筑波大学和其他日本大学不同，筑波大的教育体系分为“学群”和“学类”，对学生的课外实践、校园生活和住宿环境提供全面支持。自2004年4月1日起，日本的国立大学开始转向国立大学法人化制度。法人化使大学独立自主的灵活运营成为可能，同时对自我管理和成绩的评估审查也变得更加严格。该校所倡导的“教育和研究的新体系”、“新大学自治”、“开放的大学”等办学理念，已经越来越多地令公众瞩目，并起到了大学改革的先导作用。筑波大学根据学术研究发展和社会需要设立，是跨学系的大型综合、学科交叉的组织，不仅吸收校内有关学系的教员，还向国内外招收客员教授。特别课题组不是固定不变的组织机构，在一定时期（一般为5年）内当任务完成后即行解散，再根据新的研究课题而重新组织新的特别课题组。
截至2013年4月，筑波大学有教职工4718人，其中教授642人，副教授557人，博士139人。
截至2015年2月，筑波大学有国际联合共用设施4个、校内共用教育研究设施（科学研究类）18个、世界先端研究开发支援组织2个。
国际联合共用设施：
计算科学研究中心、下田临海实验中心、遗传基因实验中心、等离子体研究中心。
世界先端研究开发支援组织：
生物体机器人研究中心、分子行动科学研究中心。
校内共用教育研究设施（科学研究类）：
生命领域跨学科研究中心、农林技术中心、生命科学动物资源中心（旧：动物实验中心）、菅平高原实验中心、大学研究中心、质子线医学应用研究中心、产学结合共同研究中心等。
该校的校徽“五三桐叶型”的使用始于1903年改定的东京高等师范学校的学生徽章。1949年该徽章又作为东京教育大学的学生章得以沿用。1974年在该校的评议会上决定继承东京教育大学的传统，将桐之叶定为该校校徽。含义：“五三之桐”是日本传统的纹饰，与日本一般传统的徽章一样，有多种版本；该校的校徽突出勾画花的轮廓，造型独特。
松本孝次郎、白川英树、江崎玲于奈、岩崎洋一、小川泰、梁成吉、秋野豊、加藤泽男、今井凌雪等。
松村荣子、松本侑子、垣根凉介、斎藤环、小西圣子、西冈力、三井石根、赤池学、大冢英志、村中李衣等。
山田秀雄、新保丰、久世和资、桐村晋次、渡辺和博、伊藤伸。
足立信也、福嶋浩彦、五十岚立青。
井原正巳、中山雅史、长谷川健太、平山相太、藤田俊哉、鹤见智美、石川竜也、戸田光洋、三浦文丈、望月重良等。
1962年9日，东京教育大学，决定开展5个学部的搬迁选址调查。
1963年9日，内阁批准在筑波地区建造研究学园都市。
1967年9日，内阁批准东京教育大学等36所机关作为筑波地区的迁移预定机构。
1969年11日，在文部省设立筑波新大学创设预备调查委员会。
1970年5日，筑波研究学园都市建设法颁布。
1971年6日，东京教育大学决定“有关筑波新大学的基本计划方案”。
1971年7日，筑波新大学创设预备调查委员会向文部大臣进行汇报“筑波新大学构想”。
1971年10日，在文部省设立筑波新大学创设预备委员会。
1972年5日，内阁决定了筑波新大学（暂定名）等42所机构作为迁往筑波研究学园都市的研究教育机构。
1973年10日，根据部分改订的国立学校设置法等设立筑波大学；办学之初，设有第一学群，医学专门学群，体育专门学群及附属图书馆。
1975年4日，设立第二学群，艺术专门学群，研究生院修士课程及研究生院博士课程。
1976年8日，宫岛龙兴出任校长。
1976年10日，附属医院运营。
1977年4日，设立第三学群。
1978年3日，东京教育大学停办。
1978年10日，设立医疗技术短期大学部。
1987年4日，研究生院修士课程设立夜间课程。
1996年4日，研究生院博士课程设立夜间课程。
2000年4日，对研究生院博士课程进行改组和再编，设置数理物质科学研究科，信息系统工学研究科及生命环境科学研究科。
2001年4日，对研究生院博士课程进行改组和再编，设置人文社会科学研究科，工商科学研究科及人类综合科学研究科。
2004年4日，国立大学法人筑波大学成立。
2009年4日，山田信博出任校长，对人类综合科学研究科进行部分改组和再编。
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