2002年4月，被批准为省级自然保护区；
2008年1月，批准为国家级自然保护区，同年成立了黑龙江珍宝岛湿地国家级自然保护区管理局；
2011年10月，列入国际重要湿地名录。
黑龙江珍宝岛湿地国家级自然保护区，位于虎林市境内东部，乌苏里江左岸，完达山南麓，以乌苏里江为界与俄罗斯联邦隔水相望，是三江平原沼泽湿地集中分布地区。
范围在北纬45°52′00″-46°17′23″、东经133°28′44″-133°47′40″之间。行政区划分别隶属于虎头镇和珍宝岛乡。
保护区内虎头隆起是黑龙江省早的陆核，是八面通隆起呗敦化——密山断裂切错东移部分。麻山群构成其主体，其时代为距今25亿年前。其后长期处于剥蚀状态。晚远古代末期-早侏罗纪早期，保护区北部完达山-西锡霍特地槽褶皱系经过了几次海侵海退的旋回，在三叠纪到早侏罗纪完达山区断陷为深海槽，形成巨厚的硅质岩和泥质岩。在燕山晚期及海西期侵入了花岗岩、黑云母花岗岩、斜长花岗岩。中生代时期发生大的断裂沉陷，珍宝岛湿地国家级自然保护区始终处于沉降运动之中，出现了三叠系沉积，处于海陆相交互沉积的时期。第四系以来，又不断堆积河湖相松散的亚粘土和沙砾由于敦化密山岩石圈断裂经由本区北部完达山前地带，一小木河为界，将保护区分为平原和丘陵两部分。北部为完达山余脉，为丘陵地形，海拔在130~170m之间；组成物质为硅质岩、砾岩、凝灰质粉砂岩、板岩，起伏和缓。高为烧炭山，海拔为223.6m。低缓的山丘之间为较为宽广的幼沟谷地，谷底平坦常有泥炭沼泽或小叶章草甸发育。
小木河以南主要为地势低缓的冲积平原。平均海拔为60m左右，平均坡降约为1/80000。沿乌苏里江流向，呈现南高北低的态势。平原内中尺度地貌类型有河漫滩和一级阶地两种类型。
一级阶梯主要分布在虎头镇-小木河一线、北部丘陵南麓，方正公路沿线。阶段相对高度为10~15m，组成物质以中更新统的兴凯湖组和晚更新的别拉洪河组。在方虎公路南侧一级阶地分布广泛。此外，保护区内尚有部分残留的二级阶梯，主要分布在珍宝岛乡附近，为从北向南舌状延伸，组成物质为早更新统的冲积湖积层。
虎头镇附近有零星分布的孤山残丘，海拔80~130m之间，高在虎头镇西北侧，海拔为148m。丘陵岩性为太古代麻山群地层及麻山期侵入岩。
珍宝岛湿地国家级自然保护区位于穆棱-兴凯平原的局部微承浅水区，主要涵水层为细砂、中粗砂、沙砾石夹亚粘土。境内地下水埋藏较深，并有粘土层间隔，切断了与地表面水的联系，所以对土壤的形成影响很小。含水层厚度一般为40~80m，靠近东方红林业局一带为10~40m，地下水含水层为中细砂，沙砾，大部分地表覆盖有3m左右的亚粘土，形成微承压水，有的靠近河岸地段，砂层直接露出地面，形成潜水。含水层厚度为30~50m，北部丘陵区一般在30m左右，水位埋深，低洼地带2m左右，部分较高地区5m左右，北部低山丘陵30~50m，实测单井出水量70~170T/h。水质以重碳酸钠型为主，矿化度均小于0.5g/L，大部分地区小于0.2g/L，是地矿化淡水，水质良好。
珍宝岛湿地国家级自然保护区总面积为44364公顷，其中核心区面积为18378公顷，缓冲区面积为11263公顷，实验区面积为14723公顷。
南从乌苏里江起，沿乌苏里江向东北至三小公路与乌苏里江交汇处，再沿三小公路向西北至虎饶公路，沿虎饶公路至西南岔公路，沿西南岔公路至保护区北端，再沿西北河至阿北公路，沿阿北公路、虎饶公路、方虎公路至月牙检查站，沿检查站东大车道至穆棱河与乌苏里江交汇处，沿乌苏里江向东至保护区南端止。
黑龙江珍宝岛湿地国家级自然保护区位于黑龙省穆棱—兴凯低平原东南侧，乌苏里江冲积低平原，是三江平原的重要组成部分。自然保护区去内共有脊椎动物289种，隶属于34目82科。其中鸟类物种数多，计171种，隶属于16目43科，占保护区动物种数的58.9%；其次为鱼形类，计61种，隶属于2纲7目14科，占保护区动物种数的21.9%；兽类41种，隶属于6目15科，占保护区动物种数的14.6%；两栖类爬行类少，各为8种，占保护区动物种数的2.8%.
