判官1名、内阁总理大臣任命的国务大臣1名组成。其任务是对NDL服务工作的改善提出建议。
1948年2月9日，日本颁布了《国立国会图书馆法》，正式宣布建立国家图书馆即国立国会图书馆。
日该国立国会图书馆具有双重职能。它既是日本的国家图书馆，也是国会的图书馆。《国立国会图书馆法》明确指出该馆"以搜集到的图书及其它资料，在帮助国会议员完成公务的同时，对行政和司法部门以及日该国民提供法律上所规定的图书馆服务为目的"，由此规定了国立国会图书馆服务的对象为：国会议员、政府机关、普通国民。为国会服务居首要位置，是它服务的重点。
国立国会图书馆是唯一法定接受缴送本的图书馆，它收集的国内出版物作为日本的文化遗产将进行永久性的保存，因此同时具有保存图书馆的作用。在信息化的社会中，作为国家的文献信息中心，对来自国内外各方面的需求，提供迅速准确的服务。
人员
国立国会图书馆馆长由两议院议长在与两议院运营委员会协商之后经国会认可，由议长任命，副馆长由馆长提名，经两议院议长同意后任命。馆长享有国务大臣同等待遇，副馆长享有内阁各省次官的同等待遇。馆长下设1名副馆长。
工作人员属于国会职员。新职员每年通过公开考试录用。职员分专门调查员、调查员、参事、司书及其他人员。1999年包括馆长、副馆长在内，共有职员862名。
培训
日该国立国会图书馆的职员研修，是根据国会职员法第27条之二第1号的规定"关于国会职员的教育训练事项"，各种研修每年作为一项制度加以实施的。与1948年开馆同时开始的职员研修，在研修体系与组织上几经变迁，从95年开始实施的职员研修分为必修和任选两大部分。
必修研修包括：新录用职员研修、职员基础研修、4级研修、7级研修、管理职员研修。
任选研修包括：图书馆情报学研修（公共讲座、专门研修）、调查业务研修、支部图书馆职员司书业务研修、外国语研修、职员特种研修。
除了必修和选修研修之外，还有委托派遣研修、接收委托研究、研修。
各种研修概要如下：
⑴、新录用职员研修
对新录用的职员，给以他们作为国立国会图书馆职员所必需的心理准备知识。以此为目的，实施约10天。4月份录用的职员，最初分配在人事课，在为期10天的研修中采取可以专职进行研修的体制。研修结束后分配到各部局。另外，对7月、10月份等年度中期录用的职员，在第一天进行必要的最基本的培训之后立即分配到各部局，到第二年的4月再接受本研修。研修的内容除了国立国会图书馆的组织与功能、各部局的业务概要、生活向导、图书馆利用法（资料、目录、数据库）这些传统的科目外，新增了"公务员需知"、" 图书馆馆员基本知识"、"关西馆"等内容。
⑵、职员基础研修
为入馆第2、3年的职员实施的研修。可以在2年中学完必修和选修科目。每期1个月左右。这是为适应研修生的教育经历和基础能力而开设的。在提供研修机会时使之具有某种程度的灵活性。
科目设有总论、图书馆服务、图书馆资料、资料的组织化、情报管理、图书馆的组织与运营等内容，各科内容分为概论和专论，概论为必修科目、专论为选修科目。另外还组织到公共图书馆、高校图书馆和专业图书馆参观等。
⑶、4级研修
对于提升为股长、副调查主任4级职务者，这种研修是以有助于提高他们作为骨干职员应具备的能力和见识为目的。力求掌握有关馆内运营工作的基本情况，同时，放眼国内外图书馆和图书馆界的动向，扩大视野。除了要完成规定的科目外，其重点是"馆外机构实习"，在公共、大学、专业图书馆等进行为期4天的实习体验。这种研修历来是作为"骨干职员研修"实施的，在约20天的时间里，必修、选修科目每年略有不同，规定接受培训9个科目以上。1995年起新设了抽象能力训练、精神健康等科目。
⑷、7级研修
对于提升为课长助理及调查主任7级职务者，这种研修是以有助于提高其职务所要求的综合性的业务能力为目的，是1995年开始新实施的研修。
⑸、管理职员研修
这种研修是以提高管理岗位职员的能力和见识为目的实施的。1996年以后采用聘请外单位教师进行实验性讲课为主体的研修方式。
⑹、图书馆情报学研修
这种研修是以提高职员有关图书馆情报学特定主题的专业知识。利于图书馆业务的完成为目的实施的。研修分为以讲课为中心的"公共讲座"和以少数人共同研究、讨论为主体的"专门研修"。"公共讲座"广泛对图书馆界开放，主讲人大多为馆外各方面的专家。
对象为馆内外现职图书馆工作者。
⑺、调查业务研修
