四川黑水河自然保护区地处成都平原和川西高原接壤地带，保护区总面积317.9平方公里，动植物资源丰富，其中有国家一级保护动物大熊猫、金丝猴等10种和国家二级保护动物47种，有珍稀植物珙桐、红豆杉等。据全国第三次大熊猫普查，其大熊猫分布的数量占四川省39个大熊猫分布县（市）的前十位，区内丰富的可食性竹源和适当的海拔高度、适宜的温湿度等其它自然条件，特别适合大熊猫的生长、繁育和栖息。黑水河大熊猫自然保护区，是1992年国家计委批准立项的《中国保护大熊猫及栖息地工程》拟建的14个保护区之一，随着大邑县和芦山县边界纠纷的解决，为启动建立黑水河大熊猫自然保护区奠定了基础。丰富和珍贵的物种资源，明显的区位优势和地理条件。
开发建设保护区总面积450.2平方公里。主要建设内容为：修建大熊猫救护馆、大熊猫学术研讨中心和贵宾楼，建筑面积共计12600 m²；建大熊猫保护站10处，建筑面积共计4200 m²等。总投资6430万元。
该自然保护区建成后，对全县、全市、全省、全国乃至世界都具有明显的生态效益、社会效益和经济效益。项目实施后，可使区内450.2平方公里的森林资源得到充分保护，使大熊猫栖息地免遭破坏，生存环境得到改善，促进大熊猫种群间的交流、繁衍，并能保护其它珍贵的动植物资源，有利于对大熊猫的食性、生活习性、栖息地等进行科学考察研究，有利于生物多样性和生态环境良性循环。通过自然保护区的建设，将大大改善生态环境，促进森林覆盖率的逐年上升，对长江上游地区水土保持和涵养水源起到积极的作用。预计项目建成后，年减少水土流失量24.62万吨，年增加水源涵养量651.94万吨。通过保护区的建设，还可创造木材贮备经济效益5760万元，野生动植物资源经济效益3500万元。
