南京市第十三中学坐落于六朝文化古都之中心地带，位于玄武湖畔、鼓楼东侧、北极阁麓、台城脚下，毗邻南京市政府、东南大学、鸡鸣古寺等。作为南京市十佳景观校园，环境优美，校园典雅，绿树成荫，四季飘香，办学设施一流，教学设备先进、功能配套齐全，蕴含着深厚的文化积存，洋溢着浓郁的人文气息。
学校建于1955年，是南京解放后党和人民政府创办的一所完全中学。1959年被确定为南京市六所重点中学之一，1960年江苏省委定为省重点学校，1996年被江苏省教委再次确认为省级重点中学，2000年被江苏省教育厅确定为国家级示范性高中，2004年被江苏省教育厅转评为江苏省四星级学校。
学校始终秉承“以学生为中心，提升师生的生命质量”的办学理念，将“得天下英才而育之”作为自己的使命和责任，不断传承和弘扬优良文化传统，崇尚科学与人文精神，高质量立校，宽视野办学，形成了以校训“志远行近”和校风“务实求高”为核心的十三中精神。
十三中始终秉持“以学生为中心，提升师生生命质量”的办学理念，坚守“成人与成才齐头并进，素质与分数相得益彰，今天和明天不偏不废”的办学主张，高起点立校、高品位办学、高品质行动，逐渐发展为一所特色鲜明、成绩卓著的国家级示范性高中，在学校课程、队伍建设、质量推进、教育科研、特色建设等方面居于全省、全市领先位置，有效地形成了现代化、研究型、个性化、人文型的办学特色。学校被评为全国青少年思想政治工作先进集体、全国贯彻体卫工作条例优秀学校、中国体育优秀实验学校、全国体育传统学校先进集体、江苏省文明单位、江苏省文明校园、江苏省德育先进学校、江苏省现代化示范学校、江苏省绿色学校、南京市教育发展先进单位等，成为南京市首批高中校长培训基地学校、南京市首批教师培训基地。
学校辉煌的办学业绩，源于一支结构合理、实力雄厚、群星璀璨的师资队伍的强有力支撑。学校教师素以“勇于担当，勤于超越，乐于奉献”的工作精神和业绩享誉市内外，其特有的进取意识、敬业品格、踏实作风诠释了优秀教师团队的师德师能。目前学校高中部教职员工182人，其中在职特级教师7人，教授级高级教师5人，高级教师82人；全国优秀教师1人，省市优秀教育工作者、劳动模范、“陶行知奖”获得者、“斯霞式人民教师”15人，市学科带头人13人，市优秀青年教师21人，市学科中心组成员24人；区学科带头人、区优秀青年教师37人；具有硕士学位105人，博士1人，出国研修93人；省市级以上教学大赛一等奖20余人，南京市名师工作室4个，学校成为全国教育硕士专业学位研究生联合培养示范基地。学校现有普通高中42个班、国际高中9个班，聘用专职外籍教师20人担任外教工作。教师们牢固树立“问题即课题”、“教学即研究”的思想，坚持“两把工程”（把我们的行动拿出来研究，把研究的成果付诸于行动），形成了独特的教学风格，成为兼具学科教学理论与实践的行家里手；教师们以“爱满天下”的人民教育家陶行知先生和胸怀“童心母爱”的斯霞老师为楷模，敢于担当，爱生如子，勤恳耕耘，卓越奉献，奠定了十三中光辉业绩的基础。
学校文化的核心价值观呈现了“内图个性之发展，外图贡献于其群”的特征，为此学校把学生的健康成长与进步奉为办学的价值取向，在教育教学管理、课程实施上谋求学生的自主、主动、和谐的发展，形成了独有的教育特色和优势。学校的管理特色，在于坚持目标引领，倡导勤奋求实，教会自主学习。目标引领，在于引导学生仰望理想的天空，心中有追求；勤奋求实，在于引导学生踏实走好人生的每一步；自主学习，在于引导学生追求“学会”到“会学”，增添发展的后劲；优良习惯，在于引导学生有意志、有方法。管理重在强调严格要求与积极服务相结合，让学校管理更加高效；传授知识与激发潜能相结合，让教师育人更加科学；当下功利与长远利益相结合，让学生成长更加自主。全面引导激励学生勇于担当和发展领导力，具备“精英意识，平民情怀”，牢固树立优秀意识，培育优秀品质，形成优秀行为。
学校的教学特色，在于以培养基础宽厚、全面发展的学生为基本目标，有效融合国内外先进经验，积极探索优秀人才的培养规律和模式，全方位进行学校课程综合改革，坚持精致管理和有效教学，全面推进多样化、特色化学校建设。教师研究“错题纠得准”、“作业做的准”和“学习学的准”，通过Pad技术支撑教学和“智学网大数据”实现学生的个性化学习，推进学生的个性化成长。学校通过“人人开设公开课”、“师徒结对帮学课”、“同课异构研究课”、“行知杯大奖赛”等深度教学研讨活动，以“百尺竿头、更进一步”的担当，保持教育教学质量的高位持续增长。学校相继获得南京市、江苏省首届基础教育教学成果特等奖（2013年）、国家基础教育教学成果二等奖（2014年）、江苏省基础教育教学成果一等奖（2013、2017年）。
