春秋时期，兴办官学的第一位教育家是蜀郡太守文翁。
文翁选派青年官员，到长安拜师求学，学成归来任教师，是中国的第一批专职教师。
公元前141年。文翁在成都市区建立了中国第一所公立学校，蜀郡郡学，后人称为“文翁石室”。文翁属下各地方，相继办起乡学。
蜀郡郡学开办17年后，汉武帝刘彻下令全国兴办文翁石室式的官学。
汉代石刻画像中有文翁讲学图，五代时的后蜀孟昶，用8年时间将文翁石室教材《十三经》，刻成石头让学生摹拓。
古代有司马相如求学石室精舍，当代学者郭沫若、李一氓，都曾在此领受过文翁之惠。
公元前124年，汉武帝下令全国效仿文翁兴办学校。
汉安帝时，石室连同成都城一起遭到火灾破坏。
公元194年，由蜀守高顺予以修复；同年，发生“州夺郡学”事件，石室被辟为益州州学。
公元994年，后蜀开始在石室刊刻石经，北宋时继续补刻，直到宣和年间将十三经刻完。
明末清初，张献忠据蜀，石室再次受到破坏。
公元1661年，当局在文翁石室旧址建立府学。
康熙年间，四川按察使刘德芳在此建锦江书院。
1896年，张之洞任四川总督，从石室中学析出“尊经书院”（四川大学）。
1902年，四川总督岑春煊改之为成都师范学堂，癸卯学制施行后改为成都府中学堂。
1940年，学校更名四川省立成都石室中学。
1948年，国民政府认定学校为“全国重点中学”。
1948年，被评为全国优良示范中学。
1950年，学校更名川西石室中学。
1952年，学校再更名为成都第四中学。
1953年，四川省教育厅确定为四川省重点中学之一。
1960年，被评为全国文化教育系统先进集体。
1979年，四川省人民政府及成都市人民政府确定为对外开放学校。
1981年，再次由省教育厅确定为四川省首批办好的重点中学之一。
1983年，恢复旧名－石室中学。
1985年，石室中学所在地——汉文翁石室旧址，被成都市人民政府确定为文物保护单位。
2009年，成都石室中学教育集团成立，成都石室中学为龙头学校。
2009年6月27日，成都三十中并入石室中学并成为初中部，同年秋季开始招生。
2010年，四川省教委评估验收通过为四川省国家级示范性普通高中。
2010年8月，石室中学北湖校区竣工并投入使用。
2013年12月23日，经四川省教育厅批准为四川省一级示范高中。
2012年11月，该校教师陈南君获成都市“蜀都杯”历史教学大赛说课比赛一等奖。
2012年11月，该校教师陈文在2012年全国初中信息技术优质课展评活动中获特等奖。
2013年1月，该校教师黄东被成都市教育局评为优秀学籍管理员。
2013年4月，该校教师王新刚获成都市教师读书心得演讲比赛一等奖。
2013年4月，该校教师朱凌佼在“成都市2012信息技术教师微格教学暨教师课堂教学技能提升大赛”中获成都市一等奖。
2013年9月，该校教师杨瑶获“成都市中小学美术优质课评比活动”一等奖。
2013年10月，该校教师朱凌佼在2013年全国高中信息技术优质课展评活动中获特等奖。
2013年10月，该校教师李倩在2013年四川省初中生物优质课竞赛中获一等奖，赵广宇主任和张良老师获“优秀指导教师”奖。
2014年8月，该校教师曾贵胜被中国计算机学会授予“全国青少年信息学奥林匹克竞赛‘金牌指导教师’奖”。
2014年11月，该校教师荣彬在四川省初中青年数学教师优秀课展评活动中一等奖，并以全省第一名的身份获得代表四川省参加全国比赛的资格。
2015年1月，该校体育教师黄世龙在“第二十六届学校教育教学观摩研讨会”中获全国一等奖。
2015年5月，该校教师张丽媛获第四届全国初中语文教师教学基本功展评一等奖。
2015年8月，该校教师荣彬网班教学案例获全国创新应用信息技术提升教学能力优秀作品竞赛一等奖。
2015年9月，该校教师汪绍鑫获四川省高中生物优质课大赛一等奖。
2015年10月，该校教师杨钧文获四川省2015年高中历史优质课大赛一等奖。
2015年11月，该校教师荣彬获全国第九届初中青年数学教师优秀课展评活动一等奖。
2016年5月，该校教师秦娟、汪映雪均获全国初中语文教师基本功展评大赛一等奖。
2016年4月，石室中学（北湖校区）外语组钟浪老师受邀参加“首届全国高中英语学习进展和学业成绩考评研讨会”，在研讨会闭幕式上，钟浪老师提交的的论文获全国一等奖、提交的光盘课例获全国一等奖、优秀课例现场说课一等奖三项全国奖项。
截至2016年12月，学校先后荣获全国教育系统先进集体、全国学校艺术教育先进单位、四川省消防安全教育示范校、四川省校务公开工作先进集体、四川省职业道德建设十佳标兵单位、四川省中小学德育工作先进单位、四川省模范职工之家、四川省文明单位、四川省校风示范校、四川省艺术特色学校、四川省实验教学示范学校、四川省体育达标先进集体、四川省科技教育示范学校、四川省依法治校示范校。
