1982年经甘肃省人民政府批准，成立“天水地区头二三滩自然保护区”。
2006年经国务院办公厅批准晋升为国家级自然保护区，更名为“甘肃甘肃小陇山国家级自然保护区”。
甘肃甘肃小陇山国家级自然保护区位于中秦岭的西端，地理坐标为东经106°13′10″～106°33′06″、北纬33°35′12″～33°45′11″。保护区东西长31.5公里，南北宽18.5公里。
甘肃甘肃小陇山国家级自然保护区属于典型的熔岩地貌，局部地段发育大面积喀斯特地貌。山顶发育的喀斯特漏斗，形状仿佛农家使用的大锅，当地人谓之“锅坑”，小的直径500米左右，大的直径2000米，彼此连绵成群。
甘肃小陇山国家级自然保护区有嘉陵江及其支流东沟河、瓦窑沟、云凫河、陈家沟等，水系呈辐散状分布，最后向西和西北汇集，注入嘉陵江。其中嘉陵江是保护区大的过境河流，干流流经保护区西缘。年径流总量8.4×107立方米，年平均流量51.68立方米/秒，最大流量9800立方米/秒(1981年)，流域平均径流深297.6毫米。
甘肃小陇山国家级自然保护区主要保护对象是暖温带—亚热带过渡地区原始森林生态系统，珍稀濒危物种，生物多样性和特殊的自然地理景观。
甘肃小陇山国家级自然保护区有野生动物鱼类3目5科5亚科15属17种，两栖类2目6科6属11种，爬行动物2目6科17属24种，鸟类16目39科199种，哺乳类7目20科66种。
甘肃小陇山国家级自然保护区共有鱼类17种，其中总东洋界鱼类3种，古北界鱼类4种，两界共有的鱼有10种。有两栖类11种，其中4种属东洋界，古北界2种，共有5种。有爬行类24种，其中东洋界种22种，纯古北界种没有，共有2种。有鸟类199种，广布种74种、古北界种69种和东洋界种56种。有66种哺乳类，其中古北界种有30种，东洋界种28种，两界共有的物种有8种。
甘肃小陇山国家级自然保护区共有国家一级保护物种5种，国家二级保护物种28种。其中国家二级两栖爬行动物1种；鸟类中有国家一级保护物种1种，即金雕；国家二级保护物种18种，即鸢 、苍鹰、雀鹰、松雀鹰、普通鵟、红隼、燕隼、红脚隼、红腹角雉、勺鸡、红腹锦鸡、灰鹤、红角鸮、雕鸮、领鸺鹠、斑头鸺鹠、短耳鸮、灰林鸮；保护区有国家一级保护哺乳类4种，为羚牛秦岭亚种、云豹、豹、林麝， 二级保护哺乳类有大灵猫、果子狸秦巴亚种、狼北部亚种、赤狐蒙新亚种、野猪川西亚种、林麝、小麂指名亚种、毛冠鹿指名亚种、羚牛秦岭亚种、鬣羚、斑羚等10种。 （以上数据截止2014年）
物种基本组成：保护区共有种子植物123科、561属、1258种（含种以下等级）。其中裸子植物6科12属18种；被子植物中的双子叶植物105科448属1057种，单子叶植物12科101属183种。
区系地理成分：保护区的植物地理成分复杂，具有中国所有的15个分布区类型，其中属于世界分布的有56个属，属于热带或以热带为中心分布的类型有128属、244种，分别占总数的22.9%、19.4%；属于温带性质的类型有376属、806种，分别占总数的67.2%、64.5%。显然北温带分布的属数、种数多，温带属性是保护区植物区系的基本特点。
从科属的分布型统计看，属于世界广布型的有34科56属202种，分别占自然保护区总的科属种的27.6%、10%和16.1%；属于热带分布型的有55科128属244种，分别占自然保护区总的科属种的44.7%、22.9%和19.5%；而属于温带分布型的有86科375属807种，分别占自然保护区总的科属种的69.9%、67d.4%。（以上数据截止2014年）
保护区总面积31938平方米，核心区面积10 256平方米，缓冲区面积10158平方米，实验区面积11524平方米。
云幈寺座落于云幈乡北端，占地约两亩，有大殿、经室、厢房、斋院和山门。大殿中供奉着如来佛、观世音菩萨等众神像，山门中面目狰狞的灵官塑像，山门上有一幅隶书对联，上联是“存心邪僻 任尔烧香无点益”，下联是“持身正大 见吾不拜有何妨”。
在观音峡峡谷左面的峭壁上，留有古栈道遗迹十余处，据说汉刘邦当年退出咸阳入汉中时，为向项羽表明自己无心夺中原而火烧栈道，烧的就是这条栈道。后来韩信明修栈道，暗渡陈仓，佯装修复的也是这条栈道。1949年7月，宝鸡解放后，战败的国民党胡宗南残部214师也是取此道南逃四川的。