遵循青少年心理与生理成长规律，借鉴成为一棵大树需要“时间、根基、呼吸、坚持、向上长、向阳光”等六个条件，建设“大树理论”，形成“大树课程”体系，拓展学生生涯规划路径，全面实施立德树人文化战略，让课程惠泽每一位学生的幸福成长，学校成为在宁所有高校的优质生源基地。树木依乎天性，树人尊重个性。十三中勇于探索、持续改革，坚持国家课程校本化、学校课程课堂化、实践活动课程化。经典研读、特长写作、学科方法、思维导图、戏剧影视、演讲辩论、微电影创作、篮球公园等49门精品校本课程，打破班级和年级建制，由学生根据兴趣特长和发展需求自主选择，为学生全面发展和个性成长奠定了厚重的基础。中秋月圆，揭开“青春·明月·梦想”大型月光诗会的帷幕；梧桐阴浓，“大树下的古风新唱”开场；石榴花红，戏剧节演绎着年轻生命对生命的触摸和对未来的希冀……文学社、广播社、模联社、匠神社、辩论社、音乐社等50多个学生社团，戏剧节、歌舞节、科技节、体育节、艺术节、社团风尚节等“校园十大节”主题活动，丰富了学校课程的呈现形态，让同学们在书香校园的品质活动中增长知识，提高能力，培育核心素养。学校以“广博的大爱关心和培育每一位学生健康成长”的教育精神，为社会各行各业培育了大批优秀人才，让学校声誉广传。学校重视优化学生的人文素养与综合素质，促进学生个性与学习力的和谐发展，“有效教学”得到全面落实，教育质量稳步提高，十三中学子所表现出来的“素质全面、个性突出、人文见长”的精神面貌特别明显。近十年以来，高考以高推进率、高层次发展稳居市第一方阵，连年获得南京市“办学绩效发展性评估综合奖、教学质量优秀奖、高中综合管理奖”等，2017年同时获得“突出贡献奖”；学科竞赛以每年三百多人次在省级以上奥林匹克学科竞赛、英语大赛、机器人大赛、作文大赛、社团活动、“模联”等大赛中获奖；尤其是涌现出吴婧《伤心儿女》、蒋昕捷《赤兔之死》、林子青《蜕》、姜寥晨《园林·人生》等多篇高考满分作文，全国少年作家、南京市十大杰出青年刘冬阳，张抒、曹文君等少年作家群体，大唐文学社成为中华少年写作园等，校园洋溢着浓浓的书卷气息，“在大树下读书”成为南京市标杆性读书活动。
全国基础教育课程改革经验交流会、全国首届语文课程基地暨校本选修课程建设高峰论坛、全国新学校研究中心实验工作会议、第二届全国中学写作教学论坛、一年一度的全国名师成长报告会、全国经典文化论坛等相继在十三中召开，学校课程改革成果受到与会专家的高度评价。在江苏省首届基础教育教学成果奖评比中，学校是获得特等奖的29个学校之一；在江苏省基础教育课程基地建设中，学校成为首批31个省级课程基地实验学校之一（2011年，语文），2016年获批省级前瞻性项目，2017年又成功申报第二个省级课程基地（体育）；作为江苏省普通中学田径主席学校，学校田径队多次代表江苏省出战全国中学生运动会，获田径金牌榜与总分全国第一名；作为江苏省普通中学体育舞蹈主席学校，11次蝉联江苏省体育舞蹈锦标赛高中团体总分第一名……教育部基础教育司司长朱慕菊同志在学校考察时给予了“想在深处，站在高处，做在细处，落在实处”的高度评价。
站在建设省一流品牌高中的高度，十三中以国内领先、国外可比、国际理解和融通为目标导向，在大力开展基础教育改革的同时，还与国内外学校长期合作，开办国际课程。2004年，学校与加拿大多伦多国际学院联合创立“南京中加邦德国际学校”，实施国际课程，颁发中外“双文凭”， 质量得到社会一致公认，位列南京市国际办学前列。2017年，十三中又与江苏广电合作创办“MCAP中美班”，课程由美国麻省五月花学院高中课程研发中心提供，在立足“国际视野、本土情怀”的国际办学实践中形成了优质品牌的育人路径。学校已与美国、加拿大、瑞典、英国、澳大利亚、日本、新加坡、韩国等国的名校建立了联谊关系，每年有150多名学生出国修学，开阔了视野，拓展了新的学习空间。
搏击长空振翅飞，勇立潮头写风流。腾飞中的南京十三中，以“创优质发展之举，领改革创新之先，示素质教育之范，圆师生成长之梦”为共同目标，正怀揣“精心打造南京市教育卓越发展集团学校”的愿景，以高中部为龙头，带动国际高中、玄武高级中学、科利华中学、十三中红山校区、十三中锁金分校、紫东实验学校，努力实践着“资源共享、彰显特色、携手前进、共同发展”的集团办学方针，在适应社会转型、教育自觉转轨、学校主动转变的道路上，以“海的心胸，山的信念”，再创学校发展新优势，打造学生向往、家长满意、教师幸福、社会认可的全国一流品牌名校。
