海口市琼山中学创办于1913年4月15日，系由民国初年的琼山县县立第一高等小学发展而成，源于宋明年间的琼崖“雁峰书院”。明代名臣丘濬和海瑞二公曾求学于雁峰书院。雁峰原位于府城南门，原地称“琼庠”，对面有个三元峰，因常有雁群聚栖，当时在此读书的丘濬便作《雁聚琼庠记》。后人取名“雁峰书院”。清朝末年，由于时代思潮的冲击，科举制度被废除，各地书院相继改为学校，雁峰书院当时也改为雁峰两等小学（即高等和初等小学）。不久又改为高等小学，这就是海口市琼山中学的前身。
1911年，雁峰高等小学在校长曾对颜先生的领导下发展迅速，规模不断扩大，学校声誉日高。1913年，雁峰高等小学遂奉命改为琼山县县立第一高等小学，由当时的琼山县开明绅士张瑞銮任校长。张校长到任不久，就在第一高等小学的基础上着手创办了琼山县立中学（附设小学部）。张瑞銮升任中学校长，并确定4月15日为学校创办日。
中学创办初期，因校舍紧缺，为解决这一困难，1914年经当时琼山县县长蒋宗堪裁决，将中学部和小学部分开，中学部暂借府城古楼附近的苏泉书院为校址。1917年，为适应全县小学迅速发展的需要，社会上热心教育的人士便将小学部扩大为县立师范学校（附设小学部），在清代中军游击府遗址建校舍（我校现校址的东侧）。1922年，琼山县立中学也因苏泉书院校址窄小，难展宏图，后经县教育会呈报省政府批准，于当年11月11日迁址入琼州府旧府署（现校址）。1926年2月，县教育会长李春荣呈报经省教育厅批准，将琼山县立中学和琼山师范两校合并。1931年师范班和小学班停止招生，琼山县立中学便成为单纯的普通中学。在师生员工的鼎力奋斗下，学校生机勃发，规模不断扩大。日军侵华期间，府城屡遭日机轰炸骚扰。为师生安全计，琼山县立中学曾迁至琼山县龙塘墟。1939年海南沦陷，学校被迫停课。学校虽然停课，但琼中的学子们为了追求知识和真理，仍几个人、十几人乃至几十人自动聚在一起，分散在各地继续学习，其精神令人钦佩。1945年抗战胜利后，琼山县县长陈哲委任陈继福为校长，组织琼山县立中学在琼山县甲子墟招生复学。当年11月学校从甲子墟迁至海口市西门外竹林村的原日伪琼崖女子一中校址。1946年上半年又从海口迁回府城原址。至1950年春，学校的发展已具相当规模，初中部有76个班，高中部有10个班。
1950年5月海南解放，琼山县人民政府派员接管琼山县立中学。在党和人民政府的重视下，琼山县立中学于1951年5月改名为琼山中学。当时，琼山县书记兼县长王月波极为关心并大力支持琼山中学办学，学校诸多困难得到解决，师资队伍不断充实，校舍每学期都有所扩建，学校图书馆藏书一下子增至5000多册，各类教学仪器也有400多件，教学质量显著提高。1951年，海南文教处举办征文、美术、演讲和足、排、篮球等比赛，琼山中学学生均名列前茅。
1952年5月，琼山中学随琼山县人民政府一起迁往云龙岭脚。但由于那里岭高地僻，交通不便，各方面条件都较差，1955年5月，学校又迁回府城原址。此后，学校获得了一段稳定发展时期，办学质量有明显提高。1958年12月，琼山县和海口市实行市县合并，学校改名为海口市第三中学。1959年10月，琼山复县，学校又复名琼山中学。1959至1965年，琼山中学稳步发展，办学规模、教育教学质量均为海南各中学首位。
1966年下半年，全国发起“文化大革命”，学校发展遭受挫折。跟全国各地一样，学校“停课闹革命”。各类教育活动停滞，“读书无用论”泛滥，教育教学水平严重倒退。1976年秋，粉碎“四人帮”，拨乱反正，学校重获生机。学校正常的教学秩序得到了恢复。1978年，学校被定为琼山县重点完全中学。1978年开始，学校以“教学工作为中心”，把提高教学质量提到重要位置上。通过拨乱、整顿，学校逐渐走上正确轨道，并取得显著成绩。