这种研修是作为本馆调查及立法考查局的局内研修实施的。以提高完成调查业务时所需的必要的基础知识和专业知识，有助于充实调查能力为目的。有讲课方式（基础性研修与综合性研修）和研究会方式。对象为调查及立法考查局职员。根据需要，其它部局职员也可参加。
⑻、支部图书馆职员司书业务研修
为提高行政司法支部图书馆职员的素质而实施的。
⑼、外国语研修
对于在完成业务时需要运用外语的职员，为使其提高外语水平。有助于业务顺利运行、增强能力为目的而实施的。近年除了重点为英语课程外，作为在业务交流方面必需的语言，也实施了俄语、汉语、朝鲜语的研修。这些外国语的研修，大多聘请语言学校的教师在馆内进行，必要时采取派遣职员到学校研修的方式。另外，在外研究、因公临时派往国外时，根据需要也适当地实施个人的学习研修。
⑽、职员特种研修
以提高职员的专业素养为目的而实施的研修。以馆外学识丰富的人和有造诣的馆内职员的演讲会为中心。
⑾、委托派遣研修
除了在馆内进行的研修外，适当地让职员参加各省厅、大学、民间等馆外诸机构举办的各种研修，以提高职员的专门知识和技术。
⑿、接受委托研究、研修
根据国内外各单位的委托，接纳外单位的职员及学生，提供调查研究或研修的机会，以利于双方业务的发展。
为了利用研修的成果，该馆把在馆内实施的各种研修的讲课内容进行录音，供职员利用。此外，还备有关于图书馆情报学的录像带、外语磁带和教材等，为职员的自修开展外借服务。该馆从研修内容中选择特定的主题编辑发行《研修教材系列》，还有《研修资料》、《研究会教材》、《讨论系列》等。
上述的研修是在1994年经过研讨后确定的。随着业务量的增大，图书馆业务的高度情报化、国际化，对职员的素质、能力的要求发生了变化。职员研修所具有的重要性也更加受到关注。该馆的研修体系和组织也是适应变化要求而设立，在基本的框架上不断加以充实和完善。
经费编辑
国立国会图书馆的经费全部由国家支付。2000年度的预算为286.38亿日元。全部费用构成比为设施费42%、人力费35.4%、业务情报系统化经费9.4%、图书馆资料收集费5.1%、事务费及其它费用8.1%。
日该国立国会图书馆建馆初期的建筑除赤坂离宫外，均分散在各国有建筑内。现在的中央馆馆舍主要是主馆和新馆。主馆于1968年竣工。随着资料的不断增加，业务量增大，1981年开始扩建以书库为中心的新馆，1986年11月建成开馆。
主馆总建筑面积为74,911平方米。中间是边长为45米的正方形书库。书库分17层，面积32,185平方米，可收藏450万册图书，书架总长度为172公里。书库四周环设阅览室和办公室。阅览场所8,496平方米，办公室等34,230平方米。
新馆在主馆的北侧，与主馆之间有通廊相连，构成有机的整体。新馆是一座长方形的建筑。地上4层，地下8层，总面积为72,942平方米。书库全部设在地下，共8层，面积为45,861平方米。新书库可容纳750万册图书，书架的总长度为240公里。地面部分西半侧是业务办公室，东半侧是阅览室。新馆设置了4层楼高的大厅，读者在大厅内可看到所有阅览室的位置。阅览场所9,193平方米，办公室等17,888平方米。
主馆和新馆总共占地面积约2.9万平方米，建筑面积14.8万平方米，藏书能力1,200万册。中央馆的主馆和新馆设有16个阅览室对一般读者开放，共有1172个座位。包括第一阅览室(245座）、第二阅览室(187座）、第三阅览室(74座）、一般研究室(69座）、参考图书室(108座）、报纸阅览室(144座）、科学技术资料室(80座）、政府与国际机构资料室(36座）、法令议会资料室(46座）、特种资料室(20座）、地图室(23座）、宪政资料室(25座）、古籍资料室(25座）、图书馆学资料室(33座）、亚洲资料室(37座）、音像资料室(20座）。
关西馆（暂称）的建设用地为82,500平方米，总建筑面积约165,000平方米。1998年10月动工兴建，到2002年3月第1期工程完成，面积为59,500平方米，藏书600万册。全面建成后藏书能力达2,000万册。
国际儿童图书馆是对上野图书馆的馆舍进行改建后建成的，2000年5月第1期工程完成开馆，建筑面积2,254平方米，其中阅览场所631平方米，办公室等1,623平方米。2002年完成第2期工程，总面积约6,600平方米。