珍宝岛自然保护区内有国家级重点保护动物30种。保护区内有国家一级保护动物6种，其中鸟类4种，即丹顶鹤（Grus japonesis)、东方白鹳（Ciconia boyciana）、金雕（Aguila chrysaetoskamtschatiea）、白尾海雕（Halaeetus albicilla）。兽类2种，分别是东北虎（Panthera tigris Altaica）、原麝（Moschus moschiferus）。国家二级保护动物24种，其中鸟类20种。
根据中国动物地理区划，珍宝岛保护区鸟类区系属古北界、东北区，长白山亚区。同时由于保护区处东南山地省的边缘，因此具有东南山地省的区系特征。拒不完全统计，保护区共有鸟类171种，其中古北界种111种，占保护区鸟类种数的64.8%，广布种59种，占保护区鸟类种数的34.5%，东洋界种仅1种。
珍宝岛湿地国家级自然保护区地处三江平原的乌苏里江滨，地势低平，河流江叉繁多，在江心岛和滩地上分布有大面积湿地，约占保护区总面积的66%，在保护区的北部丘陵岗地和江心岛分布有夏绿林，据初步调查黑龙江珍宝岛湿地国家级自然保护区的植物种类有87科221属393种。其中高等植物有：蕨类植物3科6属9种；裸子植物1科2属3种；被子植物有83科213属381种。
保护区内有国家级保护物种有6种：水曲柳（Frazinus mandshurica）、黄檗（Phellodenron amurenes）、胡桃楸（Juglans mandshurica）、刺五加（Acadntopanax sessiliflorus）、紫椴（Tilia amurensis）和野大豆（Glycine soja）
在被子植物中以菊科多，37种；其次为毛茛科32种；再次为蓼科23种，禾本科和莎草科各22种和蔷薇科21种，唇形科和豆科各13种。其余科均在10种以下。10种以下的植物中百合科有8种，桔梗科，堇菜科各7种，虎耳草科、石竹科、十字花科、桦木科、报春花科各6种，紫草科、旋花科、杨柳科、牤牛儿苗科、玄参科、藜科各有5种，其余科的植物种均小于5种植物。
珍宝岛湿地国家级自然保护区将建成为一个集自然保护、科学研究、宣传教育、水源涵养、生态旅游和多种经营为一体的多功能自然保护区，最终达到湿地资源的可持续利用。
珍宝岛自然保护区管理局建管并重，实施了保护区湿地恢复项目工程，投入资金521万元新建了动物救护站、湿地检测站等基础设施。严格控制土地使用，严打非法毁林毁湿、开采资源、放牧捕捞等行为。
经过努力，珍宝岛湿地生态环境得到了有效保护，保护区内有东北虎、棕熊、丹顶鹤、东方白鹳等诸多国家珍稀保护动物和“三花五罗”等名贵淡水鱼，有国家珍稀濒危植物胡桃楸、水曲柳、乌苏里狐尾藻等植物。
乌苏里江是中俄界江，以其美丽、富饶、纯净、无污染而闻名天下。江水波光潋滟，岛屿星罗棋布，江鸥翔集，柳绿烟霞，俄罗斯风光尽收眼底。乌苏里江盛产“三花五罗”等名贵淡水鱼，更以特产“大马哈鱼”而驰名中外。
乌苏里江长度890公里，流域面积187000平方米，流量2000立方米/秒。乌苏里江是黑龙江的一条主要支流，其上游由乌拉河与道比河汇合而成，向东北流至伯力一带急转折向西南，注入黑龙江。乌苏里江全长八百八十公里，流域面积几近十九万平方公里。自其支流松阿察河注入之处起，至江水与黑龙江汇合之处止，是中国与俄罗斯的界河。
珍宝岛是乌苏里江上有个约长二公里的小岛，名为珍宝岛，位于北纬46.5度、东经134度附近。原是从中国方面伸入乌苏里江的半岛，经过长期的水流冲击，才成为一个小岛。珍宝岛面积仅0.74平方公里小岛，却因20世纪60年代末的珍宝岛事件令世人瞩目。珍宝岛是守岛战士的家和爱国主义教育基地，也成为虎林的一处著名旅游胜地。
虎头要塞是黑龙江著名旅游景点。虎头要塞位于虎林市境内，国家AAAA级旅游景区。占地面积约29.3公顷，是国内现存同类遗址中地上、地下工事为复杂、规模大、设施全、保存完好的一处反映“爱国主义、国际主义、革命英雄主义”的旅游景区。
1939年，德、意、日法西斯轴心国形成。9月1日德军进攻波兰，英、法等国被迫宣战，第二次世界大战全面爆发。先后有61个国家和地区、20亿以上人口卷入了这场战争。
1945年5月红军攻入德国首都柏林，8月15日日本天皇宣布投降，法西斯阵营由此灭忙。由于固守虎头要塞的日军仍作垂死挣扎，直至26日苏军攻克要塞，二战最终谢幕，虎头因此成为第二次世界大战终结地。
该纪念园区建设以战争为主题，按照二战第一枪打响，到虎头最后一枪结束，用景墙、雕塑、石刻向人们展示了二战主要事件和著名的战役，概括地反映了二战整个过程。园区风貌大气、凝重，发人深省，彰显了多国共同抗击法西斯的磅礴气势，讴歌世界和平。
珍宝岛湿地国家级自然保护区内湿地的典型性、多样性、景观结构的独特复杂性和稀有性，在地理学、生物学、生态学、医学等领域均具有较高的科学研究价值。美国环境基金会首席经济师杜丹德博士，中国人民大学马中教授，曾为全球环境基金项目（GEF）来保护区考察，对本区的湿地的典型性与独特性给予了较高的评价。
珍宝岛湿地国家级自然保护区主要以沼泽湿地和岛状林为主，大面积的淡水湿地集中连片，是同纬度地区保护原始区域具有代表性和类型为典型的沼泽生态系统。湿地大部分保持原始状态，已成为亚洲北部水禽南迁的必经之地和东北亚地区水禽繁殖中心。这些湿地主要分布于乌苏里江中游右岸的江漫滩上，在调节江河径流、保护全流域的生态安全方面具有重要意义。保护区内容纳了三江平原地区所有的生物物种，其中包括大量濒危的稀有物种，是一个丰富的物质资源基因库。
