每年从农历正月起到3月23日妈祖诞辰这段期间，全省各地的善男信女纷纷涌入，只见整日香火缭绕、锣鼓喧天，热闹不绝。
北港朝天宫旧称天妃庙或天后宫，为了纪念分灵自湄洲祖庙──朝天阁，才改名为朝天宫。清康熙年间，临济宗禅师树壁奉湄洲祖庙妈祖神像来台，登陆笨港北岸，经街民议留以供膜拜，遂于康熙39年（1700年）于现址建庙奉祀，因神迹灵验，已成为台湾妈祖信仰的龙头大庙！
北港朝天宫建于康熙33年（1694），由树壁和尚从湄洲朝天阁，恭请妈祖来台，于笨港建立一座小祠供民众祀奉。康熙39年（1700）由地方的士绅捐资兴建祠庙，称为“天妃庙”，雍正8年（1730）重修后，称为“笨港天后宫”。
乾隆40年（1775）“重修诸罗县笨港天后宫”碑记提及：“……天后宫建自雍正庚戌年，岁修于乾隆辛未年……”。另外，《云林采访册》记载：“天后宫，在街中，雍正庚戌年建……”。雍正庚戌年，即雍正8年，说明了康熙年间，笨港的妈祖庙仍为一小祠，至雍正8年兴建，始具规模，乾隆16年（1751）曾再次重修。
乾隆39年（1774）由笨港县丞薛肇熿捐俸倡议重修，贡生陈瑞玉、监生蔡大成等募得一万伍仟余圆，自乾隆39年重修，乾隆40年（1775）完工，当时朝天宫的建筑有正殿及观音殿二进。道光17年（1837）福建水师提督王得禄与台湾水师游击温兆凤率军渡台，船只遇风灾，王得禄祈祷妈祖庇佑。之后因顺利抵台并平定张丙事件，乃敬献“海天灵贶”匾及古钟予朝天宫。
咸丰2年（1852）由王得禄次子王朝纶、嘉义县训导蔡如璋发起重修，于咸丰5年（1855）农历10月兴工。此次重修并扩建拜亭与东西两厢廊，成为四进三院的建筑格局，至咸丰9年（1859）完成庙宇的重修。
光绪20年（1894）北港街发生火灾，并波及朝天宫三川殿。明治39年（1906）嘉义地震，朝天宫庙宇受损，幸经北港区长蔡然标、地方士绅曾席珍、蔡培东等人倡议重修，自明治41年（1908）8月26日兴工。此次的重修，聘请陈应彬匠师主持大木工程，全部重建经费计七万九千余元，至大正元年（1912）1月完工。
日据时期，北港地区郊商组织仍蓬勃发达，并积极参与朝天宫的管理与重修，当时郊商组织妈祖会，分别有祖妈会——金顺盛、二妈会——金顺安、三妈——金盛丰、布郊、敢郊——金兴顺、鱼铺街——金海顺、屠户——金义顺等。明治年间朝天宫重修时，妈祖会及郊商皆纷纷捐资参与修护。
民国48年妈祖诞辰一千周年，信士发起重修正殿，民国52年完成正殿的重修，但仍不失其传统的空间配置。民国61年11月朝天宫经省政府核定为“台湾省宗教纪念观光区”。
民国65年朝天宫斥资兴建北港妈祖纪念医院，发扬妈祖慈悲济世的懿旨，嘉惠嘉南平原民众，补足地方医疗缺陋的情形。民国72年11月27日指定朝天宫为国家第二级古迹，民国76年妈祖成道千年，由北港朝天宫举办妈祖环岛弘法绕境活动，历时26天。
民国84年12月20日圣父母殿遭到火灾，日治时台湾总督佐久间左马太所献“享于克诚”匾亦遭焚毁。民国87年元月15日圣父母殿重建落成，并举办安座大典。同年朝天宫与湄洲天后宫互赠5丈高妈祖石雕像，雕像于北港妈祖文化大楼屋顶花园展示。
民国88年九二一地震，北港朝天宫庙宇受损，民国93年进行全面重修，并采悬吊屋脊的工法施做屋顶，期许能保存朝天宫的建筑艺术。
