2009年11月24日，吉林省政府正式批准成立集安省级自然保护区。
2014年12月23日，国务院办公厅印发《关于公布内蒙古毕拉河等21处新建国家级自然保护区名单的通知》，批准新建国家级自然保护区21处。升级为吉林集安国家级自然保护区。
吉林集安国家级自然保护区位于集安市西北部，距市区19公里处，地理坐标为东经126°2'21″-126°17'57″，北纬41°11'37″-41°21'40″。
吉林集安国家级自然保护区地处集安市西北部，长白山系老岭山脉。
集安市整体属北温带大陆性气候，岭南具有明显的半大陆海洋性季风气候。四季分明，春风早度，秋霜晚至。每年3月上中旬起，气候明显转暖，始为春季，为60天左右；从5月下旬起，雨量明显增加，转入夏季；7月中旬～8月上旬，气温高，降雨量多，时为盛夏，整个夏季为120天左右；9月气温转凉，雨量相应减少，时为初秋；9～10月，温和晴朗，秋高气爽，为60天左右；11月，北风频繁，先偶有雨雪天气，后常见雪花纷飞，至次年的2月，是漫长的冰封雪飘的严冬季节，为120天左右。
境内由于老岭山脉自东北向西南形成一道巨大的天然屏障，横贯全市，抵御北来寒风，使温暖湿润的海洋气流，沿鸭绿江溯源而来，造就了集安市岭南、岭北两个小气候区。岭南、岭北冷暖转换时差10～15天。岭南气候温和、空气湿润、降雨充沛、风力弱小的特点极为突出，素有"吉林小江南"之美誉。
境内云峰发电厂长年放水发电，青石到麻线之间的鸭绿江面冬季不结冰，使这一带冬季形成多雾天气，每年12月至次年1月份平均雾天为52天，占这2个月总天数83.9%，沿江常有雾淞出现。
保护区东西大长度为22公里，南北大宽度为16.2公里。根据保护区性质及重点保护对象的分布格局、区划的依据和原则，将该自然保护区划分为核心区、缓冲区、实验区。其中，核心区面积为4903.7hm2，占保护区总面积的35.5%；缓冲区面积3671.0hm2，占保护区总面积的26.5%；实验区面积为5246.9hm2，占保护区总面积的38.0%。
集安自然保护区是以保护珍稀濒危野生植物资源及其自然生态环境为主要目的，重点保护对象为典型的自然地理区域及独特的森林生态系统、珍稀濒危野生植物、珍稀濒危野生动物及其栖息地。
保护区内有10种国家重点保护野生植物，其中国家一级保护野生植物1种，国家二级保护野生植物有9种
有33种国家重点保护野生动物，其中国家一级保护野生动物有5种，国家二级保护野生动物有28种。
保护区管理局已建文字岭、安碌石、新红保护站及办公辅助用房360M2，临时检查站点3个，防火了望塔一座，一支25人组成的专业扑火队，保护区宣传警示碑两座，已完成保护区内部分界碑和界桩的安置工作。制定了《吉林集安省级自然保护区管理条例》，建立健全了保护区管理局的规章制度和工作职责，制定了保护管理站巡护档案及巡查内容，规范保护管理行为，提高了自然保护区质量和管理水平。