改革开放特别是海南建省办经济特区后，琼山中学快速发展。尤其是进入九十年代，学校的办学得到上级政府的重视，琼山市人民政府拨款支持琼山中学办学。校友杨兹楠、黄奕金，旅港乡亲黄有雄先生，台胞吴乾华先生，社会企业家冼笃信、符昌海、郑先平、许振发等慷慨解囊，捐资支持学校建设。学校建设日新月异，科学馆、艺术馆、乾华楼、教学楼、师生宿舍楼、食堂楼等建筑拔地而起。学校占地面积78亩，校舍建筑面积45000多平方米，有57个教学班，初、高中学生近4000人，教职工296人（教师217人，职工79人），其中特级教师4人，具有中高级职称的教师占教师总数的70%。学校教学设施和设备不断更新完善，实现了广播电视联网。校园基本实现了绿化、美化、净化、园林化。学校的教育教学质量不断提高，中考成绩居全市前茅，高考成绩居全省前列。1989年，高中123班的肖灿同学在全国高考中荣获海南省文科状元。
2001年后，海口市琼山中学有了更大的发展。学校以培养21世纪人才，坚持“严教、勤学、求实、创新”的八字办学方针，以“教人、育人、树人” 为办学指导思想，按“智德并举、培养技能、因材施教、确保合格、发展特长”的教育目标施教，全面提高教育教学质量，中考、高考成绩稳步上升，很多学生考上清华、北大等名牌大学，高考成绩名居全省前列。学校整体办学成绩突出，2002年学校被海南省人民政府评定为海南省普通高级中学一级学校。2003年海口区划调整后，琼山中学更名为海口市琼山中学，并被定为海口市直属重点中学。从此，海口市琼山中学踏上科学发展的快车道，学校发展日新月异。2006年在省一级学校复检评估中，学校被评定为海南省普通高级中学一级（甲等）学校。
进入素质教育和课程改革的新时期，海口市琼山中学迎来了新一轮的发展高峰。两全面（全面贯彻党的教育方针、全面实施素质教育）和四学会（学会做人、学会学习、学会生活、学会健体）的办学指导思想，“育人为本，培养真人、能人、超前人”的办学理念，造就了学校“全面 特长”的办学特色。学校高举素质教育大旗，致力于学生全面发展；创新德育工作体系，致力于健全学生人格；重视学生个性特长，致力于学生和谐发展；培养学生双自意识，致力于学生终身发展。学校教育教学质量一直稳居海南省各重点中学前列，被誉为海南名校之一。学校德育、艺体、创新教育特色鲜明，男、女排的品牌，文艺之花的赞誉，“中国名校”的美名，享誉海南、全国及全世界中学体坛。
教育作为海南海口市的一项强势品牌，海口市琼山中学是海南省和海口市教育的窗口。为满足社会对优质教育资源的需求，2010年至2011年，海口市委、市政府作出海口市琼山中学提质增容、异地新建的决策，按省级重点示范高中标准，在南渡江畔建起了占地面积180亩的新校区。学校现已发展为一所占地258亩（含老校区和新校区），总建筑面积约12万平方米，规划合理，设施先进，功能齐全，环境优雅的现代化高级中学。目前学校有高中教学班69个，在校学生3956人；教职工378人，其中专任教师328名；特级教师7人，高级教师89人，中级教师122人，省级骨干教师22人，市级骨干教师50人，省级学科带头人6人，省级教学能手5人，市级教学能手13人。学校沐浴着党和政府的阳光雨露，规模不断扩大，办学质量不断提高，取得了长足发展。