民国89年（2000年），陈水扁总统莅临「朝天宫」参访第一届全民运动会在「朝天宫」庙埕举行引燃圣火仪式；
民国90年（2001年），陈水扁总统莅临「朝天宫」主持「北港迎妈祖」遶境出巡开锣仪式「北港妈」首度前往天津进行妈祖文化之旅，并前往泉州、湄洲等地参访北港妈祖南投县息灾祈安植福出巡遶境；
民国90.6.28（2001.6.28），筹建委员会建庙供奉；
民国90.7.28（2001.7.28），大陆天津市天后宫主委蔡长奎等一行3人抵达本宫参访10天；
民国90.8.15（2001.8.15），澳门中华妈祖基金会颜延龄一行6人抵达本宫参访；
民国90.8.20（2001.8.20），大陆湄洲祖庙由前董事长林聪治女士率领一行10人抵达本宫参访；
民国90.10.5（2001.10.5），南非开普敦市朝天宫总干事张炳耀等一行7人抵达本宫参访，并再办理分灵乙尊圣母及千里眼、顺风耳回南非供奉；
民国90.10.27（2001.10.27），今起本宫圣母应南投县政府及各界邀请前往南投县境13乡镇市，举行息灾祈安植福出巡遶境活动10天；
民国90.11.10（2001.11.10），副总统吕秀莲女士於下午抵达本宫参拜；
民国90.11.20（2001.11.20），今起本宫举办护国息灾顶礼梁皇大法会七天；
民国90.12.29（2001.12.29），本宫举行第七届董监事选举，选举人计6029人，出席投票4537人，投票率75.2计选出董事19名，监事3名。
北港朝天宫于农历过年前，有一连串的祭祀活动，为迎接新年及妈祖诞辰的庆典，每年农历12月20日由庙方清洗殿宇，将一年来的尘埃给清除干净，有除旧布新的意义。农历12月24日由庙方执事者举行送神仪式，以素果祭祀神祇，恭送庙内列位诸神，并象征性的关闭庙门至祭祀典礼结束。
除夕当日晚上9点30分，朝天宫再度关闭庙门，准备正月初一子时“抢头香”的活动。当庙门开启时，信徒蜂拥而入，希望能抢得头香，为来年带来好运。在节庆习俗中，农历正月初四为“接神日”，朝天宫再度关闭庙门，以迎接众神祇的降临。
接神仪式完成后，再开启庙门，当日并由庙方主事者抽出公签（又称“四季签”）以预测未来一年中各行各业的流年运势。公签抽出后，张贴于三川殿内公告周知。
朝天宫于元宵节时，举办妈祖“迎春绕境”活动，商家为表示对妈祖信仰的虔诚，并期望妈祖能保佑生意兴隆，在妈祖绕境时，会准备大量的炮竹置于妈祖的凤辇神轿下，称为“炸轿”，炮竹愈多，表示来年生意会愈好，也为绕境活动带来高潮。
“三月逍妈祖”是北港朝天宫的年度盛会。每年农历三月十九这天，北港家家户户都会办桌请远方来的亲友共同享用美食；在庙口的绕境队伍出发后，北港街头鞭炮声四起，信徒即知道妈祖绕境队伍出巡了，沿路每户都会准备香案，水果和金炉恭迎圣驾，这在别处是少见的。北港朝天宫迎妈祖的信俗2008年7月11日被指定为“台湾文化资产”之民俗类，并与台东炸寒单、盐水蜂炮并称“台湾三大炮”。
朝天宫的三宝是经由研究妈祖文化的学者认定而来，分别是宝玺、钵和昭应录。
宝玺：最初随妈祖神像渡海而来，全台湾仅有北港朝天宫妈祖有宝玺。
钵：树璧和尚的钵上刻有《般若波罗蜜多心经》，是佛家临济宗传下。
昭应录：记载妈祖升天后救世感应事迹。