如今的海口市琼山中学与时俱进，在创新中发展，校园桃红李艳、生机勃勃，师资力量雄厚，教育教学管理科学，教育理念先进，教风学风淳正，现已成为享誉海内外的优秀人才培养基地。进入21世纪后，学校多次荣获海口市“高考成绩突出奖”，名居省、市重点中学前列。各类学科竞赛也屡获大奖。学校的素质教育开展得有声有色，艺体特色项目在海南乃至全国享有盛誉。学校排球威震中国、世界中学排坛，男排曾三夺全国冠军，一次亚洲冠军；女排也曾三次勇夺全国中学生沙滩排球锦标竞赛第一、一次世界季军。学校文艺队在国家、省级、市级的各类比赛中多次荣获一等奖。美术特长生参加全国青少年书画展多次荣获金奖。丰硕的办学成果产生了广泛的社会影响。自2001年以来，学校先后接待了来自北京、上海、重庆、山东、福建、广东等10多个省市的30多个教育考察团，还接待了新加坡国家XX中学师生的访问和考察。2008年承办了全国中学生排球锦标赛和海南省中学生排球锦标赛。2010年，学校承办了海南省排球传统项目学校锦标赛。多年来，学校先后获得了全国群众体育工作先进集体、全国精神文明建设工作先进单位、全国优秀（示范）家长学校、全国“五·四”红旗团委创建单位、北京2008奥林匹克教育示范学校、国家级体育传统项目学校、海南省文明单位、海南省人才建设成果显著单位、海南省现代教育技术实验学校、海南省中小学校容校貌评比一等奖、海南省体艺工作先进学校、海南省“校本培训示范学校”、海南省关心下一代工作先进单位、海南省德育工作先进单位等30多项省级以上荣誉称号。
办学百年来，学校培养的初、高中毕业生已有5万多人。他们中，有的已成为政绩卓著的党政领导，有的是行业战线上的精英。例如，被周恩来总理赞誉为“琼崖人民的一面旗帜”的冯白驹将军，海南大学第一任校长、生态学专家林英，广东民族学院原院长蔡仲淑教授，华南师范大学原副校长王开发教授，中国人民解放军总参谋部作战部原部长符传荣将军，世界女子举重冠军邢芬，世界“选美皇后”吴英娜……校友分布全国各地和世界许多国家和地区。大多数校友是我国革命和建设的骨干力量。
解放前，许多校友投身革命救国，为国家的独立、民族的解放作出英勇无私的牺牲和贡献。据现有材料统计，至少有几百名校友参加了共产党领导的革命队伍，其中在校时参加共产党的有10多人。在革命和建设中，有10多人成为革命烈士。学校参加革命队伍、在校入党及成为革命烈士人数之多，均居海南各校之首。
校友中文化科学人才如林，科技界、教育界、文艺界、医学界、新闻界、法学界、史学界工农商学兵各条战线上都有一批杰出的人物。其中被评为教授、研究员等正高级职称的约300人，在大学里担任过主任或研究所主要负责人的不下50人。
年青的校友人才辈出，其成就更是喜人。许多人成为各条战线上的精英和新秀，不少人在新兴学科前沿取得令人瞩目的成就。据已收到的校友登记卡统计，八十年代后毕业的校友中，具有高级职称以上的有500多人，在党政部门具有科级职务以上的有上千人，还有不少军事人才、商贾精英，为国家的经济发展和世界和平事业作出了较大的贡献。真可说群星璀璨，英才辈出。
多年来，海口市琼山中学乘着改革的东风，锐意创新，勇立潮头，扎实推进示范性普通高中的创建工作，各方面都取得了明显突破，实现了超常规的发展，取得了令人瞩目的成就。今天的海口市琼山中学正承载着厚重的历史文化底蕴，以其先进的办学理念，鲜明的办学特色，雄厚的师资队伍，精良的品牌教学，合理的办学格局，优美的校园环境，广阔的升学前景，骄人的办学业绩，推动着海南教育又好又快地发展。
“欲穷千里目，更上一层楼。”目前，海口市琼山中学正以更加饱满的热情抓住良好的机遇，从新时代的新高度规划学校发展的新蓝图，敢为人先，充满信心，朝着“国内知名，全省示范”的现代化学校的办学目标，脚踏实地向前迈进。
